Yazar "Pelit, Levent" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 20 / 40
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe A novel approach utilizing rapid thin-film microextraction method for salivary metabolomics studies in lung cancer diagnosis(Elsevier, 2024) Pelit, Fusun; Erbas, Ilknur; Ozupek, Nazli Mert; Gul, Merve; Sakrak, Esra; Ocakoglu, Kasim; Goksel, Ozlem; Pelit, Levent; Goksel, TuncayThis study investigated the potential of targeted salivary metabolomics as a convenient diagnostic tool for lung cancer (LC), utilizing a rapid TFME-based method. It specifically examines TFME blades modified with SiO2 nanoparticles, which were produced using a custom-made coating system. Validation of the metabolite biomarker analysis was performed by these blades using liquid chromatography-tandem mass spectroscopy (LCMS/MS). The extraction efficiencies of SiO2 nanoparticle/polyacrylonitrile (PAN) composite-coated blades were compared for 18 metabolites. Response surface methodology (RSM) was used to optimize the analysis conditions. Linear calibration plots were obtained for all metabolites at concentrations between 0.025 to 4.0 mu g/mL in the presence of internal standard, with correlation coefficients (R-2) ranging from 0.9975 to 0.9841. The limit of detection (LOD) and limit of quantitation (LOQ) were in the range of 0.014 to 0.97 mu g mL(-1) and 0.046 to 3.20 mu gmL(-1), respectively. The %RSD values for all analytes were within the acceptable range (less than 20 %) for the proposed method. The method was applied to the saliva samples of 40 patients with LC and 38 healthy controls. The efficacy of metabolites for LC diagnosis was determined by in silico methods and the results reveal that phenylalanine and purine metabolism metabolites (e.g., hypoxanthine) are of great importance for LC diagnosis. Furthermore, potentially significant biomarker analysis results from the ROC curve data reveal that proline, hypoxanthine, and phenylalanine were identified as potential biomarkers for LC diagnosis.Öğe Adsorptive Cathodic Stripping Voltammetric Determination of Boscalid in the Presence of Cobalt Ions at a Pencil Lead Electrode(Taylor & Francis Inc, 2018) Aydin, Irem; Pelit, Levent; Ertas, F. NilHere is described a novel voltammetric method for boscalid. Boscalid is a broad-spectrum fungicide known to be electrochemically inactive. However, it forms complexes with cobalt(II) through its pyridine carboxamide group that allows its indirect determination by adsorptive cathodic stripping voltammetry after deposition at positive potentials. The catalytic character of the reduction peak at -1.2 V was established by the mechanistic studies. After optimization of the parameters, calibration relationships were obtained at nanomolar concentrations and the method was used to analyze tomato juice and tomato paste with satisfactory recoveries.Öğe Aktif Hava Örnekleme Tekniği ile bazı uçucu organik bileşiklerin ortam havzasında analizi(Ege Üniversitesi, 2019) Pelit, LeventHava örneklerinde uçucu organik bileşiklerin (UOBs) izlenmesi, son yıllarda insana ve çevreye olan zararlı etkileri nedeniyle büyük ilgi görmüştür. Bu çalışmada, hava örneklerinde etil benzen, p-ksilen, m-ksilen, o-ksilen, stiren, p- diklorobenzen, nonanal ve benzaldehit analizi için ucuz bir yöntem geliştirilmiştir. Bu amaçla, adsorbanları hazırlamada başlangıç materyali olarak filtre kahve atıkları kullanıldı. Bu materyale farklı işlemler uygulayarak dört farklı adsorban hazırlandı. Hava örneklerindeki UOBs'in örneklenmesi için bu adsorbanlardan adsorpsiyon tüpleri hazırlandı. Bunun için, uygun miktar adsorbanlardan bir cam tüpün içerisine sıkıca dolduruldu. Daha sonra hava numunelerindeki hedeflenen UOBs adsorpsiyon tüplerinin içinde adsorbe edildi. Adsorpsiyon prosesinden sonra, adsorbe olan hedef UOBs karbondisülfür (CS2) ile elüe edildi ve CS2 fazındaki hedef UOBs'in analizi gaz kromatografi tekniği ile yapıldı. Sonuçlar ticari aktif karbon ile de karşılaştırıldı ve en iyi sonuçlar 200-1 kodlu adsorban ile elde edildi. 200-1 kodlu adsorban kullanılarak oluşturulan yöntemin optimizasyonu gerçekleştirilmiş ve optimum koşullar altında, hedeflenen her UOBs'nin kalibrasyon eğrileri gerçekleştirilmiştir. Her bileşik için tespit sınırı (LOD), niceleme sınırı (LOQ), doğrusal aralık, gün içi tekrarlanabilirliği ve yöntemin günler arası tekrarüretilebilirliği hesaplandı ve kabul edilebilir sonuçlar elde edildi. Önerilen yöntem, hava numunelerinde hedeflenen bileşiklerin analizi için başarıyla uygulandı.;Uçucu Organik Bileşikler, Aktif Hava Örneklemesi, Biyokömür, Adsorpsiyon Tüpü, Hava Ortam Analizi.;Volatile Organic Compounds, Active Air Sampling, Biochar, Adsorption Tube, Air Environment Analysis.Öğe Applications of gas chromatographic methods for breath analysis in diagnosis of human health(Ege Üniversitesi, 2017) Korba, Korcan; Ertaş, F. Nil; Pelit, LeventDünya genelinde her yıl bir milyondan fazla kişi akciğer kanserinden ölmektedir. İnsan nefesi, solunum yolu alveolleri ve kan arasındaki gaz değişimi olması nedeniyle metabolitler ve 200 fazla uçucu organik bileşikler (VOC) içermektedir. Bununla birlikte, derişimleri ppmv-pptv seviyeleri kadar düşüktür, bu yüzden analizden önce VOC'leri önderiştirmek gerekir. Çok yaygın olarak kullanılan yöntemlerinden biri Katı Faza Mikroekstraksiyon (SPME) tekniğidir. GC-MS ile İnsan nefesindeki VOC'lerin kimyasal analizi akciğer kanseri hastalığın teşhisi için yararlı bir metottur. Son zamanlarda yapılan çalışmalar, insan nefesi ve nefes kondenzatı içindeki bazı biyomarkerların geleneksel olanlarla yüksek oranda ilişkili olduğunu göstermektedir. Bu projenin amacı sentetik numunelerde biyomarkerların tespiti için güvenilir ve duyarlı bir kromatografik yöntem oluşturmaktır. İlk olarak bileşiklerin tanımlama çalışmaları yapılmıştır. Bu bağlamda VOC standartları sıvı olarak enjekte edilerek nitel analizi sağlanmış ve gaz karışımı içinde tespit edilmeye çalışılmıştır. Örnekleme çalışmalarının ardından ticari ve lab yapımı SPME fiberler ile kuru hava ortamında bekletilerek, GC-MS ile analiz gerçekleştirilmiş ve fiberlerin analize uygunluğu zemin sinyalleri gözlenerek, incelenmiştir. Ardından, sulu tampon ortamında VOC standartları hazırlanarak, daldırmalı SPME ile analiz gerçekleştirilmiştir. Son olarak nefes kondenzatındaki ileriki çalışmalar için su numunelerinde aseton tepe boşluklu SPME GC-FID ile analizlenmiştir. Kromatografik sinyali etkileyen çok fazla parametreler göz önüne alındığında, analiz koşulları deneysel bir tasarım yöntemi kullanılarak optimize edilmiştir. Sonuç olarak tüm sonuçlar gerçek insan nefesi kondenzat numunelerinde kullanılmak üzere değerlendirilecektir.;Akciğer kanseri, SPME, GC-MS, Aseton, GC-FID, VOC.;Lung Cancer, SPME, GC-MS, Acetone, GC-FID, VOCs.Öğe Biyolojik örneklerde uçucu organik bileşiklerin tayini için iğne tuzaklı sensörlerin geliştirilmesi(Ege Üniversitesi, 2024) Pelit, Levent; Dizdaş, Tuğberk NailSon yıllarda, düşük miktarlardaki solvent tüketimiyle, yeşil analitik tekniklerinin başını çeken katı faza mikroözütleme teknikleri (SPME), özelikle uçucu organik bileşiklerin (VOC) farklı örnekteki analizi için yaygın olarak tercih edilen yöntemlerden birisidir. Mikro boyuttaki adsorban kullanıldığı minyatürize teknikler olarak da nitelenen bu teknikler, polimerin konumlandırıldığı yere göre farklı isimlerle anılmaktadır. İğne tuzaklı adsorbanlar (NTD), polimerin bir iğne içine yerleştirilmesi ile oluşturulduğu ve bu sayede sisteme hem fiziksel bir dayanımının hem de adsorban yüzeyinin miktarının arttırılarak analit-yüzey etkileşimin arttırıldığı duyar örnek hazırlama sistemleridir. NTD'ler ticari olarak sağlananalabileceği gibi, laboratuvar yapımı olarak da hazırlanabilirler. Bu amaçla adsorbanlar bir iğne içerisine doldurulup sabitlenerek veya iğne iç yüzeyi kaplanarak hazırlanabilir. Bu sistemlerin bir analitik cihaz ile kombinasyonu, biyolojik sistemlerde ve hava örneklerinde bu bileşiklerin hızlı bir yanıt alma süresiyle duyar ve seçimli bir tayinine olanak tanımaktadır. Günümüzde yapılan birçok çalışma, hem çevresel örneklerdeki VOC maruziyetinin canlı organizmalarda neden olduğu hastalıkları, hem de bu hastalıkların erken tanılanabilmesi için vücut sıvılarındaki VOC metabolitlerinin analizinde kullanılabilirler. Bu proje kapsamında, biyolojik örneklerdeki farklı fonksiyonel gruplara sahip bileşiklerin, laboratuvar yapımı iğne tuzaklı örnekleme (NTD) sistemleri ile tayini için yöntem geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, elektropolimerizasyon tekniği kullanılarak polianilin, politiyofen, polipirol ve polifuran polimerleri bir iğne iç yüzeyine kaplanarak lab-yapımı NTD'ler hazırlanmıştır. Ardından hazırlanan polimerlerin fiziksel ve kimyasal karakterizasyonları Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopi (FTIR), Termogravimetrik Analiz (TG) gibi analiz yöntemleri ile yapılmıştır. Ardından hazırlanan NTD'ler ile biyolojik örneklerde VOC'lerin analizine geçilmiştir. Ardından bu NTD'ler ile idrar ve nefeste hedef VOC'lerin analizine yönelik metod geliştirilmesi adımına geçilmiştir. Projein ilk bölümünde, NTD sistemlerinin sentetik idrar ortamındaki performansları, farklı fonksiyonel gruplar