Ege bölgesindeki ürosepsis etkeni Escherichia coli Strain'lerinin genotipik analizi

Escherichia coli, MLST, PFGE, Virulence, Phylogenetic.;Escherichia coli, MLST, PFGE, Virülens, Filogenetik.;Toplum kaynaklı sepsislerin çoğu üriner sistem kaynaklı (ürosepsis) sepsislerdir. Üriner sistem enfeksiyonlarının %90'da ise en sık görülen organizma Escherichia coli'dir. Gastrointestinal sistem dışında Escherichia coli strainleri sahip oldukları virülens faktörleri ve yer aldıkları filogenetik grupları ile diyarejenik ve kommensal Escherichia coli strainlerinden farklıdırlar ve Ekstraintestinal patojenik Escherichia coli (ExPEC) olarak adlandırılırlar. ExPEC suşlarının bu virülens faktörler ile üriner sisteme kolonize olabilmekte ve konukçu savunmasının üstesinden gelerek sepsis gibi ciddi enfeksiyonlara yol açabilmektedir. Ancak ExPEC suşlarının belirli patotiplerinin yayılma ve hastalığa neden olma potansiyeli tam olarak anlaşılmamıştır. Ülkemiz de ise bu konuyla ilgili çalışmaların çoğu antibiyotik dirençliliği ile ilgilidir. Bu bakterilerin hastalık etkeni olmasındaki nedenlerin anlaşılması ancak bu organizmaların suş düzeyinde çalışılması ve virülens faktörleri göz önüne alınarak mümkün olacaktır. Bu nedenle bu projede suşların genotipik olarak karakterize edilmesi ve filogenetik ilişkilerinin saptanması; ürosepsis hastalarında bir virülens faktör olarak bulunabilen papG geninin varlığının araştırılması ve bunun antibiyogram duyarlılık sonuçları ile karşılaştırılması amaçlanmıştır.