Kan kültüründe bakterilerin hızlı tanısı ve duyarlılıklarının saptanması
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2019
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Amaç: Kan dolaşımı enfeksiyonu olan hastalardan alınan kan kültüründen bakterilerin hızlı bir şekilde tanımlanması ve erken dönemde uygun antimikrobiyal tedavi başlanması; sepsis morbidite ve mortalitesinde azalmaya neden olduğundan oldukça önemlidir. Bu çalışmanın amacı pozitif üreme sinyali veren kan kültürü şişelerinden sepsis etkenlerinin doğrudan MALDI-TOF MS ile hızlıca tanımlanması ve aynı gün içerisinde otomatize bir sistem ile antibiyotik duyarlılık testinin yapılması için "in-house" bir yöntemin uygulanması ve değerlendirilmesidir. Gereç ve Yöntem: Haziran- Eylül 2018 tarihleri arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde takip edilen hastalardan alınan ve pozitif sinyal veren 80 adet kan kültürü şişesi çalışmaya alındı. Rutin işleyişe uygun olarak örneklerden Gram boyalı preparat hazırlandı ve katı besiyerlerine subkültür yapıldı. Enkübasyon sonucunda oluşan koloniler MALDI-TOF MS sistemi ile tür düzeyinde tanımlandı ve otomatize duyarlılık sistemi ile etkenin antibiyotik duyarlılık testleri çalışıldı. Diğer bir yanda bu rutin laboratuvar işleyişiyle eş zamanlı olarak hızlı tanımlama ve antibiyogram için "in-house" yeni yöntem çalışıldı. Bu yeni yöntemde pozitif kan kültür şişelerinden alınan örneklere kademeli santrifüj ve yıkama işlemi uygulanarak bakteri çökeltisi elde edildi. Elde edilen bu çökeltiye protein ekstraksiyon işlemi uygulandı ve MALDI-TOF MS ile bakteri tanımlandı. Aynı çökeltiden 0, 5 McFarland yoğunluğunda süspansiyon hazırlanarak antibiyotik duyarlılık testleri otomatize sistemde çalışıldı. Bulgular: Bakteri tanımlanmasında rutinde kullanılan standart yöntem ile "in-house" yeni yöntem arasında %90 (72/80) oranında benzerlik saptandı. Standart rutin yöntemler ile kan kültürünün pozitif sinyal vermesinden sonra bakteri tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri 36-48 saat süre alırken; çalışmamızdaki "in-house" yöntem ile bu süre ortalama 10 saatte tamamlandı. Ayrıca elde edilen antibiyotik duyarlılık sonuçları, standart rutin yöntem ile %97, 9 oranında uyumlu bulundu. Sonuç: MALDI-TOF MS bulunduran laboratuvarlar için "in-house" yeni yöntem çok basit ve kolaydır. Kan kültür şişeleri pozitif sinyal verdikten sonra bakteri tanımlama ve antibiyotik duyarlılık test sonuçları pahalı reaktifler ve uzun çalışma sürelerine gerek kalmadan yaklaşık 10 saatte elde edilebilmektedir. Bu yöntem ile elde edilen hızlı duyarlılık sonucu özellikle yoğun bakım hastalarında hayat kurtarıcı bir değere sahip olabilir.;Kan kültürü; MALDI-TOF MS; Doğrudan tanımlama; Hızlı duyarlılık.;Blood culture; MALDI-TOF MS; Direct identification; Rapid sensitivity.
Açıklama
Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