içeren bileşiklerin analizi için incelenmiş ve en iyi performansı politiyofen kaplı NTD'nin gösterdiği saptanmıştır. Ardından, politiyofen NTD ile hedef analitlerin analizi için yöntemin optimizasyonu yapılarak, geliştirilen yöntemin analitik parametreleri belirlenmiştir. Projein ikinci bölümünde ise, bu kez aynı işlemler nefes örneklerinde hedef analitlerin analizi için tekrarlanmıştır. Bu amaçla sentetik nefes ortamında deneyler yürütülmüştür. En iyi performansı gösteren sistemin polianilin kaplı NTD olduğu bulunmuştur. Bu kısımda ayrıca polianilin kaplama farklı modifikasyonlar ile NTD'ler hazırlanarak hedef analitlerin analizi için performansları test edilmiştir. Bu kısımda en iyi performansı gösteren system TiO2 modifiye poliailin NTD olduğu bulunmuştur. Aynı şekilde bu TiO2 kaplı NTD için de optimizasyon çalışması yapılarak yöntemin analitik özellikleri belirlenmiştir. Projein çalışmasının üçüncü ve son kısmında ise, geliştirilen iğne tuzaklı sistemlerin uçucu organik bileşiklerin voltametrik analizi için bir sensor olarak kullanım koşulları incelenmiştir.Öğe cfDNA in exhaled breath condensate (EBC) and contamination by ambient air: toward volatile biopsies(Iop Publishing Ltd, 2019) Koc, Altug; Goksel, Tuncay; Pelit, Levent; Korba, Korcan; Dizdas, Tugberk N.; Baysal, Ertan; Uzun, Umut C.; Kaya, Ozge Ozer; Ozyilmaz, Berk; Kutbay, Yasar B.; Ozdemir, Taha Resid; Kirbiyik, Ozgur; Erdogan, Kadri M.; Guvenc, Merve Saka; Kocal, Gizem Calibasi; Basbinar, YaseminExhaled breath is a source of volatile and nonvolatile biomarkers in the body that can be accessed non-invasively and used for monitoring. The collection of lung secretions by conventional methods such as bronchoalveolar lavage, induced sputum collection, and core biopsies is limited by the invasive nature of these methods. Non-invasive collection of exhaled breath condensate (EBC) provides fluid samples that are representative of airway lining fluids. Various volatile and nonvolatile biomarkers can be detected in volatile condensates, such as H2O2, nitric oxide, lipid mediators, cytokines, chemokines, DNA, and microRNAs. Studies have examined cell-freeDNA(cfDNA) in plasma samples from non-small-cell lung cancer patients, offering to new insights and fostering development of the liquid biopsy. However, few studies have examined cfDNA in EBC samples. This study examined whether EBC is an appropriate source of cfDNA using housekeeping-gene-specific primer probes and quantitative real-time polymerase chain reaction in healthy subjects. Ambient (room) air is contaminated with DNA, so caution is needed. Preliminary studies indicated that volatile biopsies are becoming an important diagnostic tool in lung cancer.Öğe * Concordance in molecular genetic analysis of tumour tissue, plasma, and exhaled breath condensate samples from lung cancer patients(Iop Publishing Ltd, 2020) Vardarli, Asli Tetik; Pelit, Levent; Aldag, Ceyda; Korba, Korcan; Celebi, Caglar; Dizdas, Tugberk Nail; Goksel, TuncayAim. Lung adenocarcinoma is characterized by poor prognosis and short survival rates. Therefore, tools to identify the tumoural molecular structure and guide effective diagnosis and therapy decisions are essential. Surgical biopsies are highly invasive and not conducive for patient follow-up. To better understand disease prognosis, novel non-invasive analytic methods are needed. the aim of the present study is to identify the genetic mutations in formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue, plasma, and exhaled breath condensate (EBC) samples by next-generation sequencing and evaluate their utility in the diagnosis and follow-up of patients with lung adenocarcinoma. Method. FFPE, plasma, and EBC samples were collected from 12 lung adenocarcinoma patients before treatment. DNA was extracted from the specimens using an Invitrogen PureLink Genomic DNA Kit according to the manufacturer's instructions. Amplicon-based sequencing was performed using Ion AmpliSeq Colon and Lung Cancer Research Panel v2. Results. Genetic alterations were detected in all FFPE, plasma, and EBC specimens. the mutations in PIK3CA, MET, PTEN, SMAD4, and FGFR2 genes were highly correlated in six patients. Somatic and novel mutations detected in tissue and EBC samples were highly correlated in one additional patient. the EGFR p.L858R and KRAS p.G12C driver mutations were found in both the FFPE tissue specimens and the corresponding EBC samples of the lung adenocarcinoma patients. Conclusion. the driver mutations were detected in EBC samples from lung adenocarcinoma patients. the analysis of EBC samples represents a promising non-invasive method to detect mutations in lung cancer and guide diagnosis and follow-up.