Erken başlangıçlı parkinson hastalarında mutasyonların araştırılması
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi, Tıp Fakültesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Amaç: Parkinson Hastalığı (PH), Alzheimer Hastalığı’ndan (AH) sonra en sık görülen
nörodejeneratif hastalıktır. Parkinson Hastalığı’na yol açan nörodejeneratif sürecin etyolojisi
halen tam olarak anlaşılamamış olsa da genetik ve çevresel faktörlerin bir arada etkileşiminin
rolü olabileceği düşünülmektedir. Parkinson Hastalığı olgularının yaklaşık %10’u ailesel
özellik göstermektedir. Parkinson Hastalığı’nın genetik etiyolojisinin anlaşılması ve
aydınlatılması hastalığın fizyopatolojisinin daha iyi kavranmasına neden olacaktır.
Gereç ve Yöntem: Klinik olarak Erken Başlangıçlı Parkinson Hastalığı (EBPH) tanısı ile Ege
Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Nöroloji Anabilim Dalı’nda takip edilen ve daha
önceden hedeflenmiş yeni nesil dizi analizi ile etiyolojiden sorumlu olduğu bilinen 10 genin
(SNCA, LRRK2, VPS35, PARK2, PINK1, PARK7, ATP13A2, PLA2G6, FBXO7, DNAJC6)
incelendiği olgular, büyük delesyon ve duplikasyonlar için MLPA yöntemi ile 8 gen (SNCA,
PARK7, LRRK2, ATP13A2, PINK1, GCH1, PRKN, UCHL1) açısından incelendi.
Bulgular: Çalışmaya alınan 30 olgunun 7’sinde, PH ile ilişkili genlerde mutasyon saptandı.
Dört olguda PRKN geninde mutasyon saptandı, bunların 3 tanesi tanımlı delesyon mutasyonu
(ekzon 5 delesyonu, ekzon 2 delesyonu, ekzon 3 ve 4 delesyonu) olup bir tanesi ilk kez bu
çalışmada saptanan splice site mutasyonudur (c.1083+1delG). İki olguda PLA2G6 geninde
tanımlı bir nokta mutasyonu (c.1705C>T) saptanmış olup 1 olguda ise PINK1 geninde tanımlı
bir nokta mutasyonu (c.1247C>T) saptandı. Olguların klinik ve genetik özellikleri, genotipfenotip
korelasyonu açısından ele alındı.
Sonuç: Bu çalışma, EBPH grubundaki moleküler etiyolojinin incelendiği ülkemizdeki az
sayıdaki çalışmadan biridir. PRKN, PLA2G6 ve PINK1 genlerinde saptadığımız mutasyonlar
PH için genotip-fenotip korelasyonu açısından literatürde bildirilen olgulara katkı
sağlamaktadır. Toplumumuzda EBPH olgularında PRKN gen mutasyonları ve özellikle büyük
delesyonları oldukça sıktır. Risk altında olan diğer aile bireylerinin taranması ve ailedeki
mutasyona özgü genetik danışmanlık verilmesine olanak sağlayan çalışma; hastalık ilişkili
varyantların saptanması, toplumumuza ait verilerin oluşturulması ve yeni genlerde mutasyon
tanımlayarak hastalığın genetik etiyolojisinin genişletilmesi ile literatüre katkı sağlanmıştır.
Objective: Parkinson's Disease (PD) is the most common neurodegenerative disease after Alzheimer's Disease (AD). The etiology of the neurodegenerative process that causes PD is still not understood, and it is thought that the interaction of genetic and environmental factors may play a role. Approximately 10% of PD cases show familial characteristics. Understanding the genetic etiology of PD will lead to a better understanding of the physiopathology of the disease. Materials and Methods: Thirty clinically familial Early Onset Parkinson Disease (EOPD) diagnosed cases that examined by sequencing exons and exon-intron boundaries using targeted new generation for 10 genes known to be responsible for etiology (SNCA, LRRK2, VPS35, PARK2, PINK1, PARK7, ATP13A2, PLA2G6, FBXO7, DNAJC6) were selected. That patients were examined for large deletions and duplications of 8 genes (SNCA, PARK7, LRRK2, ATP13A2, PINK1, GCH1, PRKN, UCHL1) by MLPA method. Results: Disease-causing mutations that associated with PD were detected in 7 of 30 cases. Identified 6 of the 7 variants were previously described (PRKN: exon 2 deletion, exon 5 deletion and exon 3-4 deletion; PLA2G6: c.1705C>T; PINK1: c.1247C>T) and 1 of the 7 variants was a novel splice site mutation (PRKN: c.1083+1delG). The clinical and genetic characteristics of the cases were discussed in terms of genotype phenotype correlation. Conclusion: This study is one of the few studies in our country investigating the molecular etiology in the EOPD group. The mutations we detected in the PRKN, PLA2G6 and PINK1 genes contribute to the cases reported in the literature in terms of genotype-phenotype correlation for PD. PRKN gene mutations and especially large deletions are quite common in familial EOPD cases in our society. A study that allows screening of other family members at risk and providing genetic counseling specific to the mutation in the family; Contribution has been made to the literature by identifying disease-related variants, creating data on our society, and expanding the genetic etiology of the disease by identifying mutations in new genes.
Objective: Parkinson's Disease (PD) is the most common neurodegenerative disease after Alzheimer's Disease (AD). The etiology of the neurodegenerative process that causes PD is still not understood, and it is thought that the interaction of genetic and environmental factors may play a role. Approximately 10% of PD cases show familial characteristics. Understanding the genetic etiology of PD will lead to a better understanding of the physiopathology of the disease. Materials and Methods: Thirty clinically familial Early Onset Parkinson Disease (EOPD) diagnosed cases that examined by sequencing exons and exon-intron boundaries using targeted new generation for 10 genes known to be responsible for etiology (SNCA, LRRK2, VPS35, PARK2, PINK1, PARK7, ATP13A2, PLA2G6, FBXO7, DNAJC6) were selected. That patients were examined for large deletions and duplications of 8 genes (SNCA, PARK7, LRRK2, ATP13A2, PINK1, GCH1, PRKN, UCHL1) by MLPA method. Results: Disease-causing mutations that associated with PD were detected in 7 of 30 cases. Identified 6 of the 7 variants were previously described (PRKN: exon 2 deletion, exon 5 deletion and exon 3-4 deletion; PLA2G6: c.1705C>T; PINK1: c.1247C>T) and 1 of the 7 variants was a novel splice site mutation (PRKN: c.1083+1delG). The clinical and genetic characteristics of the cases were discussed in terms of genotype phenotype correlation. Conclusion: This study is one of the few studies in our country investigating the molecular etiology in the EOPD group. The mutations we detected in the PRKN, PLA2G6 and PINK1 genes contribute to the cases reported in the literature in terms of genotype-phenotype correlation for PD. PRKN gene mutations and especially large deletions are quite common in familial EOPD cases in our society. A study that allows screening of other family members at risk and providing genetic counseling specific to the mutation in the family; Contribution has been made to the literature by identifying disease-related variants, creating data on our society, and expanding the genetic etiology of the disease by identifying mutations in new genes.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Parkinson, Yeni Nesil Dizi Analizi, MLPA, Parkinson, Next Generation Sequencing, MLPA
