Yazar "Uçar, Füsun" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 17 / 17
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Afyon-Sandıklı yöresi nohut (Cicer arietinum L. ) kök nödüllerinden izole edilen Rhizobium bakterilerinin en etken suşlarının saptanması(Ege Üniversitesi, 1983) Uçar, Füsun; Öner, Mehmet[Abstarct Not Available]Öğe Beyaz peynirlerde bozeulmeye neden olan yarrowia Lipolytica ve Debaryomyces Hansenii'nin fenotipik ve genotipik identifikasyonu(Ege Üniversitesi, 2007) Öztürk Yalçın, H. Tansel; Uçar, FüsunD. hansenii, Y. lipolytica, identification, ITS-PCR.;D. hansenii, Y. lipolytica, identifikasyon, ITS-PCR.;Farklı beyaz peynirlerde bozulmaya neden olan 92 maya suşu izole edilmiş ve bu izolatların identifikasyonları Barnett ve ark.?na (2000) göre yapılmıştır. Tanılanan izolatların 8 genusa ait 13 farklı tür olduğu saptanmıştır. En yaygın olarak bulunan izolatlar Debaryomyces hansenii (%32,6), Kluyveromyces marxianus (%18,5) ve Yarrowia lipolytica (%17,4) olarak tanılanmıştır. Tanılanan diğer genuslar ise Pichia, Torulaspora, Candida, Williopsis, Galactomyces?dir. Fenotipik tanılamada en sık rastlanan bozulma etkeni türler olarak belirlenen D. hansenii ve Y. lipolytica türleri, 5,8 S ribozomal DNA? daki türe spesifik internal transcribed spacer (ITS) bölgesinin PCR amplifikasyonu (ITS-PCR) ile de genotipik olarak karakterize edilmiştir. Yapılan genotipik tanılama sonucunda, 15 Y. lipolytica straini ve 25 D. hansenii straini sırayla 360bp ve 640bp uzunluğunda karakteristik tek bir bant oluşturmuşlardır. Biyokimyasal ve fizyolojik karakteristiklere dayalı konvansiyonel metodlar kullanıldığında, tanılama uzun zaman almakta ve çoğunlukla yanlış sonuçlanabilmektedir. Bu çalışmadaki D. hansenii?nin 5 straini ile Y. lipolytica?nın bir straini?nin konvansiyonel metodlarla yanlış tanılanması yukarıda belirtilen tezi doğrulamaktadır. O nedenle ITS-PCR, konvansiyonel metodlara göre daha hızlı, güvenilir, tekrarlanabilir ve daha ekonomiktirÖğe Çeşitli kaynaklardan ekstraselüler lipaz üreten mayaların izolasyonu ve identifikasyonu(Ege Üniversitesi, 2000) Öztürk, Tansel; Uçar, FüsunLipases, yeasts, avtivity toward tribütrin;Lipases, yeasts, avtivity toward tribütyrin;Lipaz, maya, tribütirine karşı aktivite;Lipaz, maya, tribütirine karşı aktivite;Mandıra ürünleri ve bitkisel yağlardan toplanan 14 farklı örnekten 64 ekstraselüler lipaz üreten maya straini izole edilmiş ve bu strainlerin identifikasyonları Barnett ve ark.'na (1983) göre yapılmıştır. Bu izolatların Geotrichium, Torulopsis, Kluyveromyces, Hansenula, Candida, Yarrowia, Debaryomyces, Williopsis, Saccharomyces, Pichia ve Sporidiobolus genuslarını içeren 23 farklı tür olduğu belirlenmiştir. Bu izolatların ekstraselüler lipaz aktivitesi Tribütirin Agar yöntemi kullanılarak denenmiş ve en yüksek aktiviteyi sırasıyla Candida ernobii ve Yarrowia lipolytica olarak tanımlanan 39,11,10 numaralı izolatlar göstermiştir.Öğe Domates bitkisinde patojen olan Fusarıum oxysporum F.SP. lycopersici strainlerinin moleküler tanısı ve patojenite genlerinin araştırılması(Ege Üniversitesi, 2019) Uçar, Füsun; Uzgan, TanayDomates (Lycopersicon esculentum) dünyada en yaygın olarak üretilen bitkilerden biridir. Fusarium oxysporum f.sp lycopersici (FOL) ise domates bitkisinde vasküler solgunluğa sebep olabilen bir patojendir. Aynı vejetatif uyumluluk grubunda (VCG) olan strainlerin daha fazla genetik benzerliğe sahip oldukları bilinmektedir. Ek olarak, FOL'ün bilinen üç farklı fizyolojik patojenite ırkı, ırk spesifik gen