Öğe Conversion of specific lncRNAs to biomarkers in exhaled breath condensate samples of patients with advanced stage non-small-cell lung cancer(Frontiers Media Sa, 2023) Vardarli, Asli Tetik; Ozgur, Su; Goksel, Tuncay; Korba, Korcan; Karakus, Hardar Soydaner; Asik, Aycan; Pelit, LeventObjectives: Lung cancer (LC) is one of the most prevalent cancers with the highest fatality rate worldwide. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are being considered potential new molecular targets for early diagnosis, follow-up, and individual treatment decisions in LC. Therefore, this study evaluated whether lncRNA expression levels obtained from exhaled breath condensate (EBC) samples play a role in the occurrence of metastasis in the diagnosis and follow-up of patients with advanced lung adenocarcinoma (LA).Methods: A total of 40 patients with advanced primary LA and 20 healthy controls participated in the study. EBC samples were collected from patients (during diagnosis and follow-up) and healthy individuals for molecular analysis. Liquid biopsy samples were also randomly obtained from 10 patients with LA and 10 healthy people. The expression of lncRNA genes, such as MALAT1, HOTAIR, PVT1, NEAT1, ANRIL, and SPRY4-IT1 was analyzed using cfRNA extracted from all clinical samples.Results: In the diagnosis and follow-up of patients with LA, lncRNA HOTAIR (5-fold), PVT1 (7.9-fold), and NEAT1 (12.8-fold), PVT1 (6.8-fold), MALAT1 (8.4-fold) expression levels were significantly higher than those in healthy controls, respectively. Additionally, the distinct lncRNA expression profiles identified in EBC samples imply that decreased ANRIL-NEAT1 and increased ANRIL gene expression levels can be used as biomarkers to predict the development of bone and lung metastases, respectively.Conclusion: EBC is an innovative, easily reproducible approach for predicting the development of metastases, molecular diagnosis, and follow-up of LC. EBC has shown potential in elucidating the molecular structure of LC, monitoring changes, and discovering novel biomarkers.Öğe Determination of mercury bu using dithizone loaded amberlite XAD-7 resin modified carbon paste electrode(Ege Üniversitesi, 2002) Pelit, Levent; Tural, HüseyinCiva(II) nin kimyasal yolla saptanması uzun yıllardır uygulanmaktadır. XAD-7 ağır metalleri adsorplama özelliğine sahiptir fakat Hg(II) için seçimli değildir ve Hg(II) için seçimli olan ditizon la yüklenebilir. İlk olarak, ditizon XAD-7 reçinesine yüklendi ve adsorpsiyon kapasitesi ile hangi tür bağlanmanın olduğu araştırıldı. Daha sonra bu elektrot modifiye karbon pasta elektrodunda modifiye madde olarak kullanıldı ve voltammetrik davranışları incelendi. Bunun için optimum koşullar saptandı. Daha sonra girişimci etkiler incelendi. Sonra bu elektrot XAD-7 modifiye karbon pasta elektrodu ve karbon pasta elektrodu ile optimum koşullarda karşılaştırıldı. Son olarak medium exchange koşullarda kalibrasyon grafiği oluşturuldu ve kalibrasyon grafiğinin regrasyon katsayısı 0.988 olarak bulundu. Ditizon yüklenmiş XAD-7 modifiye karbon pasta elektrodunun belirtme alt sınırı 2x10-7 M civa(II) ve bağıl standart sapma ±6% olarak bulundu.Öğe Development of a new needle trap-based method for the determination of some volatile organic compounds in the indoor environment(Pergamon-Elsevier Science Ltd, 2021) Baysal, Ertan; Uzun, Umut Can; Ertas, Fatma Nil; Goksel, Ozlem; Pelit, LeventVolatile Organic Compounds (VOCs) are a large group of chemicals mostly found in indoor environments such as homes and workplaces. Long term exposure to certain VOCs can cause symptoms in some individuals and therefore, monitoring and controlling air quality can help better manage chronic respiratory diseases. In this study, we aimed to develop an easy-to-use, economical, in house needle trapbased methodology to detect certain VOCs to be used for public and occupational health. For this purpose, a multi-bed (packed with PDMS/Carbopack-X/Carboxen-1000) needle trap device (NTD) was utilized for sampling, enrichment, and injection of the VOCs into the gas chromatography. The performance of the developed method was investigated for the analysis of the group known as BTEX (benzene, toluene, ethylbenzene and xylene). Operational and instrumental parameters such as sampling flow rate and relative humidity, desorption time and temperature were optimized, and the analytical figures of merit of the proposed method have indicated that very low levels of BTEX in air samples can be easily determined by this new method. Overall results have shown that multi-bed NTD offers a high sensitive procedure for sampling and analysis of BTEX in concentration range of 0.002-0.298 mg/m(3) in indoor air. (C) 2021 Elsevier Ltd. All rights reserved.