Burkit lenfoma, folliküler lenfoma, anaplastik büyük hücreli lenfoma hastalarına ait parafin kesitlerinde t(14;18), t(8;14), t(2;5) kromozomal yeniden düzenlenmelerin gerçek zamanlı PCR ile kantitasyonları ve kromozomal anomalilerin fluoresan in situ hibridizasyon (FISH) yöntemi ile değerlendirilmesi
Dosyalar
Tarih
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
Özet
Hemato-onkolojik malinitelerde, tümör spesifik kromozomal translokasyonların ve gen amplifikasyonlarının tespiti, bu lezyonların tanı ve prognostik açıdan degerlendirilmesinde giderek artan öneme sahiptir. Çalısmamızda, folliküler lenfoma tanılı olgularda, gerçek zamanlı PCR, semi-nested PCR ve multipleks PCR yöntemi olmak üzere 3 farklı PCR yöntemi kullanılarak MBR yeniden düzenlenmesi kalitatif ve kantitatif olarak tespit edilmistir. Otuz dört olgunun 26'sında DNA izolasyonu basarılı olmus ve MBR yeniden düzenlenmesi için sırasıyla semi-nested ile %79,17, multipleks ile %41,67 ve gerçek-zamanlı PCR ile %33,33 oranında pozitif olarak saptanmıstır. MBR negatif saptanan 5 olgu gerçek-zamanlı PCR ile MCR negatif olarak saptanmıstır. FISH yöntemiyle nukleus izolasyonu basarılı olan 16 olgunun 15'i t(14;18) translokasyonu için pozitif, sadece bir olgu ise negatif olarak saptanmıstır. Burkitt lenfoma tanılı olgularda t(8;14) translokasyonu expand long PCR yöntemi ve FISH metodu ile arastırılmıstır. Üç olguya ait taze doku örnegi, 2 olgunun imprint örnegi ve 2 olgunun periferik kan örnegi MYC/IgH yeniden düzenlenmesi için pozitif olarak saptanmıstır. Parafin kesitlerde ise 2 örnekte MYC/IgH yeniden düzenlenmesi pozitif olarak bulunmustur. On altı olgunun parafin doku örnegi DNA degradasyonu nedeniyle degerlendirilememistir. FISH analizinde ise olgulara ait 3 taze doku örnegi, 2 imprint ve 2 periferik kan örnegi MYC/IgH yeniden düzenlenmesi için pozitif olarak saptanmıstır. Parafin doku örneklerinden 9 olguda t(8,14) translokasyonu pozitif bulunmustur ve bir olguda da 8. ve 14. kromozomun parsiyel trizomisi saptanmıstır. . Anaplastik Büyük Hücreli Lenfoma tanılı olgulara ait 4 olguda, t(2,5) translokasyonunun degerlendirilmesi amacıyla PCR analizi için RNA izolasyonu yapılmıs fakat parafin dokularda RNA izolasyonu basarılı olmamıstır. Fakat bu örneklerin 2' sinde nukleus izolasyonu basarılı olmus ve FISH yöntemine göre bu örnekler t(2;5) translokasyonu pozitif bulunmustur. Sonuç olarak, hem farklı PCR yöntemlerinin, hem de FISH yönteminin kullanılmasının tümörün genetik karakterizasyonunun aydınlatılmasına olanak saglayacagı kanısındayız. Temel moleküler yöntemlerin, güncel terapötik yaklasımlara yeni boyutlar kazandıracagını, ayrıca moleküler tanıda alınan yolun bireye özgü tedavi yönteminin uygulanması adımını hızlandıracagını düsünmekteyiz.;Non-Hodgkin Lenfoma, Folliküler Lenfoma, FISH, multipleks PCR, semi-nested PCR.;Non-Hodgkin Lymphoma, Follicular Lymphoma, FISH, multiplex PCR, seminested PCR.
Açıklama
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2011