Yazar "Canbay, Erhan" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 20 / 27
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Biotransformation of propolis phenols by L-plantarum as a strategy for reduction of allergens(Korean Society Food Science & Technology-Kosfost, 2018) Yildirim, Hatice Kalkan; Canbay, Erhan; Ozturk, Sahin; Aldemir, Ozan; Sozmen, Eser Y.Propolis is a natural product produced by honeybees. It has antioxidant effects as well as antimicrobial, antiseptic, antibacterial, anti-inflammatory and antimutagenic properties. Except these important healthy properties some cytotoxic effects causing allergies also have been reported. In this study have been evaluated changes of phenolic compounds including allergens molecules found in propolis. Before biotransformation, propolis samples were treated with different solvent (ethanol and polyethylene glycol) to facilitate solvation of solid samples. Biotransformation was done by three different strains of Lactobacillus plantarum (10, 8014, ATCC). Results demonstrated the importance of used solvent/treatment for extraction procedure and strains of L. plantrum. The lowest values of main allergens were determined as 321ng/mL for BCAFE, 320ng/mL for 1.1 DMAECAFE and 8.02ng/mL for CAPE. The study is the first work deal with evaluation of bioconversion of propolis by different L. plantarum strains and their effects on phenolic profile.Öğe Çok duvarlı karbon nanotüp nafyon sisteamin modifiye tirozinaz biyosensörü tasarımı ve dopamin tayinine adaptasyonu(Ege Üniversitesi, 2013) Canbay, Erhan; Akyılmaz, ErolBu tez çalışmasında biyosensör teknolojisine yeni ve orijinal bir bakış açısı getiren dopamin tayinine yönelik, çok duvarlı karbon nanotüp (MWCNT)-nafyon-sisteamin (CA) modifiye tirozinaz biyosensörü geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu biyosensör sisteminde sisteaminle altın elektrot (Au) yüzeyinde kendiliğinden oluşan tek tabaka oluşturuldu (SAM). Çok duvarlı karbon nanotüp-nafyon-tirozinaz karışımı altın/sisteamin elektrot yüzeyine damlatılarak Au/CA/MWCNT-Nafyon-Tirozinaz modifiye sistemi oluşturulur. Tasarlanan biyosensör sistemiyle dopamin ölçümleri 0,2 V'ta amperometrik metotla yapılmıştır. Dopamin konsantrasyonuyla doğru orantılı olarak artan akım değerlerinden çıkılarak tayin yapılmıştır. Ayrıca çalışmada dopamin tayini (0,4)-(-0,15) V potansiyel aralığında differansiyel puls (DP) metodu kullanılarak da yapılmıştır. Hazırlanan biyosensörün optimizasyon çalışmalarında öncelikle optimum SAM oluşum süresi, optimum MWCNT miktarı, optimum tirozinaz enzimi aktivitesi gibi parametreler çalışıldı. Çalışma koşullarının optimizasyonunda pH optimizasyonu ve sıcaklık optimizasyonu gerçekleştirildi. Biyosensörün karakterizasyon çalışmalarında dopamin için doğrusal tayin aralığı, tekrarlanabilirlik, substrat spesifikliği, girişim etkisi ve depo kararlılığı gibi parametreler araştırılmıştır. Optimizasyon çalışmaları sonucunda dopamin biyosensörü için en uygun sisteaminde bekletme süresi, MWCNT miktarı, enzim aktivitesi sırasıyla, 2 saat, 10 mg/ml, 75 U/ml bulunmuştur. Çalışma koşullarının optimizasyonu amacıyla yapılan denemelerde dopamin biyosensörü için çalışma tamponu olarak 50 mM pH 7,5 fosfat tamponu ve çalışma sıcaklığı olarak 35oC bulunmuştur. Geliştirilen biyosensör için yapılan karakterizasyon çalışmalarında ise 0,05 - 100 M aralığında dopamin için doğrusal sonuçların alındığı belirlenmiştir. Tekrarlanabilirlik denemelerinde (n=15) 1 M dopamin konsantrasyonunda ortalama değer( ) , standart sapma (S.S), % varyasyon katsayısı (% V.K) sırasıyla 1.026 M, 0.03975 ve = % 3.8 olarak bulunmuştur. Ayrıca geliştirilen biyosensörle ilaç ve muz örneklerinde dopamin tayini de yapılmıştır.;Çok duvarlı karbon nanotüp, nafyon, sisteamin, tirozinaz, dopamin, biyosensör.;Multiwalled carbon nanotube, nafion, cysteamine, tyrosinase, dopamine, biosensor.