bölgeleri kullanılarak belirlenmiştir. Bu tezin önemli hedeflerinden biri de patojenite ırkları ile VCG'ler arasındaki bağlantıyı ve benzerliği ortaya çıkarmaktır. Üç farklı tarla ziyaret edilerek, totalde yirmi farklı kısımdan altmış adet örnek toplandı. Fenotipik tanılama sonrasında, nitrat kullanmayan mutantlar (nit mutantları) klorat içeren minimal besiyerinde saptandılar. Nit mutantları saptandıktan sonra, dört farklı gruba ayrıldılar. Bu işlemden sonra, vejetatif uyumluluk veya uyumsuzluk testleri gerçekleştirildi. Örneklerin patojenite grupları PCR ve jel elektroforezi yöntemleri ile saptandı. Elde edilen sonuçlar doğrultusunda ırklar ve VCG'ler arasında bağlantı ve korelasyon saptanmıştır. Çalışma modifiye besiyerlerinin izolasyon başarısını arttırdığını da göstermektedir. Sonuçlar istatistiksel analiz için SPSS programı kullanılarak kategorik veriler için Fisher kesin olasılık testine tabi tutulmuştur.;Vejetatif uyumluluk, fusarium, nitrat kullanmayan mutantlar, patojenite ırkları, domates baygınlığı.;Vegetative compatibility, fusarium, nitrate non-utilizing mutants, pathogenicity races, tomatoes wilt.Öğe Ege Ünivesitesi Kimya Mühendisliği Bölümü'nde üretilen kozmetik ürünlerin mikrobiyolojik incelenmesi ve koruyucu maddelerin antimikrobiyal aktivitelerinin saptanması(Ege Üniversitesi, 1998) Özdemir (Kundakçı), Hayriye; Uçar, FüsunBu çalışmada E.Ü Kimya Mühendisliği Bölümü'nde üretilen 8 adet kozmetik ürün kullanılmıştır. Bunlar nemlendirici kremler olan Barla 44ı-ıı, Barla 16ı-ıı, Barla 6, el ve vücut losyonu olarak Barla 10, cilt temizleme sütü ve canlandırıcı tonik olarak kullanılan Barla 24'tür. Ürünlerin aerobik bakteri sayımı, küf-maya sayımı, ayrıca patojen mikroorganizmaların saptanmasına yönelik çalışmalar yapılmıştır. Kozmetik ürünlerde kullanılan bazı koruyucu maddelerin antimikrobiyal aktiviteleri incelenmiş ve MİK konsantrasyonları tespit edilmeye çalışılmıştır. Çalışmamızın sonucunda bir ürünün aerobik bakteri sayısı yönünden belirtilen limitleri aştığı görülmüştür. Ayrıca hiçbir üründe küfe rastlanmamış ve patojen maya izole edilmemiştir. Sadece Barla 16'nın ilk örneğinde S aureus izole edilmiştir. Tüm koruyucuların farklı antimikrobiyal etkilere ve MİK konsantrasyonlarına sahip olduğu görülmüştür. Anahtar Kelimeler: Kozmetik, Koruyucu, antimikrobiyal aktivite.Öğe Farklı çevresel koşullardan izole edilen askomisetik maya genus ve türlerinin identifikasyonu ve bu tanılanan izolatların nikel ve bakır ağır metallerine direncinin saptanması(Ege Üniversitesi, 2010) Güngör, Orçun; Uçar, FüsunMayalar, ağır metal direnci, identifikasyon, ITS-PCR.;Yeasts, heavy metal resistance, identification, ITS-PCR.Öğe Ham petrol ile yapısındaki aromatik hidrokarbonların parçalanmasında rol alan mayaların izolasyonu ve identifikasyonu(Ege Üniversitesi, 2005) Türkmen, Ebru; Uçar, Füsun[Abstract Not Available]Öğe İzmir bölgesinde gözlenen idrar yolu enfeksiyonlarına neden olan üropatojenik E.coli'lerdeki P- Fimbria'nın üç farklı G-adezininin moleküler biyolojik yöntemler ile saptanması(Ege Üniversitesi, 2011) Giray, Betül; Uçar, FüsunGünümüzde üriner sistem enfeksiyonları en sık rastlanan enfeksiyon hastalıklarının başında yer almaktadır ve bu enfeksiyonlarda en yaygın görülen patojen Escherichia coli' dir. Hastalığın patojenitesinde bakterinin üriner sistemin epitel hücrelerine tutunma özelliği önemli derecede rol oynamaktadır. Bu özellik bakterinin adezin olarak adlandırılan proteinleri ile gerçekleşir ve bu proteinler genellikle fimbria ile ilişkilidir.Escherichia coli, bu fimbrialar aracılığı ile üretradan mesaneye ve bazen böbreklere tırmanarak akut piyelonefrite, hatta kan dolaşımına geçerek sepsise yol açabilmekte ve kalıcı hasarlara neden olabilmektedir. Hastalığın tedavisi için erken tanı ve doğru ilaç seçimi son derece önemlidir. Rutin tanıda kullanılan yöntemler üropatojenik Escherichia coli' yi ayırt edememektedir. Bu nedenle uygulanan tedaviler başarısızlıkla sonuçlanabilmektedir. Özellikle son yıllarda moleküler biyolojinin hızlı bir şekilde gelişmesiyle üropatojenik E.coli' leri, strain spesifik genler aracılığıyla saptamak mümkün olabilmektedir. Bu tür moleküler çalışmalar rutin tanıda yer aldığı sürece hastalığın teşhisi çok kısa sürede yapılabilecek ve erken tedaviye başlanabilecektir. Aynı zamanda, giderek artan antibiyotik direncinden dolayı, son üç yılda üropatojenik E.coli' ler için yeni ilaç ve ağı geliştirme yöntemleri araştırılmaya başlanmış ve proteomik çalışmalar ile çok değişik ve güzel sonuçlar elde edilmiştir. Bu yöndeki çalışmalar istenildiği gibi sonuçlandığında ve antibiyotikler dışında yeni bir ilaç geliştirildiği takdirde, günümüzde rutin tanıda kullanılmakta olan konvansiyonel yöntemlere ihtiyaç duyulmayacağı, hızlı ve güvenilir sonuç veren moleküler yöntemlerin önem kazanacağı düşünülmektedir. Bu zamana kadar en uygun moleküler yöntemin geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. Bu nedenlerden dolayı, bu çalışmada akut sistit, akut piyelonefrit veya tekrarlayan E.coli enfeksiyonu ile önceden karakterize edilmiş 75E.coli izolatı uidA genine özgü primerler ve strain-spesifik primerler kullanılarak multipleks PCR ile identifiye edilmiştir. Daha sonra ise, izole edilen E.coli strainlerinin serotiplendirmeleri ve CLSI kriterlerine uygun olarak disk diffüzyon yöntemi ile antibiyogramları yapılmıştır.;Uropathogenic E.coli, Multiplex PCR, Pyelonephritis.;Üropatojenik E.coli, Multipleks PCR, Piyelonefrit.Öğe İzmir çevresindeki karanfil seralarından izole edilen Fusarium oxysporum strainlerinin moleküler identifikasyonu ve tiplendirilmesi(Ege Üniversitesi, 2019) Uçar, FüsunFusarium oxysporum tüm dünyada yaygın ve çok önemli solgunluk hastalığıdır. Çeşitli bitki türlerinde kök ve kök boğazı çürüklüğüne, iletim demetlerinde zararlanma sonucu solgunluğa neden olduğu bilinmektedir. Birçok Fusarium türü bitki iletim demetlerini tıkayarak yapraklarda sararmaya ve kök boğazını çürüterek toprak üzerine devrilmesine neden olmaktadır. Fenotipik yöntemlerin yetersiz kalması hastalığa karşı mücadelede yenilikçi yöntemlerin uygulanabilmesini engellemektedir. Bu çalışmada İzmir ve çevresinde bulunan farklı karanfil seralarından hasta bitki örneklerinden elde edilen izolatlar fenotipik ve genotipik yöntemlerle kesin olarak tanılanması hedeflenmiştir. İzmir çevresindeki karanfil seralarından yapılan izolasyonlarda 20 izolat elde edilmiştir. İzolasyonlar sırasında ilk olarak mikroskobi sonucunda hif ve spor gibi yapılar incelenerek fusarium genusuna ait olabilecek izolatlar belirlenmiştir. Morfolojik incelemeden sonra organizmaların dnaları izole edilerek ITS bölgesi PCR ile çoğaltılmıştır. Elde edilen fragmentler sanger yöntemiyle sekanslanmıştır. Elde edilen sekans verileri NCBI veri tabanında blast yapılarak identifikasyon sonuçlandırılmıştır. İdentifikasyon sonucunda elde edilen izolatların tamamının Fusarium oxysporum olduğu belirlenmiştir. Çalışma içerisinde ITS gen bölgesi alt tür bazında değerlendirmek için yeterli gelmemiştir.;Fusarium Oxysporum, Fungus, ITS, Karanfil, Patojen.;Fusarium Oxysporum, Fungus, ITS, Clove, Pathogen.