Biyokimyasal önem taşıyan üç karbonhidrat türevinin ieht ve pcilo molekülsel yörünge yöntemleriyle çeşitli molekülsel özelliklerinin incelenmesi
Dosyalar
Tarih
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
Özet
Biyokimyasal sentez reaksiyonlarında önem taşıyan üç karbonhidrat türevinin, molekülsel yörünge yöntemleriyle elektronik yapılarını, molekülsel enerjilerini, değişik tür konformasyon yapılarının kararlılık derecelerini incelediğimiz bu çalışma dört ana bölümde sunulmuştur. I. bölümde kuantum kimyasının temelini oluşturan ve organik molekülleri kimyasal özellikleri üzerinde çok etkin olan kimyasal bağların kısaca tanımını ve kimyasal bağ oluşumu üzerinde ortaya atılan olumlu görüşleri belirledikten sonra, II. bölümde atomsal yörüngelerden molekülsel yörüngelerin oluşumuna ilişkin gerekli matematiksel temel işlemler açıklanmıştır. Ayrıca bu bölümde, molekülsel yörünge kuramı üzerinde, determinant dalga fonksiyonları ve enerji matris elemanlarını oluşturan işlemci ve bunların yardımıyla düzenlenen integral tipleri tanıtılarak, molekülsel sisteme ilişkin enerji düzeyleri ve molekülsel yörüngelerinin elde edilişleri anlatılmıştır. III. bölümde; çalışmamızda kullandığımız IEHT ve POILO molekülsel yörünge yöntemleri, ikinci bölümdeki genel işlemlere uygun ve ayrıntılı olarak açıklanmış ayrıca yöntemlerin işlerlik kazanabilmeleri için gerekli parametreler ve kullanım biçimleri anlatılmıştır. IV. bölümün ilk kısmında, N-asetil-a-D-müramik asit, N-asetil-a-D-glikozamin ve a-D-glikozamin moleküllerinin kristal yapılarıyla ilgili parametrik bulgulardan yararlanarak yürüttüğümüz geometrik analiz işlemlerinin sonuçları verilmiştir. Daha sonra LEHT molekülsel yörünge yöntemi kullanılarak, üç organik maddenin toplam molekülsel enerji büyüklükleri, molekülsel enerji, molekülsel yörüngelerin enerji düzeyleri, moleküldeki atomsal grupların elektronik yük dağılımları ve dipol moment büyüklükleri saptanmıştır. Bu bölümün son kısmında da öncelikli üç molekülün kristal yapılarıyla ilgili değişik cins etkileşim ve toplam konformasyon enerjileri belirlendi. Daha sonra molekülsel yapılar üzerinde, mümkün olabilecek konformasyonlar göz önüne alınarak kurumsal konformasyon enerjileri hesaplandı ve böylece en kararlı konformasyonlar belirlenebildi.