Yazar "Pirim, Cansu" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • Küçük Resim
    Öğe
    Astımla ilişkili PHYNI1 geni intron 7 polimorfizmlerinin biyoinformatik analizi
    (Ege Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2019) Pirim, Cansu; Ün, Cemal; Göksel, Özlem
    Astım genetik faktörlerin yanısıra, çevresel etmenlerin tetiklediği epigenetik mekanizmaların aracılık ettiği gen-çevre etkileşimlerine bağlı, solunum yolu obstrüksiyonu ile karakterize kronik inflamatuar bir hastalıktır. Astım hastalığı görülme sıklığı açısından değerlendirildiğinde ise Afrika kökenli bireylerin diğer etnik gruplardan daha yüksek prevalansa sahip olduğu bilinmektedir. Yapılan genom çapında ilişkilendirme çalışmalarında, Afrika kökenli bireylere özgü olarak, sadece PYHIN1 geninde astımla ilişkili tek nükleotit polimorfizmlerine rastlanmıştır. Bu tez çalışmasında; PYHIN1 geninin intron 7 bölgesinde tespit edilen iki farklı polimorfizimi içeren diziler, biyoinformatik araçlar ile Primat Takımında yer alan 11 farklı türde incelenmiş ve mikroRNA dizilerini içeren korunmuş bölgeler belirlenmiştir. Korunmuş bölgelerin referansı eşliğinde; insana ait diziden, uygun saç tokası yapısına ve termodinamik stabiliteye sahip prekürsör miRNA dizileri elde edilmiştir. Naive Bayes Sınıflandırma algoritmasını kullanan MatureBayes programı aracılığıyla pre-miRNA dizilerinden olgun miRNA dizileri tanımlanmıştır ve son olarak bu miRNA'ların hedeflediği genlerin tahminlemesi yapılarak astımla ilişkili olduğu düşünülen genler belirlenmiştir.