Öğe Çok duvarlı karbon nanotüp nafyon sisteamin modifiye tirozinaz biyosensörü tasarımı ve dopamin tayinine adaptasyonu(Ege Üniversitesi, 2013) Canbay, Erhan; Akyılmaz, ErolBu tez çalışmasında biyosensör teknolojisine yeni ve orijinal bir bakış açısı getiren dopamin tayinine yönelik, çok duvarlı karbon nanotüp (MWCNT)-nafyon-sisteamin (CA) modifiye tirozinaz biyosensörü geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu biyosensör sisteminde sisteaminle altın elektrot (Au) yüzeyinde kendiliğinden oluşan tek tabaka oluşturuldu (SAM). Çok duvarlı karbon nanotüp-nafyon-tirozinaz karışımı altın/sisteamin elektrot yüzeyine damlatılarak Au/CA/MWCNT-Nafyon-Tirozinaz modifiye sistemi oluşturulur. Tasarlanan biyosensör sistemiyle dopamin ölçümleri 0,2 V'ta amperometrik metotla yapılmıştır. Dopamin konsantrasyonuyla doğru orantılı olarak artan akım değerlerinden çıkılarak tayin yapılmıştır. Ayrıca çalışmada dopamin tayini (0,4)-(-0,15) V potansiyel aralığında differansiyel puls (DP) metodu kullanılarak da yapılmıştır. Hazırlanan biyosensörün optimizasyon çalışmalarında öncelikle optimum SAM oluşum süresi, optimum MWCNT miktarı, optimum tirozinaz enzimi aktivitesi gibi parametreler çalışıldı. Çalışma koşullarının optimizasyonunda pH optimizasyonu ve sıcaklık optimizasyonu gerçekleştirildi. Biyosensörün karakterizasyon çalışmalarında dopamin için doğrusal tayin aralığı, tekrarlanabilirlik, substrat spesifikliği, girişim etkisi ve depo kararlılığı gibi parametreler araştırılmıştır. Optimizasyon çalışmaları sonucunda dopamin biyosensörü için en uygun sisteaminde bekletme süresi, MWCNT miktarı, enzim aktivitesi sırasıyla, 2 saat, 10 mg/ml, 75 U/ml bulunmuştur. Çalışma koşullarının optimizasyonu amacıyla yapılan denemelerde dopamin biyosensörü için çalışma tamponu olarak 50 mM pH 7,5 fosfat tamponu ve çalışma sıcaklığı olarak 35oC bulunmuştur. Geliştirilen biyosensör için yapılan karakterizasyon çalışmalarında ise 0,05 - 100 μM aralığında dopamin için doğrusal sonuçların alındığı belirlenmiştir. Tekrarlanabilirlik denemelerinde (n=15) 1 μM dopamin konsantrasyonunda ortalama değer( x ) , standart sapma (S.S), % varyasyon katsayısı (% V.K) sırasıyla 1.026 μM, ± 0.03975 ve = % 3.8 olarak bulunmuştur. Ayrıca geliştirilen biyosensörle ilaç ve muz örneklerinde dopamin tayini de yapılmıştır.Öğe The decision making levels of urine tetrasaccharide for diagnosisof Pompe disease(2019) Canbay, Erhan; Vural, Melisa; Uçar, Sema Kalkan; Sezer, Ebru; Yüceyar, Ayşe Nur; Karasoy, Hatice; Çoker, Mahmut…Öğe The decision-making levels of urine tetrasaccharide for the diagnosis of Pompe disease in the Turkish population(Walter De Gruyter Gmbh, 2020) Canbay, Erhan; Vural, Melisa; Ucar, Sema Kalkan; Sezer, Ebru Demirel; Karasoy, Hatice; Yuceyar, Ayse Nur; Sozmen, Eser YildirimBackground: Recently, urinary excretion of the tetrasaccharide 6-alpha-D-glucopyranosyl-maltotriose (Glc4) has been proposed as a marker for the diagnosis and monitoring of Pompe disease (PD). We aimed to determine the reference intervals and reliable decision-making levels of urine tetrasaccharide concentrations for the diagnosis of infantileand late-onset Pompe patients in the Turkish population. Methods: in this study, nine patients with PD (five of them with late-onset PD [LOPD]) and 226 healthy individuals (aged 0-64 years) were included. Urine Glc4 concentrations were determined using the ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) tandem mass spectrometry (MS/MS) method. Results: Our data showed that the urine tetrasaccharide levels decreased with age in healthy individuals (p < 0.001, r = -0.256). It was higher especially during the first year of life compared to that in the elder subjects. the tetrasaccharide level of Pompe patients was higher compared to that of healthy controls of the same age: 99 +/- 68 mmol/mol creatinine for infantile onset vs. 4.0 +/- 3.0 mmol/mol creatinine for healthy controls of the same age group and 12.1 +/- 17.4 mmol/mol creatinine for late onset vs. 1.7 +/- 1.2 mmol/mol creatinine for healthy controls of the same age group. Conclusions: the results of this study showed that the reference intervals of tetrasaccharide in urine changed over time; therefore, it is critically important to define agebased decision levels for the diagnosis of LOPD.Öğe Design of a multiwalled carbon nanotube-Nafion-cysteamine modified tyrosinase biosensor and its adaptation of dopamine determination(Academic Press Inc Elsevier Science, 2014) Canbay, Erhan; Akyilmaz, ErolIn this work, a multiwalled carbon nanotube (MWCNT)-Nafion-cysteamine (CA) modified tyrosinase biosensor brings a new and original perspective to biosensor technology intended for the development of dopamine determination. Dopamine measurements were done at 0.2 V with the amperometric method by the developed biosensor system. In addition, in this study dopamine determination was carried out by using the differential pulse voltammetry method between potentials of 0.4 and -0.15 V. In the optimization studies of the biosensor, some parameters such as optimal pH, optimal temperature, optimal enzyme amount, and effect of MWCNT concentration were investigated. Afterward, in the characterization studies, some parameters such as linearity and reproducibility were determined. In the reproducibility experiment, an average value of 1.026 mu M, a standard deviation of +/- 0.03975, and a coefficient of variation of 3.8% were determined for a 1-mu M dopamine concentration (n = 15). Determination of dopamine was carried out in drug samples by the developed biosensor. (C) 2013 Elsevier Inc. All rights reserved.Öğe Development An Amperometric Microbial-Enzyme Hybrid Cholesterol Biosensor Based On Ionic Liquid MWCNT Carbon Paste Electrode(Wiley-V C H Verlag Gmbh, 2021) Canbay, Erhan; Yasa, Ihsan; Akyilmaz, ErolIn this study we report the development of an amperometric cholesterol biosensor based on cholesterol oxidase from Pseudomonas sp. and catalase immobilized in carbon paste electrode (CPE) modified with multiwall carbon nanotubes (MWCNT) and ionic liquid (IL). The working electrode (CPE/MWCNT-IL/Microorganism (MO)-Catalase) was characterized by impedance spectroscopy and cyclic voltammetry at different stages of its construction. This proposed cholesterol biosensor performed linear relationship in the range of 5-600 mu M with a low detection limit of 1.52 mu M. The biosensor showed good sensitivity and high selectivity and it was successfully applied for the measurement of cholesterol levels in lyophilized serum samples.Öğe Development of a New Amperometric Biosensor for Measurement of Plasma Galactose Levels(Amer Chemical Soc, 2024) Canbay, Erhan; Sezer, Ebru; Canda, Ebru; Yazici, Havva; Ucar, Sema Kalkan; Coker, Mahmut; Sozmen, Eser YildirimGalactosemia is an inherited disease that occurs as a result of insufficient or no synthesis of some enzymes (GALT, GALK, and GALE) in galactose metabolism. Failure to make an early diagnosis, especially in newborns, can lead to severe clinical and even fatal consequences. The aim of this study is to develop a biosensor for measuring free galactose in plasma. The immobilization components of the developed free galactose biosensor are screen printed carbon electrode (SCPE), Prussian blue (PB), chitosan (CHIT), Nafion (NAF), gold nanoparticle (GNP), and galactose oxidase (GaOX). The CHIT/GaOX/NAF-GNP/GaOX/CHIT-GNP/SCPE-PB electrode showed a sensitive amperometric response to detect galactose. While the surface characterization of the biosensor was performed with cyclic voltammetry and scanning electron microscopy, the optimization and performance characterizations were made by applying an amperometry technique. The amperometric operating potential for the free galactose biosensor was determined as -0.05 V. The linear detection range for the free galactose biosensor is between 0.025 and 10 mM. This range includes galactose levels in plasma of both healthy and patients. The percent coefficient of variation values calculated for intraday and interday repeatability of the developed biosensor are below 10%. The practical use of the biosensor, for which optimization and characterization studies were carried out, was tested in 10 healthy 11 patients with galactosemia, and the results were compared with the colorimetric method. In conclusion, the unique analytical properties and effortless preparation of the new galactose biosensor developed in this study make them serious candidates for point-of-care diagnostic testing.