Öğe Development of a new spectrophotometric method for the determination of hydrogen peroxide(Ege Üniversitesi, 2016) Yavuz, Tuğba; Pelit, LeventBu tez gerçek su örneklerinde hidrojen peroksit tayini için spektrofotometrik bir yöntem önermektedir. Bu yöntem hidrojen peroksitin demir(II)-EDTA çözeltisiyle alkali ortamda kompleksleştirilmesine dayanmaktadır.525nm'de maksimum absorbansa sahip olan mor renkli demir(III)-EDTA-perokso kompleksi oluşturularak ölçüm alınmaktadır. Stabilizatör madde ve derişimi, Fe(III), EDTA ve amonyak derişimi gibi çeşitli parametreler 525nm'de sırasıyla;S2O32- 0.05 mol/L, 0.003 mol/L ve 0.05 mol/L ve 5mol/L olarak tespit edildi.Kimyasal reaktiflerineklenme sırası ve analiz süresi de ayrıca optimize edilmiştir. Mor renkli demir(III)-EDTA-peroxo kompleksi oluşumuna dayanan hidrojen peroksit tayin yöntemi 267 Lmol?1 cm?1molar soğurma katsayısına sahiptir ve 5.0 x10-64.08x10-3mol/LaralığındaBeer yasasına uyum göstermektedir.Sandell'sduyarlığı 0.188 ug/cm2 dir.Belirtme sınırı ve saptama sınırı değerleri sırasıyla, 2.5x10-6 ve 8.5x106mol/L'dir.2.0x104mol/LH2O2derişiminde gün içi ve günler arası tekrarlanabilirlik değerleri sırasıyla %1.5 ve %6.1 olarak hesaplanmıştır. Yöntemde ayrıca su örneklerinde yaygın olarak görülen girişimci iyonların etkileri de incelenmiştir.Demir(II) haricinde neredeyse hiçbir iyon yöntemde girişimci etki göstermemiştir,dolayısıyla yöntem ekstra bir örnek hazırlama basamağı gerektirmeden doğal su örnekleri için doğrudan uygulanabilmektedir. Bu tez çalışması kapsamında önerilen yöntem sırasıyla içme suyu,çeşme suyu ve deniz suyu örneklerine uygulanmış ve %90 ve %118 arasında değişen kabul edilebilir geri kazanım değerleri elde edilmiştir.;Hidrojen peroksittayini, Demir(III) peroksokompleksi, spektrofotometri, su analizi.;Determination of hydrogen peroxide, iron(III) peroxo complex, spectrophotometry, water analysis.Öğe Development of a solventless method for the pesticides analysis(Elsevier, 2022) Pelit, Levent; Uzun, Umut Can; Baysal, Ertan; Erbas, Ilknur Bagatir; Pelit, Fusun; Ertas, T. O.; Buszewski, BoguslawThis paper represents the results of a case study investigating the development of a novel, simple, costeffective, solventless and sensitive chromatographic method for the determination of volatile pesticides in aqueous samples by an electrothermally prepared pencil graphite (PG). In this study, PG were conditioned by passing a suitable direct current to activate PG by Joule effect. Conditioned PG was used for the extraction of Chlorpyrifos (CP), which is used as case study. The method was also found successful in the determination of CP in real water samples, providing acceptable recovery values (82-111%). (c) 2021 Elsevier B.V. All rights reserved.Öğe Electrocatalytic oxidation of sodium borohydride on metal ad-atom modified Au(111) single crystal electrodes in alkaline solution(Pergamon-Elsevier Science Ltd, 2011) Karabiberoglu, Sukriye Ulubay; Pelit, Levent; Gelmez, Buket; Dursun, ZekeryaThe electrochemical oxidation of borohydride was investigated by using various ad-atom modified Au(111) electrodes in alkaline media in comparison to Au(111) single crystal, polycrystalline Au, Pt and Zn electrodes. The catalytic activity of gold towards borohydride oxidation has tended to increase in more alkaline media as reflected in the oxidation peak in the concentration range of NaOH (0.01-2.0 M) studied. Additional shift on the oxidation peak potential of borohydride on Pt and Zn ad-atom modified Au(111) electrodes was observed for both ad-atom modified electrodes to more negative potentials compared to that of bare electrodes, respectively. The ad-atom modified Au(111) electrodes surfaces do not only provide a superior electrical contact, but also accelerates electron transfer as proven by the increase in peak current and positive shift in the peak potential. Copyright (C) 2011, Hydrogen Energy Publications, LLC. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.