Meta-Sezgisel Tabanlı Clustal-SA Algoritmasını Kullanarak DNA Sekanslarında Çoklu Dizi Hizalama

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorErdirik, Hatic
dc.contributor.authorKarcıoğlu, Abdullah Ammar
dc.contributor.authorTanyolaç, Bahattin
dc.contributor.authorBulut, Hasan
dc.date.accessioned2024-08-31T07:31:21Z
dc.date.available2024-08-31T07:31:21Z
dc.date.issued2024
dc.departmentEge Üniversitesien_US
dc.description.abstractBiyoinformatik, biyolojik verilerin analizi ve kalıtsal ilişkilerin ortaya çıkarılması için matematik, biyoloji ve bilgisayar bilimlerini birleştiren bir disiplindir. Bu alandaki en kritik görevlerden biri, biyolojik dizilerin hizalanmasıyla ilgili olan dizi hizalama problemini çözmektir. Ancak, biyolojik verilerin hızla artması, bu problemi manuel olarak çözülemez hale getirmiş ve bilgisayar sistemlerinin biyoinformatikte daha yaygın bir şekilde kullanılmasına yol açmıştır. Bu çalışmada, mevcut Clustal algoritması ve benzetimli tavlama algoritması kullanılarak yeni bir dizi hizalama algoritması önerilmiştir. Clustal algoritmasının hız avantajını kullanarak ve benzetimli tavlama algoritmasını entegre ederek, Clustal'ın aç gözlü yaklaşımından uzaklaşılarak optimal hizalama skoru elde etmek amaçlanmıştır. Geliştirilen algoritmanın başarısını değerlendirmek için SP (Çiftlerin Toplamı) puanlama sistemi kullanılmış ve hizalama sonucunda sütun eşleşme sayısı dikkate alınmıştır. Elde edilen sonuçlar, geliştirilen algoritmanın aynı uzunluktaki dizi veri kümeleri üzerinde ClustalW programından daha iyi performans gösterdiğini, MUSCLE programına göre ise bazı veri setlerinde daha başarılı olduğu veya yakın sonuçlar verdiğini ortaya koymuştur. Bu gelişme, biyoinformatik alanında dizi hizalama problemini çözmek için yeni ve daha etkili bir yaklaşımın potansiyelini vurgulamaktadır. Gelecekte, bu tür geliştirmelerin biyolojik veri analizi alanında daha geniş bir uygulama alanı bulabileceği düşünülmektedir.en_US
dc.identifier.doi10.21597/jist.1404898
dc.identifier.endpage562en_US
dc.identifier.issn2146-0574
dc.identifier.issn2536-4618
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.startpage544en_US
dc.identifier.trdizinid1240627en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.21597/jist.1404898
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/1240627
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11454/103424
dc.identifier.volume14en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofIğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmz20240831_Uen_US
dc.subjectÇoklu dizi hizalamaen_US
dc.subjectSezgisel Yaklaşımen_US
dc.subjectClustal Algoritmasıen_US
dc.subjectBenzetimli Tavlamaen_US
dc.subjectBiyoinformatiken_US
dc.titleMeta-Sezgisel Tabanlı Clustal-SA Algoritmasını Kullanarak DNA Sekanslarında Çoklu Dizi Hizalamaen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu