Türkiye'de izole edilen L. tropica suşlarının ''Multilocus Microsatellit Typing'' (MLMT) yöntemi ile epidemiyolojik analizi
Küçük Resim Yok
Tarih
2016
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
Cutaneous Leishmaniasis, Leishmania tropica, MLMT, Epidemiology, Turkey.;Şark Çıbanı, Leishmania tropica, MLMT, Epidemiyoloji, Türkiye.;Türkiye, Asya ve Avrupa arasında bağlantı noktası olması ve yedi farklı coğrafi bölge içermesi nedeniyle vektörlerle bulaşan enfeksiyon hastalıklarının epidemiyolojisi açısından önemli bir coğrafi konuma sahiptir. Klinik olarak kutanöz, visseral ve mukokutanöz şeklinde ayrılan leishmaniasis, Dünya'nın en önemli 6 tropik hastalığı arasında yer almaktadır. Leishmaniasis etkeni Leishmania cinsinde yer alan protozoon parazitlerdir. Leishmaniasis etken parazitin türüne bağlı olarak antroponotik ve zoonotik tipte görülmektedir. Türkiye'de Antroponotik Kutanöz Leishmaniasis (AKL) başta Güneydoğu Anadolu Bölgesi olmak üzere, Batı Anadolu ve Akdeniz Bölgesi'nin doğusunda yaygın olarak bildirilmekte ve etken olarak da sıklıkla genetik açıdan oldukça heterojen olduğu bilinen Leishmania tropica saptanmaktadır. Türkiye'de leishmaniasis modern moleküler yöntemlerle henüz yeteri kadar çalışılmamıştır ve hastalığın endemik olduğu diğer ülkelerle karşılaştırıldığında bilgi konusunda önemli eksiklikler bulunmaktadır. Leishmaniasis epidemiyolojisinde karşılaşılan problemlerin ve değişikliklerin ortaya çıkarılmasında, yaygın olarak kullanılan "microsatellit marker-lar parazit farklılaşmasını izlemek açısından önemlidir. Bu nedenle Türkiye'nin çeşitli illerinden izole edilmiş toplam 33 izolat ve Türkiye'de bulunan Suriyeli mültecilerden izole edilmiş 5 adet izolat çalışma kapsamındaki 12 özgül mikrosatellite markır kullanılarak moleküler yapısı bakımından incelenmiştir. Elde edilen spesifik sinyaller kullanılarak popülasyon içi ve arası farklılıklar, kısa tekrarların belirlenmesi ile ortaya konmuştur. Farklı genetik popülasyonların tanımlaması ile Ege ve Güneydoğu Türkiye suşları arasındaki belirgin farklılık ortaya konulmuştur. Bayesian Cluster yöntemi kullanılarak yapılan STRUCTURE analizi sonrasında Şanlıurfa kökenli izolatlann, Aydın ve Manisa kökenli izolatlardan tamamen farklı bir genetik yapıda olduğu belirlenmiştir. Çalışma kapsamındaki Aydın kökenli izolatların LIST7010 bölgesine sahip olmadığı gözlenmiş ve bunun coğrafi engel sonucu ortaya çıkmış bir farklılaşma olduğu tahmin edilmektedir. Bu farklılık küçük ölçekte Aydın, Manisa ve Şanlıurfa izolatlarından ayrılmasına sebep olmakla birlikte ayrı bir sub-popülasyon yapısını ortaya koymaktadır. Çalışma kapsamında bulunan visseral leishmaniasis hastasından izole edilmiş Manisa kökenli izolat ise diğer Aydın kökenli izolatlardan hiçbir markır açısından farklılık göstermemektedir. Bu çalışma sonrası elde edilen veriler suşların genetik varyasyonlarının ve popülasyon yapısının ortaya konmasında fayda sağlayacaktır. İzolatlar arasındaki gen akışının ve popülasyon yapılarının belirlenmesi hastalığın coğrafi dağılımı ve epidemiyolojik çalışmalar için önemli veriler sunmaktadır.
Açıklama
Araştırmacılar; Emin Karaca, Hüseyin Onay, Ahmet Özbilgin, Mehmet Karakuş, Samiye Demir
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2016
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2016
