İzmir ili sokak kedilerinde polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile Bartonella türlerinin araştırılması ve Bartonella henselae saptanan örneklerin alttiplerinin multi lokus sekanslama yöntemi ile belirlenmesi/cHüseyin Can
Küçük Resim Yok
Tarih
2023
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
Bartonella spp. insanlarda zoonotik enfeksiyonlara neden olan vektör kaynaklı patojenlerdir. Sebep oldukları enfeksiyonlar arasında en iyi bilinenlerinden biri Bartonella henselae ve Bartonella clarridgeiae'nin neden olduğu kedi tırmığı hastalığıdır ve kediler bu iki bakteri için başlıca rezervuardır. Türkiye'nin İzmir ili çok sayıda sokak kedisine ev sahipliği yapmakla birlikte kedilerin Bartonella türlerini insanlara bulaştırmada bir rezervuar olarak potansiyel rolleri henüz araştırılmamıştır. Bu nedenle, bu projenin amacı İzmir'de yaşayan sokak kedilerinde Bartonella türlerinin yaygınlığını ve genetik çeşitliliğini araştırmaktır. Dahası, Bartonella henselae olarak tanımlanan örneklerin "multi-locus sequence typing" (MLST) yöntemi ile tiplendirilmesidir. Elde edilen sonuçlara göre, 122 örneğin Bartonellapozitif olduğu bulunmuş olup bu da %12, 05'lik bir moleküler prevalans anlamına gelmektedir (122/1012; %95 güven aralığı [CI] %10, 1-14, 2). Bartonella-pozitif örneklerden 100'ü (100/122; %81, 96) başarılı bir şekilde sekanslanmış ve B. henselae (45/100; %45), B. clarridgeiae (29/100; %29) ve B. koehlerae (26/100; %26) BLAST ve filogenetik analizler ile tanımlanmıştır. Yüksek genetik çeşitlilik 19 haplotip ile B. clarridgeiae'de tespit edilmiş, bunu B. henselae (14 haplotip) ve B. koehlerae (8 haplotip) izlemiştir. Analizi yapılabilen B. henselae izolatlarının MLST sonuçlarına göre ise B. henselae izolatlarının 40'ından (%90, 9) elde edilen allel profilleri mevcut allel profilleri ile uyumludur. Ancak, geriye kalan 4 B. henselae izolatından (%9, 1) elde edilen allel profilleri veri tabanı ile uyumsuzdur. Uyumlu allel profillerine sahip B. henselae izolatları arasında, MLST veri tabanına göre ST1, ST5, ST9, ST35 ve ST36 olmak üzere 5 farklı ST tanımlanmıştır. ST35 %29, 5 (13/44) prevalans oranıyla en yaygın ST olup bunu %22, 7 (10/44) prevalans oranıyla ST36 izlemiştir. Ayrıca, ST5 (%16, 7/44) ve ST9 (%18, 2, 8/44) da yaygın ST'ler arasındadır. ST1 prevalansı ise %4, 5 (2/44) olarak bulunmuştur. Uyumsuz allel profillerine sahip B. henselae izolatları için ST38 adı verilen yeni bir ST önerilmiştir.
Açıklama
Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