Öğe Development of an analytical method for determination of urine 3-phenylpyruvic acid based on liquid-liquid extraction and LC-MS/MS(2024) Canbay, Erhan; Canbay, Zeynep Çelik; Yeşilyurt, Berrak; Doğan, Serçin; Arabaci, İrem; Sezer, Ebru Demirel; Sözmen, EserAim: The aim of this study is to develop a rapid, precise, specific LC-MS/MS method for the determination of 3-phenylpyruvic acid, which has an important place in the diagnosis of phenylketonuria, a metabolic disease resulting from Phenylalanine Hydroxylase Enzyme deficiency. Materials and Methods: Analytical measurements were made with Acquity UPLC MS MS (Waters Xevo TQD). The chromatographic separation was operated on an Acquity UPLC Phenyl column (50 mm × 2.1 mm, 1.7 ?m) with gradient elution using 0.1% formic acid containing water and methanol as the mobile phase. Within the scope of the study, firstly, sample preparation steps were focused, and dispersive liquid-liquid extraction and traditional liquid extraction methods were examined. The best results were obtained in the conventional liquid-liquid extraction method, in which dichloromethane was used as the extraction solvent. Furthermore, trans-cinnamic acid molecule was used as an internal standard for the determination of 3-Phenylpyruvic acid in this study and tested according to the validation steps. Results: The linear range of the developed LC MS MS method was found to be between 0.009-5 ?M, while the detection limit was found to be 0.001 ?M. Intraday repeatability was below 7% for 3 levels, and interlay repeatability was below 10%. In the recovery trial, which showed the accuracy of the method, the results in the urine sample for 3 levels were in the range of 97%-103%, and there was no significant ion suppression in the matrix effect trial, which showed how clean the final matrix obtained as a result of the sample preparation steps was. Conclusion: As a result, a fast, inexpensive LC-MS/MS method has been developed for 3-Phenylpyruvic acid.Öğe Effect of Different Extraction Techniques on Anti-Inflammatory Activity of Propolis(2017) Durmaz, B; Dündar, Ezgi; Canbay, Erhan; Mehmedov, Hikmet; Yıldırım, Hatice Kalkan; Sözmen, Eser…Öğe The effect of Glycyrrhiza glabra (Licorice root) extracts on inhibition of 3Clpro(2024) Canbay, Erhan; Kocamanoğlu, Meltem; Fedacı, Cemrehan; Copur, Oznur; Unlu, Murat; Akcay, Yasemin; Sozmen, Eser YıldırımAim: SARS-CoV-2 virus causes COVID-19, a disease characterised by high mortality rates and severe symptoms such as acute respiratory failure. Specific natural compounds with flavonoid structures have been shown to inhibit 3-chymotrypsin-like protease (3-CLpro), which is crucial for the replication of SARS-CoV-2. Flavonoids interact with the active site of the enzyme, leading to inhibition. The aim of this study was to determine the inhibitory concentrations of flavonoid molecules on 3-CLpro and to obtain the most effective licorice (Glycyrrhiza glabra L.) extracts rich in these molecules. Materials and Methods: For the extraction of active compounds, 5 different methods were used: ethanol soaking, soaking in water, boiling in water, microwave assisted extraction and ultrasonic assisted extraction. The concentrations of active compounds were determined by LC-MS/MS method. Antioxidant, anti-inflammatory and 3 Clpro inhibition capacities of the extracts were determined by colourimetric methods. Results: Especially ethanol extracts of liquorice root showed the highest TEAC, FRAP and DPPH levels when evaluated in terms of antioxidant parameters. The strongest 3-CLpro enzyme inhibitory effects were observed in liquorice root extracts obtained by soaking at 80 °C for 6 h, ultrasound assisted soaking for 20 min, soaking in water at 40 °C for 24 h, soaking in 60% ethanol and soaking in 80% ethanol. It was determined that liquorice showed an inhibitory effect on 3-CLpro. Conclusion: In our study, well-studied bioactive compounds, such as glycyrrhizin and glycyrrhetinic acid, as well as the less common phenolic acid and flavonoid content in liquorice were examined. Among the compounds analysed in liquorice, apigenin, pelargonin, cyanidin, maleic acid, ethyl ferulate and chlorogenic acid were the most abundant. Ethanol extracts of liquorice showed higher concentrations of phenolic and flavonoid compounds associated with increased antioxidant and anti inflammatory activities.