Yemeklik Baklagil Tohumlarıyla Taşınan Bazı Virüslerin Tespiti, Biyolojik ve Moleküler Karakterizasyonu
Küçük Resim Yok
Tarih
2021
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Bu çalışma, 2017 yılında Türkiye’nin farklı illerindeki üreticilerden ve firmalardan temin edilen bakla,bezelye, mercimek ve nohut tohum örneklerinde Alfalfa mosaic alfamovirus (AMV), Bean yellow mosaicpotyvirus (BYMV), Cucumber mosaic cucumovirus (CMV) ve Pea seed-borne mosaic potyvirus (PSbMV)virüslerinin bulunma durumunun belirlenmesi ve tespit edilen virüslerin biyolojik ve molekülerkarakterizasyonunun yapılması amacıyla gerçekleştirilmiştir. Tohum örneklerinde virüslerin saptanmasında,DAS-ELISA ve RT-PCR yöntemleri kullanılmıştır. Tespit edilen virüsler mekanik inokulasyonla test bitkilerinetaşınarak biyolojik karakterizasyonu yapılmıştır. Daha sonra RT-PCR yöntemiyle çoğaltılan virüslerin CP (kılıfprotein) gen bölgelerinin dizi analizleri yapılarak, MEGA programı vasıtasıyla dünya izolatlarıyla karşılaştırılmalıolarak filogenetik analizi gerçekleştirilmiştir. Toplamda 30 adet bakla, 25 adet bezelye, 50 adet mercimek ve100 adet nohut tohum örneği testlenmiştir. Test sonuçlarına göre, bakla tohum örneklerinde CMV (%3.33) vePSbMV (%3.33), mercimek tohum örneklerinde BYMV (% 2.00) ve CMV (% 2.00) ve nohut tohum örneklerindeAMV (% 1.00), BYMV (% 2.00), CMV (% 1.00) ve PSbMV (% 3.00) virüslerine rastlanırken, bezelye tohumlarındaherhangi bir virüse rastlanmamıştır. Ayrıca, mercimekte BYMV+CMV, baklada CMV+PSbMV ve nohuttaAMV+BYMV+PSbMV çoklu enfeksiyonları tespit edilmiştir. Gerçekleştirilen filogenetik analize göre, en yükseknükleotit benzerliği AMV (nohut) izolatı ile Rusya izolatı (97.73), BYMV (nohut) izolatı ile Amerika izolatı (%98.51), CMV (nohut) izolatı ile Polonya izolatı (% 98.54), PSbMV (nohut) izolatı ile Çin ve Almanya izolatları (%98.98), BYMV (mercimek) izolatı ile Hindistan izolatı (% 94.47) ve PSbMV (bakla) izolatı ile Yunanistan izolatı (%99.45) arasında tespit edilmiştir. Bizim literatür bilgilerimize göre, baklada PSbMV, Nohutta BYMV, CMV vePSbMV virüsleri ülkemizde ilk kez belirlenmiştir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Kaynak
Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
8
Sayı
3