Öğe İzmir ilindeki çeşitli kaynaklardan Aeromonas hydrophila' nın izolasyon, identifikasyon ve toksijenik özellikleri(2000) Uzel, Ataç; Uçar, FüsunA total of 43 samples (4 sea water, 5 water, 4 river water, 10 oyster and 10 fish samples) from Izmir were examined for the presence of Aeromonas hydrophila. Alkaline peptone Water (APW) for the environmental samples and Trypticase Soy Broth with Ampicillin and Toluidine Blue (TSBA) for the food samples were used for enrichment of the samples. in isolation, 5 different selective media were used: DNase Agar with Toluidine blue and Ampicillin (DNTA), Aeromonas Agar (AA), Rimler Shotts Agar (RSA), mA Agar and Aeromonas Mediums Base (AMB). Identification of the isolates was performed according to Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (1984) and 9 isolates were identified as A. hydrophila. the enterotoxin production of 9 isolates was investigated by the suckling mouse assay and 8 of the 9 isolates were found to be enterotoxigenic.Öğe İzmir ilindeki çeşitli kaynaklardan Aeromonas hydrophila'nın izolayonu, identifikasyonu ve toksikoloji testleri ile ilgili bir araştırma(Ege Üniversitesi, 1996) Uzel, Ataç; Uçar, FüsunBu araştırmada İzmir ilindeki toplam 43 örnekten aeromonas hydrophila'nın izolasyonu ve tanısı yapılarak elde edilen izolatların toksikolojik özellikleri araştırılmıştır. İncelenen 43 örneğin 14'ünü deniz suyu, 5'ini kuyu suyu, 4'ünü dere suyu, 10'unu midyeler ve 10'unu da çeşitli balık örnekleri oluşturmuştur. Örneklerin analizinde Alkaline Pepton Water (APW) ve Ampicillinli Trtpticase Soy Broth (TSBA)'ta Zenginleştirme yapıldıktan sonra, seçici besiyeri olan Aeromonas Medium Base(Ryan)'de izolasyon yapılmıştır. Elde edilen izolatların tanıları Bergey's Manual of Determinetive Bacteriology(1984)'e göre yapılmıştır. Sonuç olarak toplam 43 örnekten izole edilen 9 izolat A.hydrophila olarak tanımlanmış ve enterotoksin üretimi yönünden "Suckling Mouse Assay" kullanılarak incelenen 9 A.hydrophila straininin 8 tanesinin enterotoksigenik olduğu bulunmuştur. Anahtar kelimeler: Aeromonas hydrophila, Aeromonas Medium Base, Suckling Mouse Assay.Öğe İzmir ilindeki çeşitli kaynaklardan Legionella pneumophila Serogrup 1 strainlerinin izolasyonu ve identifikasyonu(Ege Üniversitesi, 2002) Uçar, Füsun; Uzel, Ataç15 Haziran - 30 Eylül tarihleri arasında, İzmir'in 6 İlçesinde bulunan 24 turistik tesisten 15 günde bir olmak üzere 7'şer adet su numunesi alınmış ve toplam 168 örnek Legionella pneumophila serogroup 1 mevcudiyeti bakımından incelenmiştir. Otellerin sıcak su tanklarından veya sıcak su şebekelerinden alınan 1'er litrelik su numuneleri, 0,22æm'lik polikarbonat filtrelerle konsantre edilmiş ve izolasyon seçici BCYEÜ agar (GVPC) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. 168 numunenin 149 tanesinde tipik Legionella kolonileri saptanmış, elde edilen izolatların kültürel ve fenotipik özelliklerine göre 128 izolat muhtemel L. pneumophila olarak değerlendirilmiştir. 128 izolatın identifikasyonları, "Legionella Latex Test" (Oxoid) ve APPCR kullanılarak gerçekleştirilmiş ve 107 izolat L. pneumophila serogroup 1 olarak identifiye edilmiştir. İdentifikasyon sonuçlarına göre; 2 tesisten alınan örneklerde L. pneumophila serogroup 1'e rastlanmazken, 22 tesisin en az bir dönemde L. pneumophila serogroup 1 ile kolonize olduğu bulunmuştur. İncelenen tesislerin büyük bir bölümünde L. pneumophila serogrup 1'in bulunması (%91); çevresel örneklerde rutin taramalar yapılarak gerekli dekontaminasyon tedbirlerinin alınması gerektiğini göstermektedir.;Legionella pneumophila serogroup 1, Legionnaries' Diseases, Identification, APPCR.;Legionella pneumophila serogrup 1, Lejyoner Hastalığı, İdentifikasyon, AP-PCR.