Kolorektal kanserli hastaların dışkı ve tükrük örneklerinde mikrobiyota analizi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2023
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Kolorektal kanserler dünyada en sık görülen kanserlerden olup, toplumda görülme sıklığı giderek artmakta ve kanserle ilişkili mortalitelerin önemli bir kısmını oluşturmaktadır. Kolorektal kanserler, tedavideki gelişmelere rağmen, tanısının geç konulabilmesinden dolayı en sık ölüme neden olan kanserler arasında üçüncü sırada yer almaktadır. Kanserli hastaların mikrobiyotası sağlıklı kişilerin mikrobiyotasından farklılık göstermekte olup bu farklılığın birçok nedeni olabilmektedir. Mikrobiyota ve genomundaki farklılıklar kanserin erken tanısında, prognoz takibinde biyobelirteç olarak kullanılabileceği gibi tedavi hedefi de olabilecektir. Bu amaçla kolorektal kanserli hastalarda dışkı mikrobiyotasını araştıran çalışmalar yapılmıştır. Ancak yapılan son çalışmalar ağız mikrobiyotasının da vücuttaki birçok sistemle ilişkisi olduğunu ve DNA, RNA, protein gibi aslında kanda bulunan birçok komponentin tükrükte de bulunduğunu göstermiştir. Mikrobiyotanın, patojenik bakteri suşlarının virülans faktörleri aracılığıyla CRC gelişimini etkilediğini gösteren kanıtlar bazı mikrobiyal suşlar ile CRC arasında yakın bir korelasyon olduğunu öne sürmektedir. Çeşitli invivo ve invitro modellerde, spesifik bakteri türlerinin zenginleştirilmesiyle tümör mikroçevresinde değişikliklerin geliştiği ve çeşitli moleküler olaylar ile CRC tümör oluşumunu teşvik ettiği bulunmuştur. CRC ile ilişkili bu spesifik mikrobiyal suşlar, tanı veya tedavi biyobelirteçlerin geliştirmesinde umut vadetmektedir. Bu amaç doğrultusunda, çalışmamıza 50 kolorektal kanser hastası (CRC), 50 sağlıklı kontrol (HC) dahil edilmiştir. 10 CRC hastasının ve 10 HC örneklerinde 16S rRNA sekans analizi ile mikrobiyota araştırılmıştır. CRC hastalar ile HC'ler arasında kalitatif olarak en fazla farklılık gösteren beş mikroorganizma için seçilen primerlerle, bu mikroorganizmaların varlığı tüm örneklerde PZR incelenmiştir. Böylece kolorektal kanserin etken tanısında kullanılabilecek biyobelirteç adaylarının belirlenmesi ve bu mikroorganizmalara kantitasyon yapılması ile rutin tanıda kolay ve ucuz olarak bakılabilecek parametreler haline gelmesi hedeflenmiştir. Elde edilen bu veriler ile HC grubuna kıyasla, CRC hastalarında dışkı bakteri türlerinin zenginliği ve çeşitliliğinde hafif bir artış bulduk. HC tükürük örnekleri, CRC tükürük örneklerinden daha fazla biyolojik çeşitliliğe ve zenginliğe sahip olduğu tespit ettik. Ayrıca, CRC'li hastalar ile HC arasında dışkı örneklerinde anlamlı bir fark olduğu, ancak tükürük örneklerinde böyle bir fark olmadığı görülmüştür. CRC hastalar ve HC'lerde tükürük ve dışkı örneklerinde Firmicutes, Proteobacteria ve Bacteroidetes en bol bulunan filumlar olarak tespit edilmiştir. HC'lere kıyasla CRC hastaların dışkılarında, Furmicutes'de azalma, Bacteroidetes ve Fusobacteria filumlarında artma saptanmıştır. Tükürük örneklerinde ise bu filumlarda anlamlı bir değişiklik görülmez iken, HC'lere kıyasla CRC hastalarında Actinobacteria'da artma ve Proteobacteria'da bir azalma tespit edilmiştir. CRC hastaların diski örneklerinde Fusobacterium ve Prevotella anlamlı seviyede yüksek bulunmuş olup, bu iki bakterinin CRC için bir tanısal bir biyobelirteç potansiyeli taşıdığı düşünülmüştür. Ayrıca, çalışmamızda, gruplar arasında mikrobiyota karşılaştırılmasında hastalarda çeşitli yolaklarda diferansiyel zenginleşme gözlemledik. Bunlar en fazla metabolik yolak ile genetik, çevresel ve hücresel işlemlerin gerçekleştiği yolaklar olarak tespit edilmiştir. Bu sonuçlar aslında mikrobiyatayi oluşturan bazı mikroorganizmaların kolorektal kanser tanısında önemli olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, bu çalışma kanser hastaların bu mikroorganizmalar acısından değerlendirilmesi ve klinisyenlerin farkındalığının artırılması ile tanı açısından önemli katkılar sağlayacak sonuçlar sunmaktadır. Ayrıca cerrahi veya kemoterapi ile tedavi edilen CRC hastalarında önceden tanımlanmış bu mikroorganizmaların yeni rollerinin daha fazla araştırılması gerektiğini önerilmektedir.;Kolorektal kanserler, Biyobelirtec, Mikrobiyota, Tanı, Dışkı, Tükürük.;Colorectal cancers, Biomarker, Microbiota, Diagnosis, Stool, Saliva.
Açıklama
Tıp Fakültesi, Genel Cerrahi A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
