Yazar "Göker Bağca, Bakiye" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • Küçük Resim
    Öğe
    Paranazal sinüs karsinogenezinde tedavi hedefi oluşturabilecek genomik profilin belirlenmesi
    (Ege Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2021) Göker Bağca, Bakiye; Avcı, Çığır Biray
    Paranazal sinüs kanserleri tüm kanserlerin yaklaşık %0,2’sini oluşturan nadir bir kanser türüdür. Beş yıllık sağ kalım oranı %50’nin altında olan bu kanser türü için bilinen herhangi bir moleküler belirteç veya tedavi hedefi bulunmamaktadır. Çalışmanın hipotezi, paranazal sinüs kanserlerinin altında bir genetik profilin olduğudur. Bu doğrultuda tez çalışmasının amacı, genetik bilginin çok az olduğu paranazal sinüs kanserlerinin moleküler yapısının belirlenebilmesi ve olgularda benzer şekilde görülen moleküler yapının aydınlatılabilmesidir. Bu amaç ve hipotez doğrultusunda, paranazal sinüs tümörlü 30 olgudan alınan tümör dokusundan izole edilen DNA örnekleri kullanılarak yeni nesil sekanslama yöntemi ile olgulardaki varyasyonlar belirlenmiştir. Belirlenen varyantlar biyoinformatik yazılımlar ve veri tabanları aracılığıyla değerlendirilmiş, patojenik ya da olası patojenik özellikteki mutasyonların olası etkinlikleri farklı tahminleme araçları kullanılarak belirlenmiştir. Yeni nesil sekanslama analizi sonucunda 30 olguda toplam 28.420 adet varyant (11.353 eşsiz varyant) tanımlanmıştır. Bu varyantların %10’u daha önceden tanımlanmış olmakla birlikte yaklaşık %90’ı ilk defa tanımlanmış varyantlardan oluşmaktadır. Ekzon bölgelerinde patojenik ve olası patojenik özelliğe sahip 1.747 adet eşsiz varyant literatürde ilk defa tanımlanmıştır. Gen düzeyinde değerlendirildiğinde ERBB2 geninde en fazla sayıda varyant, patojenik ve olası patojenik özellikte varyant belirlenmiştir. Olguların tümünde en az bir tane patojenik veya olası patojenik EGFR varyasyonu belirlenmiştir. Varyant sıklığı olarak EGFR geninin p.L799P ve p.Y801* mutasyonları en yüksek sayıda belirlenen patojenik ya da olası patojenik özellikteki varyantlardır. Ayrıca TP53 geninin 5’UTR ve promotör, KRAS’ın 3’UTR bölgelerinde sık olarak varyasyonlar belirlenmiştir. Sonuçlar değerlendirildiğinde paranazal sinüs skuamöz hücreli karsinomunda EGFR, ERBB2, PIK3CA ve TP53 genlerinde sürücü mutasyonların bulunduğu saptanmıştır. Özellikle EGFR geninin 28 olguda saptanan p.L799P ve p.Y801* mutasyonları ve yine olguların neredeyse tamamında belirlenen ERBB2 ve PIK3CA genlerinin katalitik aktivitesinin artışına neden olacak mutasyonların hastalığın sürücü mutasyonları arasında yer alabileceği belirlenmiştir. Ayrıca TP53 geninin promotör bölgesinde olguların tamamında belirlenen bağlanma dizi mutasyonları da genin ekspresyonunun engellenmesine neden olarak kanser başlangıcında rol oynama potansiyeli taşıyabileceği şeklinde değerlendirilmiştir. Tez çalışmalarından elde edilen verilerin, genetik bilginin çok kısıtlı olduğu paranazal sinüs kanserleri hakkında bilimsel literatüre katkı sağlamasını ve ileri araştırmaların yolunu açmasını umut etmekteyiz.