Akciğer kanserli hastalarda periferik kandan cfDNA'nın metilasyon değişikliklerinin dijital PCR ile incelenmesi

Amaç: Akciğer kanseri, dünya genelinde en sık görülen ve her iki cinsiyette de en sık ölüme sebep olan malignitedir. En sık sebebi sigara dumanı olan akciğer kanserinin erken tanısında, sigara içenlerde düşük doz bilgisayarlı tomografi ile tarama önerilmiştir. Bu taramanın yanlış tanı, maliyet, zaman kaybı gibi dezavantajları nedeniyle akciğer kanserinin erken tanısında non invaziv, sensitif biyomarkerların kullanılmasına ihtiyaç duyulmuştur. Bu çalışmada, ileri evre-küçük hücre dışı (non-small cell) akciğer kanseri tanısı konulmuş hastaların plazmasından elde edilen cfDNA'da (cell-free DNA) literatür taraması ile belirlenmiş akciğer kanseri ile ilişkisi bilinen 6 gene ait (RASSF1A, p16, SHOX2, RAR?2, APC, DAPK1) droplet dijital PCR (ddPCR) ölçümü ile saptanan metilasyon değişikliklerinin sağlıklı kişilerdeki değerleri ile karşılaştırarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya alınan 10 hasta ve 10 kontrolün periferik kan plazma örneklerinden cfDNA elde edildi. Literatür taraması ile 6 hedef gen promotor bölgesi belirlendi. cfDNA'da hedef gen bölgelerinin bisülfit dönüşümü sonrasında ddPCR ile metilasyon analizi yapıldı. Çıkan sonuçlar istatistiksel olarak analiz edildi. Bulgular: Çalışmada DAPK1 geninin promotor bölgesindeki metilasyon seviyelerinde, hasta ve kontrol grubu arasında anlamlı farklılık saptanmıştır (p<0, 05). Çalışmaya alınan 10 hastanın 8'inde DAPK1 geninde anlamlı metilasyon yüksekliği saptanmıştır. DAPK1 genindeki hipermetilasyon literatür ile uyumlu bulunmuştur. Sonuç: Çalışmamız ddPCR ile akciğer kanserinde cfDNA'dan metilasyon analizi yapan ülkemizdeki öncü çalışmalardan biri olmuştur. Küçük hücre dışı akciğer kanserinde DAPK1 geninde hipermetilasyon saptanması ile literatüre katkıda bulunmuştur. Çalışmamız, bu alanda daha fazla sayıda hastalarla yapılacak sonraki çalışmalar için ön çalışma niteliğindedir.;Küçük hücre dışı akciğer kanseri; cfDNA; DAPK1; ddPCR.;Non-small cell lung cancer; cfDNA; DAPK1; ddPCR.