İnsan Y kromozomunda yer alan DYS385 polimorfizmlerinin azospermik ve fertil erkeklerde araştırılması
Küçük Resim Yok
Tarih
2005
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
DNA, Y chromosome, STR, DYS385, PCR.;DNA, Y kromozomu, STR, DYS385, PCR.;kromozomunun NRY (non-recombining Y) olarak adlandırılan büyük bir bölümü; mayoz sırasında rekombinasyona uğramadığından, babadan oğula değişmeden geçer. Bu nedenle NRY bölgesi evrim süresince erkek soyunda gerçekleşen mutasyon olaylarının adeta bir kaydını tutar ve daima haploit durumdadır. Bu özellikler Y kromozomu polimorfizmlerini, adli uygulamalar ve populasyon tarihi çalışmalarını da kapsayan farklı seviyelerde oldukça kullanışlı hale getirmiştir. Y kromozomal STR (short tandem repeat) bölgesi DYS385, 4 baz çiftlik 'GAAA' tekrar üniteleri içeren birbiri ile bağlantılı iki STR bölgesini kapsar. DYS385 bölgesi bir çift primer kullanılarak PCR (polimeraz zincir reaksiyonu) ile çoğaltıldığında, elde edilen değişken boyuttaki iki allel tek bir haplotip olarak kabul edilir ve Y kromozomu üzerindeki en bilgilendirici polimorfik markırlardan biridir. Bu çalışmada Y kromozomunun DYS385 bölgesinde yer alan polimorfizmleri araştırmak amacı ile klinisyen tarafından azospermi tanısı konmuş 49 hasta ve 51 fertil erkek bireyde bu bölgenin polimorfizm taraması yapılmıştır. EDTA'lı tüplere alınan kan örneklerinden, NücleoSpin izolasyon kiti ile DNA izole edilmiş ve DYS385-1, DYS385-2B primerleri kullanılarak T-PCR (touchdown PCR) yöntemi ile çoğaltılmıştır. Elde edilen PCR ürünleri %6 poliakrilamid jel elektroforezinde yürütülmüş ve gümüş boyama tekniği ile görüntülenerek değerlendirilmiştir. Bu çalışmada toplam 31 farklı genotip (azospermide 22, kontrol grubunda 26) belirlenmiştir. Azospermi (GD: 0.917) ve kontrol (GD: 0.949) grubu birleştirildiğinde gen çeşitliliği (gene diversity; GD) değeri 0.946 bulunmuştur. Yapılan analizler sonucu DYS385 bölgesi polimorfizmlerinin, azospermi hastaları ile kontrol grubu arasında istatiksel olarak anlamlı bir farklılık gösterdiği belirlenmiştir. En çok fark gösteren genotip azospermi grubunda 0.183, kontrol grubunda 0.058 frekansla bulunan genotip 14-17 'dir. Bu sonuçlar literatürle karşılaştırıldığında, DYS385'in ayrım gücü en yüksek Y-STR markırı olduğu görüşünü Türk Populasyonu için de desteklemektedir.
Açıklama
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2005