Öğe İzolasyon ve identifikasyonları yapılmış 23 alkolofilik Bacillus suşunun alkali proteaz aktivitelerinin saptanması(Ege Üniversitesi, 1998) Uçar, Füsun; Gezer, Tekin; Yaşa, İhsanİzolasyon ve identifikasyonları yapılmış 23 alkalofilik Bacillus suşunun alkali proteaz kapasiteleri araştırılmıştır. TEM-FA20 no.lu izolat en iyi alkali proteaz üreticisi olarak belirlenmiştir. 24 saatlik inkübasyondan sonra, izolatın iyi büyüdüğü ve %1 glukoz, %1 yeast ekstrakt içeren alkali ortamda pH 10'da, 30 oC'de ve 200 rpm'de maksimum alkali proteaz üretmiştir. Enzim % 75 (NH4)2SO4 çöktürmesi ile kısmen saflaştırılmıştır ve spesifik aktivite 2.5 kat artmıştır. Enzimin optimum sıcaklığı 5 mM Ca+2 yokluğunda ve varlığında 50 oC ve 60 oC'de oldukça yüksek termostabilite göstermiştir. Enzimin optimum pH - ının 50 mM glisin-NaCI-NaOH tamponunda pH 10.5'ta ve pH stabilitesinin Ph 5-12'de olduğu bulunmuştur. Enzim 5 mM PMSF ile tamamen inaktive olmuştur; bu enzimin bir serin proteaz olduğunu göstermiştir. Anahtar Kelimeler: Alkali proteaz, alkalofilik Bacillus Anahtar Kelimeler: Alkali proteaz, alkalofilik BacillusÖğe Mikrobiyolojik analiz laboratuvarı(Ege Üniversitesi, 2013) Karaboz, İsmail; Uçar, Füsun[Abstract Not Available]Öğe Mikrobiyolojik analiz laboratuvarı altyapı ek projesi(Ege Üniversitesi, 2013) Karaboz, İsmail; Uçar, Füsun[Abstract Not Available]Öğe Nozokomiyal infeksiyonlara neden olan bakterilerin hastane atmosferinden izolasyonu ve identifikasyonu üzerine bir çalışma(Ege Üniversitesi, 2008) Aydın Çakır, Nergüze; Uçar, FüsunNosocomial infection, hospital air, KNS, Staphylococcus aureus, Enterococcus ssp.;Nosocomial infection, hospital air, Staphylococcus aureus, KNS, Enterococcus spp.Öğe Reçellerde ozmofilik mayaların izolasyonu, sayımı ve identifikasyonu ile değişik parametrelerin (su aktivitesi, pH, temperatür) büyüme etkisi(Ege Üniversitesi, 1993) Güneri, İnci; Uçar, FüsunBu araştırmada, İzmir piyasasında satılan ve evlerde üretilen 8 değişik tip 80 meyve reçelinden ozmofilik ve ozmotolerant mayaların izolasyon ve identifikasyonları gerçekleştirilmiştir. Bu reçellerin 8'i ev yapımı ve 2'si ticari olan 10 adedinden toplam 19 izolat elde edilmiştir. Analize alınan reçellerin 70 tanesinde hiç üreme gözlenmemiştir. Bu 19 izolat 2 farklı besiyerine inoküle edilerek bu besiyerlerindeki canlı sayımları hesaplanmış ve identifikasyon besiyerlerine ekilerek biyokimyasal karakteristikleri saptanmıştır. Sonuçlar LODDER (1970) ve BARNETT ve ark.(1983)'ın kitapları kullanılarak değerlendirilmiştir. Araştırma sonucunda, 19 izolatın izolat numaraları 1-2-5-12-13-14 olan 6 tanesi Candida genusunun magnoliae türüne; izolat numaraları 3-19 olan 2 tanesi Debaryomyces genusunun hansenii türüne; izolat numarası 17 olan 1 tanesi aynı genusun polymorphus türüne; izolat numarası 16 olan 1 izolat Hanseniaspora genusunun osmophila türüne; izolat numaraları 8-10-15-18 olan 4 izolat Hansenula genusunun anomala, izolat numarası 11 olan 1 izolat aynı genusun subpelliculosa türüne; izolat numaraları 4-6-7 olan 3 izolat Zygosaccharomyces genusunun rouxii türüne ve 9 numaralı izolat ise aynı genusun bisporus türüne sokulmuştur. Ayrıca tanısı yapılan türlerin büyümesi üzerine aw temparatür, pH parametrelerinin etkisi incelenmiş ve sonuç olarak bu türlerin aw, temparatür ve pH değerleri saptanmıştır.
