Klinik açıdan önemli bakteriyal ve fungal patojenlerin DNAsının tayinine yönelik nano-polimeraz zincir reaksiyonu (nano-PCR) temelli yöntemlerin geliştirilmesi

Multipleks PCR, aynı anda çok sayıda hedef genin amplifikasyonuna imkan veren ve bu nedenle standart PCR’a kıyasla daha pratik ve hızlı bir yöntemdir. Nano-PCR, geleneksel PCR’a alternatif olarak DNA amplifikasyonunu daha etkin, spesifik ve hassas bir biçimde gerçekleştirmeyi hedefleyen bir yöntemdir. Bu nedenle, DNA analizlerinde daha etkin bir araç olarak kullanım potansiyeli taşımaktadır. Bu proje kapsamında, AuNP nanopartikülleri kullanılarak, klinik açıdan kritik öneme sahip patojen genomik DNA’larının (gDNA) nano- PCR ile tayini çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Bu patojen bakteri ve fungusları tanımlamada kullanılan geleneksel metotlara alternatif olarak, altın nanopartikül (AuNP) gibi nanomalzemelerin fizikokimyasal özelliklerinden yararlanılması ve Nano- PCR yönteminin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Patojen mikroorganizmaların genomik DNA’larının, nanopartiküllerin bu özelliğinden yararlanılarak diğer yöntemlere kıyasla daha güvenilir, daha hassas ve spesifik tayininin sağlanması hedeflenmiştir.

Multiplex PCR is a more practical and faster method that allows the amplification of multiple target genes at the same time, and is therefore a more convenient method than standard PCR. Nano-PCR is a method that aims to perform DNA amplification more effectively, specifically and precisely as an alternative to conventional PCR. Therefore, it bears the potential for use as a more effective tool in DNA analysis. Within the scope of this project, nanoparticles such as AuNP were studied by nano-PCR for determination of clinically critical pathogen genomic DNA (gDNA). As an alternative to the traditional methods used to identify these pathogenic bacteria and fungi, it was aimed to utilize the physicochemical properties of nanomaterials such as gold nanoparticles (AuNP) and to develop the Nano-PCR method. It was aimed to provide more reliable, more sensitive and specific determination of genomic DNA of pathogen microorganisms by using this feature of nanoparticles compared to other methods.