Öğe Electrochemically Fabricated Solid Phase Microextraction Fibers and their Applications in Food, Environmental and Clinical Analysis(Bentham Science Publ Ltd, 2019) Pelit, Levent; Pelit, Fusun; Ertas, Hasan; Ertas, Fatma NilBackground: Designing an analytical methodology for complicated matrices, such as biological and environmental samples, is difficult since the sample preparation procedure is the most demanding step affecting the whole analytical process. Nowadays, this step has become more challenging by the legislations and environmental concerns since it is a prerequisite to eliminate or minimize the use of hazardous substances in traditional procedures by replacing with green techniques suitable for the sample matrix. Methods: in addition to the matrix, the nature of the analyte also influence the ease of creating green analytical techniques. Recent developments in the chemical analysis provide us new methodologies introducing microextraction techniques and among them, solid phase microextraction (SPME) has emerged as a simple, fast, low cost, reliable and portable sample preparation technique that minimizes solvent consumption. Results: the use of home-made fibers is popular in the last two decades since the selectivity can be tuned by changing the surface characteristics through chemical and electrochemical modifications. Latter technique is preferred since the electroactive polymers can be coated onto the fiber under controlled electrochemical conditions and the film thicknesses can be adjusted by simply changing the deposition parameters. Thermal resistance and mechanical strength can be readily increased by incorporating different dopant ions into the polymeric structure and selectivity can be tuned by inserting functional groups and nanostructures. A vast number of analytes with wide range of polarities extracted by this means can be determined with a suitable chromatographic detector coupled to the system. Therefore, the main task is to improve the physicochemical properties of the fiber along with the extraction efficiency and selectivity towards the various analytes by adjusting the electrochemical preparation conditions. Conclusion: This review covers the fine tuning conditions practiced in electrochemical preparation of SPME fibers and in-tube systems and their applications in environmental, food and clinical analysis.Öğe Fabrication of a newly lab-made SPME fiber coated with TiO2 nanowire/GO nanocomposite for determination of BTEX from real water samples(Elsevier, 2024) Sehati, Negar; Dizdas, Tugberk Nail; Bolat, Serkan; Okcu Pelit, Fusun; Rasoulifard, Mohammad Hossein; Pelit, LeventIn this study, a lab-made, low cost and convenient solid phase microextraction (SPME) fiber was successfully fabricated and applied for the simultaneous determination of benzene, toluene, ethylbenzene and xylenes (BTEX) in water samples by headspace (HS) SPME method. The as-made fiber was prepared by coating a stainless steel wire with one of the attractive conformations of TiO2 nanoparticles, namely titanium dioxide nanowire/reduced graphene oxide (TiO2 NWs/RGO). The as-synthesized nanocomposite was characterized with field emission scanning electron microscopy (FESEM), Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR), and X-ray diffraction (XRD) analysis respectively. A Taguchi experimental method with an L16 (45) design was successfully used to optimize the influencing HS-SMPE extraction parameters including extraction time, sample volume, salt effect, heating temperature and pH. Under the optimized conditions, good linearity was observed in the range of 5.0-193.0 ng/mL for all the BTEX compounds, with the correlation coefficients ranging from 0.9901 to 0.9962. The method also demonstrated a high reliability with low limits of detections (LODs) ranging from 5.0 to 11.5 ng/mL and limits of quantification (LOQs) ranging from 16.5 to 34.4 ng/mL, with good repeatability as indicated by RSD% values of less than 12 % (n = 5). The proposed method is simple and rapid, and also provides a much more accurate and sensitive detection platform for the BTEX analysis in real water samples, even by the conventional analytical instruments such as gas chromatography coupled with flame ionization detector.Öğe Graphene oxide reinforced nanocellulose/leather waste-based biopolymer nano compounds for possible bioenergy production(Elsevier, 2022) Senthil, Rethinam; Sumathi, Vijayan; Pelit, Levent; Kavukcu, Serdar-Batikan; Hayati, Turkmen; Vedakumari, S-Weslen; Lakshmi, ThangaveluIn this study, a blend of graphene oxide (GO), leather waste (leather sludge(LS)/leather fleshings (LF)), nano-cellulose (nano-C) (biopolymer), and glycerol (Gly) homogeneously in alkaline aqueous solution is used to produce biopolymer blended solution (BBS), by chemical polymerization, for use in bioenergy. The efficient and eco-friendly BBS was characterized by its physicochemical and electrical conductivity properties. The BBS achieved the highest current density energy value (0. 