Uzun yaşayanlarda mitokondriyal DNA sekans analizi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2010
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Yaşlanma, üzerinde birçok faktörün etkisinin olduğu, fizyolojik fonksiyonlarda ilerleyici azalmayla seyreden, yaşın artmasıyla sağ kalım süresi ve çoğalma yeteneğinde azalma ve nihayetinde ölümle sonuçlanan bir süreçtir. Yaşlanma mekanizmalarından en çok kabul görenlerden biri de mitokondrial mutasyonlardır. Mitokondrinin bir serbest radikal kaynağı olması ve bu radikallerin olumsuz etkilerine sık maruz kalması, maternal kalıtımı olan, rekombinasyon görülmeyen ve yetersiz onarım mekanizmaları olan mitokondriyal genomda mutasyon görülme ihtimalini arttırmaktadır. Kalıtılan ve somatik mutasyonlar sonucunda oluşan mitokondriyal DNA sekans varyasyonları, respiratuar zincir ve serbest radikal oluşumunda farklılıklar oluşturarak yaşam süresini etkileyebilir. Çalışmamıza 90 yaş üzerinde (n= 25) ve kronik hastalığı olmayan orta yaşlı (n=25) şahıslar sırasıyla +90 ve kontrol grupları olarak dahil edildi. Mitokondriyal DNA dizi analizleri her iki grupta Affymetrix mikroarray sistemi ile gerçekleştirildi. Bu sekans bilgilerinden rCRF sekans dizilimi referans alınarak polimorfik varyantlar saptandı ve olguların mitokondriyal DNA'larının bağlı bulundukları haplogrup kümeleri tespit edildi. Yaşlı ve kontrol grubu arasındaki polimorfik varyant ve haplogrup farklılıkları saptanarak istatiksel farklılıkları ortaya konuldu. Sonuçlara göre daha önce benzer 3 ayrı çalışmada belirlenen bir uzun yaşam bölgesi olan C150T polimorfizmi, +90 grubunda kontrol grubundan anlamlı yüksek bulundu. T16304C polimorfizmi kontrol grubunda +90 grubundan yüksek fekanslarda bulundu. Bu polimorfik varyantın uzun yaşam üzerine olumsuz etkileri olabilecek bir varyant olabileceği düşünülmektedir. Olguların haplogruplarına bakıldığında, Türk populasyonunda haplogrup H, HV, R ve N haplogruplarının sık olarak görüldüğü tespit edildi. Kontrol ve +90 grubu arasında haplogruplar açısından anlamlı bir farklılık bulunamadı. Çalışmamız aynı zamanda Türk populasyonunda bu konuda yapılan ilk çalışmadır. Türk populasyonuna ait mitokondriyal DNA sekans verileri ve haplogrup verilerinin belirlenmiş olması ileride yapılacak çalışmalara da kaynak oluşturacaktır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Tıbbi Biyokimya A.B.D.
