İzmir ili sokak kedilerinde polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile Bartonella türlerinin araştırılması ve Bartonella henselae saptanan örneklerin alttiplerinin multi lokus sekanslama yöntemi ile belirlenmesi/cHüseyin Can

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorCan, Hüseyin
dc.contributor.researcherDöşkaya, Aysu Değirmenci
dc.contributor.researcherKarakavuk, Muhammet
dc.contributor.researcherKöseoğlu, Ahmet Efe
dc.contributor.researcherAlak, Sedef Erkunt
dc.contributor.researcherGüvendi, Mervenur
dc.date.accessioned2024-12-07T17:14:32Z
dc.date.available2024-12-07T17:14:32Z
dc.date.issued2023
dc.departmentEge Üniversitesi
dc.descriptionFen Fakültesi, Moleküler Biyoloji A.B.D. Araştırma Projesi
dc.descriptionAraştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
dc.description.abstractBartonella spp. insanlarda zoonotik enfeksiyonlara neden olan vektör kaynaklı patojenlerdir. Sebep oldukları enfeksiyonlar arasında en iyi bilinenlerinden biri Bartonella henselae ve Bartonella clarridgeiae'nin neden olduğu kedi tırmığı hastalığıdır ve kediler bu iki bakteri için başlıca rezervuardır. Türkiye'nin İzmir ili çok sayıda sokak kedisine ev sahipliği yapmakla birlikte kedilerin Bartonella türlerini insanlara bulaştırmada bir rezervuar olarak potansiyel rolleri henüz araştırılmamıştır. Bu nedenle, bu projenin amacı İzmir'de yaşayan sokak kedilerinde Bartonella türlerinin yaygınlığını ve genetik çeşitliliğini araştırmaktır. Dahası, Bartonella henselae olarak tanımlanan örneklerin "multi-locus sequence typing" (MLST) yöntemi ile tiplendirilmesidir. Elde edilen sonuçlara göre, 122 örneğin Bartonellapozitif olduğu bulunmuş olup bu da %12, 05'lik bir moleküler prevalans anlamına gelmektedir (122/1012; %95 güven aralığı [CI] %10, 1-14, 2). Bartonella-pozitif örneklerden 100'ü (100/122; %81, 96) başarılı bir şekilde sekanslanmış ve B. henselae (45/100; %45), B. clarridgeiae (29/100; %29) ve B. koehlerae (26/100; %26) BLAST ve filogenetik analizler ile tanımlanmıştır. Yüksek genetik çeşitlilik 19 haplotip ile B. clarridgeiae'de tespit edilmiş, bunu B. henselae (14 haplotip) ve B. koehlerae (8 haplotip) izlemiştir. Analizi yapılabilen B. henselae izolatlarının MLST sonuçlarına göre ise B. henselae izolatlarının 40'ından (%90, 9) elde edilen allel profilleri mevcut allel profilleri ile uyumludur. Ancak, geriye kalan 4 B. henselae izolatından (%9, 1) elde edilen allel profilleri veri tabanı ile uyumsuzdur. Uyumlu allel profillerine sahip B. henselae izolatları arasında, MLST veri tabanına göre ST1, ST5, ST9, ST35 ve ST36 olmak üzere 5 farklı ST tanımlanmıştır. ST35 %29, 5 (13/44) prevalans oranıyla en yaygın ST olup bunu %22, 7 (10/44) prevalans oranıyla ST36 izlemiştir. Ayrıca, ST5 (%16, 7/44) ve ST9 (%18, 2, 8/44) da yaygın ST'ler arasındadır. ST1 prevalansı ise %4, 5 (2/44) olarak bulunmuştur. Uyumsuz allel profillerine sahip B. henselae izolatları için ST38 adı verilen yeni bir ST önerilmiştir.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11454/105941
dc.language.isotr
dc.publisherEge Üniversitesi
dc.relation.bap2022-TGA-23254 nolu proje
dc.relation.publicationcategoryAraştırma Projesien_US
dc.relation.uri26.04.2026 tarihinden itibaren tam metin olarak erişime açılacaktır.http://155.223.63.101/tez3/2022tga23254.pdf
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccess
dc.snmz20241209
dc.subject.classification375299
dc.titleİzmir ili sokak kedilerinde polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile Bartonella türlerinin araştırılması ve Bartonella henselae saptanan örneklerin alttiplerinin multi lokus sekanslama yöntemi ile belirlenmesi/cHüseyin Can
dc.typeProject

Dosyalar

Koleksiyon

Araştırma Projeleri Koleksiyonu