Diyarbakır yerel patlıcan genotiplerinin moleküler karakterizasyonunun belirlenmesi
Küçük Resim Yok
Tarih
2022
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
Yürütülen bu çalışmada, patlıcan genotiplerinin moleküler karakterizasyonunun belirlenmesi amaçlanmıştır. Denemede bitkisel materyal olarak Diyarbakır yöresinden toplanan (37 adet) ve gen bankasından alınan (1 adet) toplam 38 adet Diyarbakır yerel patlıcan genotipine ilaveten yörede ticari olarak kullanılan 4 adet patlıcan çeşidi, özel bir şirkete ait 14 adet genotip adayı ve Asya Sebze Araştırma ve Geliştirme Merkezi'den temin edilen 9 adet yabani patlıcan genotipi (toplam 65 adet genotip) kullanılmıştır. Genotiplerin tohumları (15 tohum/genotip) 128'lik EPS viyolle içerisinde torf ortamına elle ekilmişlerdir. Viyoller çimlendirme odasında gündüz/gece 22-24ºC sıcaklık ve %85 oransal nemde karanlık koşullarda 3 gün tutulmuştur. Tohumlar çimlendikten sonra viyoller fide üretim serasına alınmış ve fideler dikim büyüklüğüne gelene kadar burada tutulmuştur. Fideler 3-4 yapraklı olduğu zaman DNA ekstraksiyonları için yaprak örneği alma işlemleri yapılmıştır. Yaprak örnekleri Tissue Lyser yardımı ile parçalanmış ve parçalanan örneklere bitki DNA ekstraksiyon kitinde (DNeasy Plant Mini Kit-Quigen) yer alan protokol uygulanarak, genotiplere ait DNA'lar elde edilmiştir. Bu amaçla SSR markörlerinden yararlanılmış ve markörler ilgili literatürden ve NARO-Sebze ve Süs Bitkileri Bilimleri Enstitüsü'ne ait, sebzeler için DNA marker veri tabanından seçilmiştir. PIC ve allel sayısına göre değerlendirmeler yapılmış ve 28 SSR markörü (primer) genetik çeşitliliğin belirlenmesinde kullanılmak üzere seçilmiştir. Genotiplerin SSR primerlerine bağlı olarak oluşturdukları skorlar; NTSYS-PC paket programında analiz edilmiştir. Genotiplerin benzerlik katsayıları Jakkard metodu ile oluşturulup, aritmetik ortalama üzerinden UPGMA yöntemi kullanılarak dendogramları, SIMINT modülü ile korelasyon matriksleri oluşturulmuş, sonrasında PCA analizi yapılmıştır. Skorlanan primerlerden elde edilen bantlarda 28 adet primerden toplam 72 polimorfik markör elde edilmiş olup, kullanılan primerlerin tamamının polimorfik olduğu belirlenmiştir. Genotiplerin benzerlik oranının %29 ile %100 arasında değiştiği ve tüm genotiplerin 6 grup altında toplandığı, en fazla genotipin A grubunda yer aldığı görülmüştür. Araştırma sonucunda, yöreden toplanan patlıcan genotiplerinin genetik varyasyon gösterdiği ancak benzer grupların da olduğu; mevcut varyasyonun genetik çeşitlilik için önemli olduğu ve elde edilen verilerinin ıslah çalışmalarında kullanabilecek nitelikte olduğu belirlenmiştir.;Solanum melongena, germplasm, DNA marker, SSR.;Solanum melongena, germplasm, DNA marker, SSR.
Açıklama
Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