53 mA cm-2) at 1. 2 V. The results of the research show the significance of evaluating bioenergy technological environmental performance from comparable perspectives to examine and identify environmental exchange from existing bioenergy developments.Öğe A green photometric method for determination of mercuric ions in saline samples by a single-drop microextraction technique(Royal Soc Chemistry, 2014) Pelit, Levent; Bagatir, Ilknur; Pelit, Fusun Okcu; Ertas, F. NilThis study describes a rapid, simple and sensitive spectrophotometric method for determination of Hg(II) ions in saline samples by a single-drop microextraction (SDME) technique. The method is based on the extraction of dithizone (DTZ) complex of mercury(II) into an undecanol droplet which serves as the organic phase, and then the absorbance of the colored complex is measured at 490 nm by using a microvolume quartz cuvette. This procedure provides a simple, rapid, cost-efficient and, most of all, a green method for detecting mercuric ions by minimizing the organic solvent consumption. A variety of parameters affecting the signal, such as pH, DTZ concentration, sample and extraction solvent volume, extraction time and temperature and salt effects were optimized. Under optimized conditions the linear range was found between 3.2 x 10(-8) and 5.0 x 10(-7) mol L-1 (6.4-100.8 mu g L-1) and the detection limit was calculated as 9.6 x 10(-9) mol L-1 (1.9 mu g mL(-1)) attained by a high enrichment factor of 203. The performance and accuracy of the method were compared with those of atomic fluorescence spectrometry. Validation of the proposed method was performed for determination of mercury in saline samples including sea water, mineral water, thermal spring water, and table and rock salt samples, which is difficult to analyze by conventional methods.Öğe Hava örneklerindeki kimi uçucu organik bileşiklerin dispersif sıvı-sıvı mikro-özütleme tekniği ile analizi(Ege Üniversitesi, 2019) Pelit, LeventHava örneklerinde uçucu organik bileşiklerin (VOCs) izlenmesi, son yıllarda insana ve çevreye olan zararlı etkileri nedeniyle büyük ilgi görmüştür. Bu çalışmada, hava örneklerinde benzen, toluen, etil benzen, p-ksilen ve o-ksilen analizi için düşük maliyetli ve basit bir yöntem geliştirilmiştir. Bu amaçla, hazırlanan gaz örnekleri öncelikle, içerisine ekstraksiyon çözeltisi disperse edilmiş sulu çözelti içerisinden bir vakum pompası kullanılarak geçirilmiş ve analitlerin organik faz içerisine transfer edilmesi sağlanmıştır. Bu prosesden sonra, santrifüj işlemi gerçekleştirilerek organik fazdaki ekstraksiyon solventinin ayrılması sağlanmış ve bu kısım insert vialler kullanılarak GC-FID sistemine enjekte edilmiştir. Ekstraksiyon solventi olarak 1-undekanol, 1-dodekanol, hekzan, karbondisülfür, tetrakloroetilen ve nitrobenzen denenmiş ve yapılan çalışmalar sonucunda en iyi verim alınan solvent nitrobenzen olarak belirlenmiştir. Nitrobenzen kullanılarak oluşturulan yöntemin optimizasyonu gerçekleştirilmiş ve optimum koşullar altında, hedeflenen her VOCs nin kalibrasyon eğrileri gerçekleştirilmiştir. Hedef VOC'ler için yöntemin analitik parametreleri belirlenmiştir.;Uçucu Organik Bileşikler, Hava Örneği Analizi, Dispersiv Sıvı-Sıvı Mikro Özütleme, BTEX.;Volatile Organic Compounds, Air Sample Analysis, Dispersive Liquid Liquid Microextravtion, BTEX.Öğe Hava örneklerindeki uçucu organik bileşiklerin metal oganik kafes yapılar ile tayini(Ege Üniversitesi, 2023) Pelit, Levent; Bolat, SerkanKatı faz mikroözütleme tekniği (SPME), uçucu organik bileşiklerin (UOB) analizinde yaygın olarak kullanılan yöntemlerden biridir. Hedeflenen bileşiklere göre SPME fiberinin adsorban malzemeleri değiştirilerek daha duyar sonuçlar elde edilebilir. Ticari fiberlerin sınırlı ömürleri, hedeflenen analitlere karşı düşük seçicilikleri ve yüksek maliyetleri gibi dezavantajları nedeniyle yeni fiberlerin geliştirilmesi çok önemli bir konudur. Literatür çalışmaları, iç ortamlardaki UOB konsantrasyonlarının genellikle dış ortamlara göre daha yüksek olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, iç ortamdaki zararlı UOB'lerin basit, hızlı ve etkili bir şekilde izlenmesi çok önemlidir. Benzen, toluen, etilbenzen, o-ksilen, p-ksilen ve m-ksilen bileşikleri iç ortamlarda en sık karşılaşılan bileşiklerdir ve BTEX kısaltması ile bilinirler. BTEX'lerin insan sağlığı üzerinde olumsuz etkileri vardır ve kapalı ortamlardaki seviyelerinin etkin bir şekilde izlenmesi önerilir. Bu amaçla halihazırda farklı SPME fiberleri kullanılmaktadır ve BTEX'in izlenmesi için