Öğe The effect of temperature and light intensity during cultivation of Chlorella miniata on antioxidant, anti-inflammatory potentials and phenolic compound accumulation(Elsevier Science Bv, 2018) Sozmen, Alper Baran; Canbay, Erhan; Sozmen, Eser Yildirim; Ovez, BikemThe purpose of this study was to see if the microalgae species Chlorella miniata possess an antioxidant and antiinflammatorypotential and to see if there is a correlation between the cultivation conditions and these potentials. For this purpose, cultivation of the algae under different growth conditions had been carried out; afterwards the soxhletextraction of the produced biomass had been completed. Lastly the assays of Trolox equivalent antioxidant capacity (TEAC), ferric reducing antioxidant capacity (FARP), total antioxidant capacity (TAO), xanthine oxidase inhibition, and hyaluronidase inhibition were studied using extracts of microalgae obtained from the different cultivation parameters. Ifs important to mention that this was the first study using these assays on species of Chlorella miniata and the first that utilized the cultivation parameters on microalgae. The results were, 22,91 mg/g algae TEAC, 776,70 mg/g algae gallic acid equivalent of FRAP and 37,07% xanthine oxidase inhibition with a concentration of 10,5 mg algae per ml ethanol, 65,39% of hyaluronidase inhibition with a concentration of 0,9 mg algae per ml ethanol. The effects of the cultivation parameters on these assays and the Lc MS/MS analyses for various phenolic compounds in the extracts were also a part of the study.Öğe Evaluation of the first Turkish in vitro diagnostic symposium(Walter De Gruyter Gmbh, 2017) Kose, Fadime Aydin; Celebi, Serap; Cengiz, Hakan; Harmanci, Duygu; Kocak, Ayse; Canbay, Erhan; Aslan, Diler; Sezer, Ebru; Pabuccuoglu, Aysun; Kocdor, HilalIn vitro diagnostic (IVD) medical laboratory devices, tests and equipment are closely related with public health, patient safety and the safety of all who utilize these tools in laboratories. The close monitoring of the process from the production line to the end-point user is crucial so that IVD devices and tests do not pose a risk to individuals and society. Based on this background, the "First Turkish in vitro Diagnostic Symposium: Medical Laboratory Tests" was held in February, 2016. The symposium was organized by the cooperation of Turkish Biochemical Society, Izmir Branch and Dokuz Eylul University Health Sciences Institute along with the contributions of TurkLab Calibration Association. It was intended that the meeting would shed light on questions such as, 'What is the place and importance of IVD in Turkey?', 'What are the responsibilities of educational institutions?', 'What is the role of Ministry of Health?', with the aim that the answers would help to determine the infrastructure needed for successful production of IVD medical devices in Turkey. At the end of the symposium, feedback from participants were collected via a questionnaire. This article presents the general evaluation of the symposium based on the results of this survey.Öğe A fast and convenient UPLC - MSMS method for routine analysis of GALT activity from dried blood spot.