46,XY Cinsiyet gelişim bozukluğu olgularında yeni nesil dizi analiz yöntemi ile hızlı moleküler genetik tanı
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2016
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
46, XY Disorders of sex development, targeted next-generation sequencing, rapid diagnosis, efficiency and cost assessment;46,XY Cinsiyet Gelişim Bozukluğu (CGB) testis gelişim bozukluğu, androjen sentez veya etki kusurları sonucu ortaya çıkabilir. CGB olgularında hastanın en uygun şekilde yönetimi için erken ve doğru tanı çok önemlidir. Bu hastalarda klasik yöntemler ile tanı koymak oldukça maliyetli ve zaman olabilmektedir. Amaç: Androjen rezistansı (AR) ve 5 alfa redüktaz ( SRD5A2) gen mutasyonları moleküler tanı yöntemleri ile dışlanarak önceden tanı konamamış, 46,XY CGB olgularında hedeflenmiş yeni nesil dizi analizi (HYNDA) yöntemi ile hızlı moleküler genetik tanı konulması amaçlanmıştır. Gereç- Yöntem: Biokimyasal olarak testis gelişim bozukluğu veya testosteron sentez kusuru olan, 46, XY CGB'li 20 olgu çalışmaya alındı. "Illumina TruSight Exome" kiti ile"MiSeq" yeni nesil dizi analiz cihazı kullanılarak hedeflenmiş dizi analiz yöntemi uygulandı. Sonuçlar: Olguların 14'ünün ( %66.7) anne ve babası akraba idi. Dokuz ( %45) hastada 4 farklı gende mutasyon saptandı. Altı (%30) hastada HSD17B3 geninde mutasyon gösterildi. Bu mutasyonlar; iki farklı hasta p.Y287X ve 3 farklı hasta ise p.T54A, p.R175T, p.R80Q mutasyonları için homozigot idi. Bir hastada ise birleşik heterozigot p.R80Q/ p.E93K mutasyonu gösterildi. Gonadal disgenezi düşünülen hastalardan birinde WT-1 geninde heterozigot p.P396R, diğer bir hastada ise SRY geninde hemizigot p.Q178X mutasyonları saptandı. Testosteron sentez defekti ön tanısı olan bir hastada ise LHCGR geninde homozigot p.A483D mutasyonu vardı. Saptanan mutasyonların 6'sı daha önce tanımlanmamıştı. In -slico analizlerde tüm mutasyonların hastalık yapıcı olduğu belirlendi. Tanı öncesi hastaların; hastaneye başvuru sayısı 27.4 ± 14.6 kez/ hasta, başvurudan itibaren geçen tanı süresi: 5.9 ±4.1 yıl/hasta, hasta başı harcama : 6191 ± 3001 Türk Lirası idi. Hasta başı HYND ile panel uygulama ile tanı süresi ise yaklaşık 3 gün ile çok kısa ve hasta başı harcama: 2000 Türk Lirası ile çok daha düşük saptandı. Sonuç: Genetik olarak oldukça heterojen olan 46,XY CGB olgularında hedeflenmiş yeni nesil dizi analiz yöntemi moleküler tanı için oldukça hızlı ve ekonomiktir. HSD17B3 gen mutasyonu özellikle akraba evliliğinin fazla olduğu toplumlarda 46,XY CGB'nin sık nedeni olabilir.;46,XY Cinsiyet gelişim bozukluğu, yeni nesil dizi analiz yöntemi, etkinlik, maliyet
Açıklama
Araştırmacılar; R. Damla Gökşen Şimşek, Ferda Özkınay, Hüseyin Onay, Tahir Atik
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2016
Araştırma Projesi -- Ege Üniversitesi, 2016
