Detection of miRNA Expression Alteration in Diffuse and High Grade Glial Tumors
Küçük Resim Yok
Tarih
2015
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Amaç: Bu çalışmada diffüz ve anaplastik beyin tümörlü olgularda miRNA ekspresyon profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Metot: Ege Üniversitesi Nöroşirurji Anabilim Dalı'nda 2007-2011 yılları arasında beyin tümörü tanısı almış 50 (19K, 31E) olgunun [32 glioblastoma (GBM), 10 diffüz astrositom (DA) ve 8 anaplastik oligodendrogliom (AO)] ve beyin tümörü hücre hatlarının (U-87 MG, U-118 MG ve LN 18) miRNA ekspresyon profilleri mikroarray yöntemi ile çalışıldı. Bulgular: miR-21 ekspresyonunun tüm olgularda yüksek düzeyde olduğu ve mir-124 ekspresyonunun olmadığı bulundu. GBM tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları hücre hatları ile karşılaştırıldığında miR-495 ve miR-432 ekspresyonları 2 kat anlamlı artma ve miR-708-3p, mir-339-5p ve miR-4286 ekspresyonları 4 kat, mir-331-3p, miR-625-3p ve miR- 20a-3p 5 kat azalma gösterdi. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları GBM tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları ile karşılaştırıldığında miR-34c-3p, miR-132-5p, mir- 605, miR-3130-3p, miR-3127, mir-517a-pre, mir-548b-3p, miR-921, miR-769-5p ekspresyonunda anlamlı artma saptandı. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları hücre hatları ile karşılaştırıldığında; mir-204 ekspresyonunun 6 kat anlamlı olarak azaldığı belirlendi. DA tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları hücre hatları ile karşılaştırıldığında 18 miRNA ekspresyonunda anlamlı artma ve 7 miRNA ekspresyonunda anlamlı azalma gözlendi. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları DA tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları ile karşılaştırıldığında, anlamlı değişim saptanmadı. DA, AO ve GBM olgularının miRNA ekspresyonları karşılaştırıldığında, 29 miRNA ekspresyonunun anlamlı farklılık gösterdiği bulundu. Sonuç: miRNA ekspresyon profilleri GBM tanılı olgular ile AO tanılı olgular arasında anlamlı farklılıklar sergilemiştir. Tümör gelişiminde miRNA' ların regüle ettiği varsayılan yeni genlerin etkili olabileceği vurgulanmıştır. miRNA ekspresyonu tarafından regüle edilen yeni spesifik gen hedefleri beyin tümöründe iyi klinik gidişi belirtebilir.
Objective: It was aimed to determine the expression profiles of miRNAs in patients with diffuse and anaplastic brain tumors. Methods: miRNA expression profiles of 50 cases (19 Female, 31 Male) diagnosed with brain tumor [32 Glioblastoma (GBM), 10 diffuse astrocytoma (DA), 8 anaplastic oligodendroglioma (AO)] in Ege University, Department of Neurosurgery and of brain tumor cell lines (U-87 MG, U-118 MG and LN 18) studied by the microarray method. Results: In all cases miR-21 expression level was high and no miR-124 expression was detected. In GBM, miR-495 and miR-432 expression showed significant 2-fold increase, and miR-708-3p, mir-339-5p and miR-4286 expressions 4-fold, mir-331-3p, miR-625-3p, and miR-20a-3p showed 5-fold reduction compared to cell lines. miRNA expressions compared GBM and AO, it was detected that miR-34c-3p, miR-132-5p, mir-605, miR-3130-3p, miR- 3127, mir-517a-pre, mir-548b-3p, miR-921, miR-769-5p were significantly increased. mir- 204 expression was significantly decreased in AO compared to cell lines. In DA, miRNA expression was significantly increased in 18 and decreased in 7. There was no significant miRNA expression changes in AO compared with DA. miRNA expressions of DA, AO and GBM cases were compared and significant alterations were found in 29 miRNA expressions. Conclusion: miRNA expression profiles of GBM were significantly different from AO. It was emphasized that, new genes could be effective in tumor development supposed to be regulated by miRNAs. New specific gene targets regulated by miRNA expression could be predicted good clinical outcome in brain tumors.
Objective: It was aimed to determine the expression profiles of miRNAs in patients with diffuse and anaplastic brain tumors. Methods: miRNA expression profiles of 50 cases (19 Female, 31 Male) diagnosed with brain tumor [32 Glioblastoma (GBM), 10 diffuse astrocytoma (DA), 8 anaplastic oligodendroglioma (AO)] in Ege University, Department of Neurosurgery and of brain tumor cell lines (U-87 MG, U-118 MG and LN 18) studied by the microarray method. Results: In all cases miR-21 expression level was high and no miR-124 expression was detected. In GBM, miR-495 and miR-432 expression showed significant 2-fold increase, and miR-708-3p, mir-339-5p and miR-4286 expressions 4-fold, mir-331-3p, miR-625-3p, and miR-20a-3p showed 5-fold reduction compared to cell lines. miRNA expressions compared GBM and AO, it was detected that miR-34c-3p, miR-132-5p, mir-605, miR-3130-3p, miR- 3127, mir-517a-pre, mir-548b-3p, miR-921, miR-769-5p were significantly increased. mir- 204 expression was significantly decreased in AO compared to cell lines. In DA, miRNA expression was significantly increased in 18 and decreased in 7. There was no significant miRNA expression changes in AO compared with DA. miRNA expressions of DA, AO and GBM cases were compared and significant alterations were found in 29 miRNA expressions. Conclusion: miRNA expression profiles of GBM were significantly different from AO. It was emphasized that, new genes could be effective in tumor development supposed to be regulated by miRNAs. New specific gene targets regulated by miRNA expression could be predicted good clinical outcome in brain tumors.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Nörolojik Bilimler
Kaynak
Journal of Neurological Sciences (Turkish)
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
32
Sayı
1