(2019) Topbas, Muhammed; Canbay, Erhan; Sezer, Ebru; Uçar, Sema Kalkan; Çoker, Mahmut…Öğe Galaktozemi tanısı ve tedavisinin izlenmesine yönelik biyosensör temelli yöntemler geliştirilmesi(Ege Üniversitesi, 2022) Canbay, Erhan; Sezer, EbruGalaktozemi galaktoz metabolizmasındaki bazı enzimlerin (GALT, GALK, GALE) az veya hiç sentezlenememesi sonucu ortaya çıkan kalıtımsal bir hastalıktır. Özellikle yenidoğanlarda erken tanı konulamaması ağır klinik, hatta ölümcül sonuçlar doğurabilir. Bu projenin amacını biri plazmada serbest galaktoz düzeyini ölçen diğeri de eritrosit hemolizatında total galaktoz (galaktoz+Galaktoz-1-fosfat) düzeyini ölçen iki biyosensör geliştirilmesi oluşturmaktadır. Geliştirilen serbest galaktoz biyosensörünün immobilizasyon bileşenlerini screen printed karbon elektrot, prusyan blue, kitosan, nafyon, altın nanopartikül ve galaktoz oksidaz oluştururken total galaktoz biyosensöründe yapıya alkalen fosfataz dahil olmaktadır. Biyosensörün yüzey karakterizasyonu döngüsel voltametri ve taramalı elektron mikroskobu ile yapılırken, optimizasyon ve performans karakterizasyonları amperometri tekniği uygulanarak yapılmıştır. Serbest galaktoz biyosensörü için amperometrik çalışma potansiyeli olarak -0,05 V belirlenirken total galaktoz biyosensörü için -0,1 V belirlenmiştir. İmmobilizasyon bileşenleri ve çalışma koşullarının optimizasyonu yapılmıştır. Serbest galaktoz biyosensörü için doğrusal tayin aralığı 0,025-10 mM arasındadır. Bu aralık hem sağlıklı bireylerin hem de hastaların plazmasındaki galaktoz seviyelerini içermektedir. Total galaktoz biyosensörünün Galaktoz-1-fosfat (Gal-1-P) için doğrusal tayin aralığı ise 0,1-10 mM arasında bulunmuştur. Bu aralık klasik tip galaktozemili hastaların eritrosit Gal-1-P düzeylerini içerirken sağlıklıların eser miktardaki Gal-1-P düzeylerini kapsamamaktadır. Her iki biyosensörün de gün içi ve günler arası üç seviye tekrarlanabilirliği için hesaplanan %Varyasyon Katsayısı (VK) değerleri kabul edilebilir limit olan %15'in altındadır. Serbest galaktoz biyosensörünün tekrar üretilebilirliği için hesaplanan %VK %7,78; total galaktoz biyosensörü için hesaplanan %VK değeri ise 8,75'tir. Sağlıklı ve hasta galaktoz düzeylerini içeren plazma örneklerinde galaktoz tayini yapılırken hasta düzeylerini içeren eritosit hemolizatlarında ise Gal-1-P tayini yapılmıştır. Geliştirilen biyosensörlerin plazma ve hemolizat matrikslerinde doğru ölçüm yaptıkları hem % geri elde deneyleriyle hem de yöntem karşılaştırılmasıyla gösterilmiştir. Bu tez çalışmasında geliştirilen yeni galaktoz biyosensörlerinin benzersiz analitik özellikleri ve zahmetsiz hazırlanması, onları hasta başı tanı testi uygulaması için ciddi birer aday haline getirmektedirÖğe How Preeclampsia Affects Oxidant Status and Antiiflammatory Potential of Breast Milk?(Elsevier Science Inc, 2016) Demir, Damla; Sezer, Ebru Demirel; Turan, Volkan; Ozturk, Sahin; Canbay, Erhan; Sozmen, Eser YildirimÖğe Ionic liquid modified carbon paste electrode and investigation of its electrocatalytic activity to hydrogen peroxide(Indian Acad Sciences, 2014) Canbay, Erhan; Turkmen, Hayati; Akyilmaz, ErolThis paper reports on the preparation and advantages of novel amperometric biosensors in the presence of hydrophobic ionic liquid (IL), 1-methyl-3-butylimidazolium bromide ([MBIB]). Carbon paste biosensor has been constructed by entrapping horseradish peroxidase in graphite and IL mixed with paraffin oil as a binder. The resulting IL/graphite material brings new capabilities for electrochemical devices by combining the advantages of ILs composite electrodes. Amounts of H2O2 were amperometrically detected by monitoring current values at reduction potential (-0.15 V) of K3Fe(CN)(6). Decrease in biosensor responses were linearly related to H2O2 concentrations between 10 and 100 mu M with 2 s response time. Limit of detection of the biosensor were calculated to be 3.98 mu M for H2O2. In the optimization studies of the biosensor some parameters such as optimum pH, optimum temperature, enzyme amount, interference effects of some substances on the biosensor response, reproducibility and storage stability were carried out. The promising results are ascribed to the use of an ionic liquid, which forms an excellent charge-transfer bridge and wide electrochemical windows in the bulk of carbon paste electrode.Öğe LC-MS/MS measurement of leukocyte cystine; effect of preanalytic factors(Elsevier, 2020) Canbay, Erhan; Sezer, Ebru Demirel; Ucar, Sema Kalkan; Coker, Mahmut; Sozmen, Eser YildirimCystinosis is an autosomal recessive disorder characterized by the accumulation of cystine in lysosomes, causing irreversible damage to organs, especially the kidneys. Intracellular leukocyte cystine concentrations are used to diagnose cystinosis and to monitor cysteamine treatment. the aim of this study was to develop and validate a liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method without derivatization capable of measuring leukocyte intracellular cystine concentrations. During development, the effects of using three different protein precipitation agents were evaluated in terms of sensitivity and the matrix effect, with 12% trichloroacetic acid providing the highest sensitivity. the effects of different blood collection tubes were also assessed in terms of recovery, matrix effect, and protein content. Compared to other methods, our method was quicker (run time of 3 min), was linear over the range 0.078-100 mu M, and had lower limits of detection (0.0192 mu M) and quantification (0.0582 mu M). the intra-day and inter-day reproducibility %CVs were <= 10%. and the method had excellent recovery rates (94%-106%). Other parameters including matrix selectivity, injection carryover, leukocyte lysate stability were also validated and met the acceptance criterias of European Medicines Agency (EMA) Guideline. the assay was successfully applied to quantify cystine leukocyte concentration in healthy and cystinosis patients.Öğe Lökosit sistin düzeyinin belirlenmesi için bir lc ms/ms metodu geliştirilmesi(Ege Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2017) Canbay, Erhan; Sezer, EbruSistinozis lizozomlarda sistin birikimiyle karakterize, başta böbrek olmak üzere birçok organda geri dönüşümsüz hasara neden olan otozomal resesif kalıtılan bir hastalıktır. Sistinozisin teşhisi ve sisteaminle tedavisinin takip edilmesi için lökosit içi sistin konsantrasyonunun ölçümü gerekmektedir. Lökosit içi sistin düzeyinin belirlenmesi için sistin bağlayıcı protein assay, iyon değişim kromatografisi, HPLC ve son yıllarda ise LC MS MS yöntemi kullanılmaktadır. Lökosit içi sistin düzeyi belirlenmesi için birkaç yöntem olmasına rağmen kan toplama tüplerinin ve örnek hazırlama işlemlerinin lökosit sistin düzeyi tayinine etkisine yönelik bir çalışmaya rastlanılmamıştır. Bu tez çalışmasının birincil amacı lökosit içi sistin tayininine yönelik yeni bir LC MS MS yöntemi geliştirmek, yöntemi valide etmek ve kan alma tüpleri ve ön işlemlerin ölçüme etkisini incelemektir. İkincil amacı ise intrasellüler düzeyde çok az bulunan ve yapı olarak sistine benzeyen homosistin molekülünün internal standart olarak kullanılabilirliğinin test edilmesidir. Geliştirilen yöntemde optimizasyonlar sonucu %0,05 formik asit içeren %50/50 Asetonitril/Su çözgen sistemleri mobil faz olarak kullanılmıştır. Akış programı izokratik, akış hızı 0,2 ml/dakika, toplam ölçüm süresi ise 3 dakikadır. Protein çöktürme ajanının ölçüme etkisi duyarlılık ve matriks etkisi yönünden incelenmiştir. %12'lik sülfosalisilik asit(SSA), %12'lik trikloroasetik asit (TCA) ve asetonitrilin (ACN) protein çöktürme ajanları olarak denendiği çalışmada en duyarlı sonuçlar %12'lik TCA ile elde edilmiştir. Kan alma tüplerinin sistin ölçümüne etkisi geri-elde, matriks etkisi ve protein miktarları yönünden değerlendirilmiştir. Bu amaçla laboratuvarlarda kan almada en fazla kullanılan antikoagulanlardan Li- Heparin, K2-EDTA, Na-Sitrat içeren tüpler kullanılmıştır. Metot validasyon parametreleri kapsamında seçicilik, linearite, tayin ve kantitasyon limitleri, taşıma etkisi, tekrarlanabilirlik, geri elde, matriks etkisi, referans aralık doğrulama, lizat stabilitesi çalışmaları yapıldı. Linearite çalışmasında geliştirilen yöntem lökosit lizatında sistin için 0,078-100 M aralığında lineer olarak bulundu. Tayin limiti 0,0192 M, kantitasyon limiti ise 0,0582 M olarak bulunmuştur. Hem d6-sistinin internal standart olarak kullanıldığı yöntemde hem de homosistinin internal standart olarak kullanıldığı yöntemde gün içi ve günler arası tekrarlanabilirlik çalışmasından elde edilen %CV değerleri %15'in altındadır ve validasyon kriterlerine uygundur. d6-sistinli yöntem için geri elde %95-103 arasında iken homosistinli yöntemde bu değerler %94-106 arasındadır. 40 sağlıklı, 6 hasta ile gerçekleştirilen referans aralık doğrulama çalışmasında d6-sistinli ve homosistinli yöntemden elde edilen sonuçlar birbiriyle karşılaştırılmış, elde edilen grafiğin R2 değeri 0,9838 bulunmuştur. Lizat stabilitesi 4 ay boyunca oda sıcaklığında, +4⁰ C'de ve -20⁰C'de çalışılmıştır. Her üç sıcaklık için de lizatın 4 ay boyunca stabil olduğu belirlenmiştirÖğe Lökosit sistin düzeyinin belirlenmesi için bir LC MS/MS metodu geliştirilmesi(Ege Üniversitesi, 2017) Canbay, Erhan; Sezer, EbruCystine, cystinosis, LC MS MS, leukocyte, homocystine.;Sistin, sistinozis, LC MS MS, lökosit, homosistin.;Sistinozis lizozomlarda sistin birikimiyle karakterize, başta böbrek olmak üzere birçok organda geri dönüşümsüz hasara neden olan otozomal resesif kalıtılan bir hastalıktır. Sistinozisin teşhisi ve sisteaminle tedavisinin takip edilmesi için lökosit içi sistin konsantrasyonunun ölçümü gerekmektedir. Lökosit içi sistin düzeyinin belirlenmesi için sistin bağlayıcı protein assay, iyon değişim kromatografisi, HPLC ve son yıllarda ise LC MS MS yöntemi kullanılmaktadır. Lökosit içi sistin düzeyi belirlenmesi için birkaç yöntem olmasına rağmen kan toplama tüplerinin ve örnek hazırlama işlemlerinin lökosit sistin düzeyi tayinine etkisine yönelik bir çalışmaya rastlanılmamıştır. Bu tez çalışmasının birincil amacı lökosit içi sistin tayininine yönelik yeni bir LC MS MS yöntemi geliştirmek, yöntemi valide etmek ve kan alma tüpleri ve ön işlemlerin ölçüme etkisini incelemektir. İkincil amacı ise intrasellüler düzeyde çok az bulunan ve yapı olarak sistine benzeyen homosistin molekülünün internal standart olarak kullanılabilirliğinin test edilmelidir. Geliştirilen yöntemde optimizasyonlar sonucu %0,05 formik asit içeren %50/50 Asetonitril/Su çözgen sistemleri mobil faz olarak kullanılmıştır. Akış programı izokratik, akış hızı 0,2 ml/dakika, toplam ölçüm süresi ise 3 dakikadır. Protein çöktürme alanının ölçüme etkisi duyarlılık ve matriks etkisi yönünden incelenmiştir. %12'lik sülfosalisilik asit(SSA), %12'lik trikloroasetik asit (TCA) ve asetonitrilin (ACN) protein çöktürme ajanları olarak denendiği çalışmada en duyarlı sonuçlar %12'lik TCA ile elde edilmiştir. Kan alma tüplerinin sistin ölçümüne etkisi geri-elde, matriks etkisi ve protein miktarları yönünden değerlendirilmiştir. Bu amaçla laboratuvarlarda kan almada en fazla kullanılan antikoagulanlardan Li- Heparin, K2- EDTA, Na-Sitrat içeren tüpler kullanılmıştır. Metot validasyon parametreleri kapsamında seçicilik, linearite, tayin ve kantitasyon limitleri, taşıma etkisi, tekrarlanabilirlik, geri elde, matriks etkisi, referans aralık doğrulama, lizat stabilitesi çalışmaları yapıldı. Linearite çalışmasında geliştirilen yöntem lökosit lizatında sistin için 0,078-100 pM aralığında lineer olarak bulundu. Tayin limiti 0,0192 jaM, kantitasyon limiti ise 0,0582 p.M olarak bulunmuştur. Hem d6-sistinin internal standart olarak kullanıldığı yöntemde hem de homosistinin internal standart olarak kullanıldığı yöntemde gün içi ve günler arası tekrarlanabilirlik çalışmasından elde edilen %CV değerleri %15'in altındadır ve validasyon kriterlerine uygundur. d6-sistinli yöntem için geri elde %95-103 arasında iken homosistinli yöntemde bu değerler %94-106 arasındadır. 40 sağlıklı, 6 hasta ile gerçekleştirilen referans aralık doğrulama çalışmasında d6-sistinli ve homosistinli yöntemden elde edilen sonuçlar birbiriyle karşılaştırılmış, elde edilen grafiğin R2 değeri 0,9838 bulunmuştur. Lizat stabilitesi 4 ay boyunca oda sıcaklığında, +4° C'de ve -20°C'de çalışılmıştır. Her üç sıcaklık için de lizatın 4 ay boyunca stabil olduğu belirlenmiştir.
