İzmir çevresindeki karanfil seralarından izole edilen Fusarium oxysporum strainlerinin moleküler identifikasyonu ve tiplendirilmesi

Fusarium oxysporum tüm dünyada yaygın ve çok önemli solgunluk hastalığıdır. Çeşitli bitki türlerinde kök ve kök boğazı çürüklüğüne, iletim demetlerinde zararlanma sonucu solgunluğa neden olduğu bilinmektedir. Birçok Fusarium türü bitki iletim demetlerini tıkayarak yapraklarda sararmaya ve kök boğazını çürüterek toprak üzerine devrilmesine neden olmaktadır. Fenotipik yöntemlerin yetersiz kalması hastalığa karşı mücadelede yenilikçi yöntemlerin uygulanabilmesini engellemektedir. Bu çalışmada İzmir ve çevresinde bulunan farklı karanfil seralarından hasta bitki örneklerinden elde edilen izolatlar fenotipik ve genotipik yöntemlerle kesin olarak tanılanması hedeflenmiştir. İzmir çevresindeki karanfil seralarından yapılan izolasyonlarda 20 izolat elde edilmiştir. İzolasyonlar sırasında ilk olarak mikroskobi sonucunda hif ve spor gibi yapılar incelenerek fusarium genusuna ait olabilecek izolatlar belirlenmiştir. Morfolojik incelemeden sonra organizmaların dnaları izole edilerek ITS bölgesi PCR ile çoğaltılmıştır. Elde edilen fragmentler sanger yöntemiyle sekanslanmıştır. Elde edilen sekans verileri NCBI veri tabanında blast yapılarak identifikasyon sonuçlandırılmıştır. İdentifikasyon sonucunda elde edilen izolatların tamamının Fusarium oxysporum olduğu belirlenmiştir. Çalışma içerisinde ITS gen bölgesi alt tür bazında değerlendirmek için yeterli gelmemiştir.;Fusarium Oxysporum, Fungus, ITS, Karanfil, Patojen.;Fusarium Oxysporum, Fungus, ITS, Clove, Pathogen.