Balıkesir/Antandros Antik Kenti Kazısı Toprak Örneklerinin Metagenomik Analizi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorYılmaz, Alper
dc.contributor.authorPolat, Gürcan
dc.contributor.authorBal, Dilan
dc.contributor.authorBalcı, Berceste
dc.contributor.authorArıcan, Ercan
dc.date.accessioned2023-01-12T20:29:19Z
dc.date.available2023-01-12T20:29:19Z
dc.date.issued2022
dc.departmentN/A/Departmenten_US
dc.description.abstractBugüne kadar, biyosferde bulunan mikroorganizmaların çok azı kültürleme metoduyla tespit ya da teşhis edilebilmiştir. Kültürlenmemiş ya da kültürlenemeyen mikroorganizmalar ise, mikrobiyal çeşitliliğin büyük bir bölümünü oluşturmaktadır. Metagenomik analiz, kültürleme yapılmaksızın, çevreden direkt alınan örneklerin DNA izolasyonu sonrasında elde edilen mikroorganizmaların tür tayininin yapılmasına, genetik çeşitliliğinin, popülasyon yapısının ve bu mikroorganizmaların insan yaşantısını da etkileyen ekolojik rollerinin anlaşılmasına olanak vermektedir. Metagenomik; ilaç, biyoyakıt, biyoteknoloji, tarım, ekoloji gibi birçok farklı çalışma alanında yardımcı disiplin olarak önemli rol oynamaktadır. Paleomikrobiyoloji çalışmalarında da son yıllarda sıkça kullanılmaya başlanan metagenomik, insanlık tarihindeki mikrobiyal evrim araştırmalarına katkı sunar ve bize geçmiş zamanların mikro ekosistemini anlama perspektifi verir. Bu çalışmada, Balıkesir/Antandros Antik Kenti nekropolünden kültürleme yapılmaksızın direkt alınan toprak örneklerindeki mikroorganizmaların DNA izolasyonu yapıldı ve sonrasında 16S rRNA genlerinin V3-V4 bölgeleri PZR yöntemi ile çoğaltıldı. Çoğaltılan bölgeler Illumina MiSeq sistemi ile dizilendi. Elde edilen dizilerin metagenomik analizi QIIME 1.9.1 kullanılarak yapıldı ve mikrobiyal çeşitlilik belirlendi.en_US
dc.identifier.doi10.19113/sdufenbed.700604
dc.identifier.endpage12en_US
dc.identifier.issn1308-6529
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.trdizinid512927en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.19113/sdufenbed.700604
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/512927
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11454/80437
dc.identifier.volume26en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofSüleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectmetagenomiken_US
dc.subjectmikroorganizmaen_US
dc.subjecttopraken_US
dc.subject16S rRNAen_US
dc.titleBalıkesir/Antandros Antik Kenti Kazısı Toprak Örneklerinin Metagenomik Analizien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu