Hasta solunum örneklerinden klinik Acinetobacter baumannii izolatlarına karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve karakterizasyonu
| dc.contributor.author | Aydemir, Sabire Şöhret | |
| dc.contributor.investigator | Akkul, Betül | |
| dc.contributor.investigator | Sözer Bahadır, Pınar | |
| dc.date.accessioned | 2025-06-17T11:39:16Z | |
| dc.date.available | 2025-06-17T11:39:16Z | |
| dc.date.issued | 2024 | |
| dc.department | Ege Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Bilimler Bölümü, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı | |
| dc.description.abstract | Antibiyotiklere direnç çağında bakteriyofaj terapisi yeniden önem kazanmaktadır. Bakteriyofajlar bakteriler enfekte eden ve bu yolla çoğalan virüslerdir. Bakterilerin bulunduğu tüm ekosistemlerde yaygın olarak bulunan bu mikroorganizmaların insan vücudundaki varlığı da uzun yıllardır bilinmektedir. Bu tez kapsamında; Dünya Sağlık Örgütü tarafından yeni antimikrobiyal tedavilerin geliştirilmesi yönünden kritik öncelikli grupta sınıflandırılan A.baumannii'ye karşı hasta solunum örneklerinden litik bakteriyofaj izolasyonu, karakterizasyonu ve tedavide kullanım potansiyelinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Bakteriyoloji Laboratuvarına 17 Nisan-9 Temmuz 2023 tarihleri arasında rutin mikrobiyolojik inceleme amacıyla gönderilen ve A.baumannii izole edilen 50 adet derin trakeal aspirat, transtrakeal aspirat, bronkoalveolar lavaj sıvısı ve bronkoskopik aspirasyon sıvısı örneği potansiyel bakteriyofaj kaynağı olarak kabul edilerek çalışmaya dahil edilmiştir. Bu kaynaklardaki bakteriyofaj varlığı; yine aynı örneklerden izole edilen A.baumannii izolatları üzerinde spot test yöntemiyle araştırılmıştır. Bir A.baumannii izolatına karşı litik bakteriyofaj izole edilmiştir. Bakteriyofaj elektron mikroskop ile incelendiğinde Caudoviricetes sınıfına ait kuyruklu bir faj olduğu görülmüştür. Konakçı aralığı çalışmaya dahil edilen hasta örneklerinden izole edilmiş A.baumannii izolatları ve A.baumannii ATCC BAA-1605 suşu üzerinde araştırılmıştır. Bu suşlara etkili bulunmayan bakteriyofajın dar bir konakçı aralığına sahip olduğu görülmüştür. Taksonomik analizde; bakteriyofaj genomunun %79'unun Obolenskvirüs cinsi içerisinde daha önceden tanımlanmış olan Acinetobacter faj WCHABP1 ile %98.80 oranında benzer olduğu görülmüştür. Bakteriyofajın Obolenskvirüs cinsinin yeni bir üyesi olarak sınıflandırılabileceği düşünülmektedir. Lizojeni ile ilişkili gen bölgeleri içeren bakteriyofajın tedavi güvenliğini değerlendirmek amacıyla in vivo test edilmesi gereklidir. | |
| dc.description.abstract | Bacteriophage therapy is gaining importance again in the era of antibiotic resistance. Bacteriophages are viruses that infect bacteria and multiply in this way. The presence of these microorganisms, which are widely found in all ecosystems where bacteria are found, in the human body has been known for many years. Within the scope of this thesis; It is aimed to evaluate the isolation, characterization and the potential use of lytic bacteriophage from patient respiratory samples against A. baumannii, which is classified in the critical priority group by the World Health Organization in terms of the development of new antimicrobial treatments. Fifty deep tracheal aspirate, transtracheal aspirate, bronchoalveolar lavage fluid and bronchoscopic aspiration fluid samples sent for routine microbiological examination to the Ege University Faculty of Medicine Medical Microbiology Bacteriology Laboratory between April 17 and July 9, 2023 and from which A. baumannii was isolated were considered as potential bacteriophage sources and included in the study. The presence of bacteriophages in these sources; was investigated by spot test method on A.baumannii isolates isolated from the same samples. Lytic bacteriophage was isolated against an A.baumannii isolate. When the bacteriophage was examined with an electron microscope, it was seen that it was a tailed phage belonging to the Caudoviricetes class. The host range was investigated on A.baumannii isolates isolated from patient samples included in the study and the A.baumannii ATCC BAA-1605 strain. It was seen that the bacteriophage, which was not effective against these strains, had a narrow host range. In taxonomic analysis, it was observed that 79% of the bacteriophage genome was 98.80% similar to the previously identified Acinetobacter phage WCHABP1 in the Obolenskvirus genus. It is thought that the bacteriophage can be classified as a new member of the Obolenskvirus genus. In vivo testing of bacteriophage containing gene regions associated with lysogeny is necessary to evaluate the safety of treatment. | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/11454/117557 | |
| dc.language.iso | tr | |
| dc.publisher | Ege Üniversitesi | |
| dc.relation.publicationcategory | Project | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.subject | Bakteriyofaj | |
| dc.subject | Obolenskvirüs | |
| dc.subject | Acinetobacter baumannii | |
| dc.subject | pnömoni. | |
| dc.subject | Bacteriophage | |
| dc.subject | pneumonia. | |
| dc.subject.classification | 24206 | |
| dc.title | Hasta solunum örneklerinden klinik Acinetobacter baumannii izolatlarına karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve karakterizasyonu | |
| dc.type | Project |