yeni fiberlerin geliştirilmesi oldukça önemlidir. Bu projede, iç ortamlarda BTEX tayini için metal organik kafes yapılar ile hazırlanan yeni SPME fiberlerinin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla MOF-801 malzemesi sentezlendi ve paslanmaz çelik tel üzerine ısıya dayanıklı epoksi yapıştırıcı ile kaplandı. Sentezlenen MOF-801 ve MOF-801 kaplı SPME fiberin fiziksel ve kimyasal karakterizasyonu Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopi (FTIR), Termogravimetrik Analiz (TGA), X-Işını Kırınım Yöntemi (XRD) ve BET (Brunauer-Emmett-Teller Yöntemi) ile yapılmıştır. MOF kaplı fiber tarafından hava numunelerinde BTEX'in belirlenmesi için yöntem geliştirilmesi çalışmaları gaz kromatografisi-kütle spektroskopisi (GC-MS) ile gerçekleştirildi. Desorpsiyon sıcaklığı ve süresi, adsorpsiyon süresi, adsorpsiyon sıcaklığı ve numune hacmi gibi yöntem parametreleri optimize edildi. Optimum desorpsiyon sıcaklığı ve süresi 250ºC ve 3 dakika olarak bulundu. Örnekleme aşamasından önce SPME fiberinin 250ºC'de 15 dakika şartlandırılması gerektiği bulunmuştur. Optimum adsorpsiyon süresi ve numune hacmi sırasıyla 10 dakika ve 1 L olarak bulunmuştur. Deneysel sonuçlar, geliştirilen fiber ile BTEX örneklemesinin 15ºC ile 35ºC arasında yapılabileceğini göstermektedir. Nem, BTEX'in tespit edilmesinde ciddi bir engelleyici etkiye sahiptir ve bu nedenle etkin bir şekilde kontrol edilmelidir. Optimum koşullar altında, hedeflenen bileşiklerin kalibrasyon eğrileri oluşturulmuş ve saptama limiti (LOD), lineer aralık, gün içi ve günler arası tekrarlanabilirlik ve ayrıca fiberden fibere tekrarlanabilirlik gibi validasyon parametreleri 12, 4 - 48, 3 ?g/ m3, 41, 3-17660 ?g/m3, %2, 66-4, 05, %3, 77-6, 34 ve %7, 51-11, 17 olarak bulunmuştur. Geliştirilen yöntemle iç ortam havasında BTEX analizi kabul edilebilir geri kazanım değerleri ile başarıyla gerçekleştirilmiştir.;Metal organik kafes yapılar, MOF-801, BTEX, katı faza mikroözütleme fiberi, iç ortam hava analizi.;Metal organic frameworks, MOF-801, BTEX, solid phase microextraction fiber, indoor air analysis.Öğe Identification of volatile biomarkers in exhaled breath by polythiophene solid phase microextraction fiber for disease diagnosis using GC-MS(Elsevier, 2024) Pelit, Fusun; Goksel, Ozlem; Dizdas, Tugberk Nail; Arin, Aycan; Ozgur, Su; Erbas, Ilknur; Pelit, Levent; Gursoy, Arif; Ordin, Burak; Karakus, Haydar Soydaner; Ertas, Fatma Nil; Goksel, TuncayThe diagnosis of diseases through monitoring of volatile organic compounds (VOCs) in exhaled breath (EB) holds great potential for clinical applications. However, a standardized method for VOC analysis in EB yet to be proposed. The present study presents an untargeted method for screening and identifying potential volatile biomarkers in EB by a lab-made solid phase microextraction (SPME) fiber. A polythiophene-based SPME fiber was produced by an electrochemical method and VOC sampling was performed under dynamic and controlled conditions. Following the sampling step, the adsorbed VOCs on the SPME fiber were analyzed using gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). The VOCs in EB were screened by the MS detector in selected ion monitoring (SIM) mode within the mass/charge (m/z) range of 13-94 values. Potential biomarkers among all detected VOCs in each subject's EB sample were identified through machine learning algorithms, employing a comparative analysis of distinctive retention times (RT) and peak areas between the lung cancer (LC) and control groups in two stages. In the initial stage of the study, the areas of all peaks observed in the SIM-GC-MS chromatograms of 25 LC and 51 control group subjects were integrated, and the resulting retention times and peak areas were recorded for subsequent analysis to identify potential biomarkers. A total of 1.346 distinct compounds were detected among the 76 subjects in this step, and statistical analysis using the LightGBM algorithm revealed the potential biomarkers for LC diagnosis. The PTh-SPME fibre successfully identified four novel cancer biomarkers in breath matrix: 4-heptenal, 4-methyl-1-octene, 1,2,3,4-tetrahydro-5,8-dimethyl-1-octylnaphthalene and tetrahydro-2-(2,5-undecadiynyloxy)-2H-pyran. In the second step of the study, the efficacy of the top ten selected biomarkers was evaluated in a cohort of 166 subjects, including 70 individuals with LC and 96 in the control group. The model achieved accuracy, area under the curve (AUC), and F Score values of 0.818, 0.816, and 0.817, respectively. The test model correctly predicted 27 out of 33 subjects between LC and control groups.
