Anaplastik beyin tümörlerinde baskılayıcı element 1 susturucu transkripsiyon faktörü ve baskılayıcı element 1 susturucu transkripsiyon kofaktörü genlerinin araştırılması
Yükleniyor...
Tarih
2010
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Bu çalışmada, merkezi sinir sistemi tümörlerinin gelişiminde transkripsiyon faktörü olan "Baskılayıcı Element 1 Susturucu Transkripsiyon Faktörü" (REST) ve onun ortak baskılayıcısı "Baskılayıcı Element 1 Susturucu Transkripsiyon Kofaktörü" (CoREST)' nün aktivasyonlarının, Synapsin I geninin promotor bölgesindeki nicelik bakımından yansımalarının kromatin immunopresipitasyon (ChIP) yöntemi ile belirlenmesi ve kanser fenotipi ile REST ve CoREST gen ekspresyonu arasındaki ilişkinin belirlenmesi amaçlanmıştır Ege Üniversitesi Nöroşirurji Anabilim Dalı{nda beyin tümörü tanısı almış 49 olguya (11 olgu Diffüz Astrositom, 8 olgu Anaplastik Oligodendrogliom ve 30 olgu Glioblastom) ait rezeke edilen tümör dokusu örnekleri ile eksplant hücre kültürü yapılmıştır. Kültürde çoğalan kanser hücrelerinden DNA, total RNA ve protein izolasyonları yapılmıştır. Gen ekspresyonları QRT-PCR, gen kopya sayıları ve ChIP analizleri Q-PCR ile gerçekleştirilmiştir. Ortalama REST gen ekspresyonu oranları Diffüz Astrositom, Anaplastik Oligodendrogliom ve Glioblastom gruplarında benzer olarak bulunurken, REST ekspresyonu medyan değerinin altında olan olguların yüzdesi Grade II' de % 27, III' te % 50 ve IV' te % 60 olarak belirlenmiştir. CoREST ekspresyonu ise Glioblastom grubundaki olguların % 93'ünde düşük olarak saptanmıştır. Anaplastik Oligodendrogliom ve Glioblastom'lu olguların % 25'inde Sinapsin I genin eksprese olmadığı tespit edilmiş olup, bu bulgu ilk kez çalışmamızda gösterilmiştir. ChIP analizi ile elde edilen REST kopya sayısı ile Sinapsin I gen ekspresyon oranları karşılaştırıldığında, Anaplastik Oligodendrogliom grubunda % 30 oranında bir korelasyon saptanmıştır. Bu bulgu REST' in Sinapsin I gen ekspresyonu baskılamasından ziyade regüle ettiği şeklinde değerlendirilmiştir. Sonuç olarak, REST, CoREST ve Sinapsin I' in gen ekspresyonları, gen kopya sayıları kromatin immunopresipitasyon kantitatif analiz sonuçlarının, Diffüz Astrositom, Anaplastik Oligodentrogliom ve Glioblastom gibi beyin tümörü fenotiplerini belirgin bir şekilde tanımlayabilmekte yardımcı olacağı ortaya konmuştur.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
REST, CoREST, Sinapsin I, ChIP., REST, CoREST, Synapsin I, ChIP., Tıbbi Biyoloji A.B.D.
