LncRNA'ların pankreas kanserinin tanı ve prognozundaki önemi

Pankreas kanseri malignitelere bağlı ölümler arasında dördüncü sırada yer alan kanser türüdür. Pankreas kanserli hastaların serumlarında belirli antijenler tanımlanmıştır. Son yıllarda yeni belirteçlerin saptanması amacıyla moleküler çalışmalarda siRNA, miRNA ve lncRNA gibi küçük kodlanmayan RNA’lar kullanılmaya başlanmıştır. Bu çalışmanın amacı pankreas kanserinde belirli lncRNA’ların rollerinin araştırılması ve pankreas kanserli hastaların demografik, laboratuar ve klinik özelliklerinin gözden geçirilerek lncRNA’larla olan ilişkilerinin belirlenmesi ve yeni bir dolaşım belirteci olarak kullanılıp kullanılamayacaklarının irdelenmesidir. Çalışmamızda normal pankreas(HPDE) ve pankreas duktal adenokanser(PANC-1) hücre serileri kullanılmıştır. Ayrıca pankreas kanseri olan 40 olgu ve 10 sağlıklı birey çalışmaya alınmıştır. Çalışmamızda pankreas kanserli hastaların lncRNA’ların ekspresyon değerleri, hücre serisi örneklerinin ekspresyon değerleri ile kıyaslanmış ve bunların bir tanı testi ve prognoz göstergesi olup olamayacağı irdelenmiştir. Pankreas kanser hücre hattında yapılan analizlerde sağlıklı hücre hattına göre kıyaslandığında ANRIL, H19, HOTAIR, MALAT1, PCA3 ve PTCSC3 ekspresyon seviyelerinin sırasıyla 0.58kat, 4.60kat, 4.19kat, 0.66kat, 1.25kat ve 0.38kat arttığı saptanmıştır. Aynı lncRNA’ların hasta plazma örneklerinde sağlıklı kontrollere göre değişimi incelendiğinde sırasıyla 5.85kat, 3.91kat, 4.22kat, 1.70kat, 1.81kat ve 3,93kat azaldığı görülmüştür. Pankreas kanser tanılı hastaların plazma lncRNA değişimlerinin alkol ve sigara kullanımı, diyabet varlığı gibi faktörlerden etkilendiği bulunmuştur. Ayrıca hastalık evresi arttıkça plazma lncRNA değişimleri artmaktadır. Sonuç olarak in vitro analizlerde PANC1 hücre hattında H19 ve HOTAIR lncRNA’ların ekspresyonu artmaktadır. Ancak pankreas kanseri tanılı hastaların plazma örneklerinde ANRIL, H19, HOTAIR ve PTCSC3 lncRNA seviyeleri azalmaktadır. Bu değişim ileri evre hastalıkta, sigara, alkol kullanımında ve diyabet varlığında daha belirgin olduğu için pankreas kanserinin erken tanısında şu an için birer tanı yöntemi olarak kullanılması mümkün gözükmemektedir.

Pancreatic cancer is the fourth most common type of cancer-related mortality. Certain antigens have been identified in the serum of patients with pancreatic cancer. Various molecular studies including small noncoding RNA such as siRNA, miRNA ve lncRNA have been investigated as a new biomarker of pancreatic cancer. The aim of this study was to investigate the roles of lncRNAs in pancreatic cancer and to demonstrate the relation between lncRNA levels and clinical, demographic and labaratory findings of pancreatic cancer patients. In our study, normal pancreatic (HPDE) and pancreatic ductal adenocarcinoma (PANC-1) cell lines were used. In addition, 40 patients with pancreatic cancer and 10 healthy individuals were included in the study. In our study, the expression leves of lncRNAs in patients with pancreatic cancer were compared with the expression leves of cell series samples and whether these could be a diagnostic test and prognostic indicator. Analysis of pancreatic cancer cell line showed that ANRIL, H19, HOTAIR, MALAT1, PCA3 and PTCSC3 expression levels increased 0.58 fold, 4.60 fold, 4.19 fold, 0.66 fold, 1.25 fold and 0.38 fold, respectively. When the change of the same lncRNAs in patient plasma samples compared to healthy controls was observed, it decreased 5.85 fold, 3.91 fold, 4.22 fold, 1.70 fold, 1.81 fold and 3.93 fold, respectively. It was found that plasma lncRNA changes in patients with pancreatic cancer were affected by factors such as alcohol and cigarette smoking and diabetes. In addition, as the disease stage increases, plasma lncRNA changes increase. As a result, the expression of H19 and HOTAIR lncRNAs in PANC1 cell line was increased in vitro analyzes. However, ANRIL, H19, HOTAIR and PTCSC3 lncRNA levels are decreased in plasma samples of patients with pancreatic cancer. Since this change is more apparent in advanced disease, smoking, alcohol use and diabetes, it is not possible to use it as a diagnostic method in the early diagnosis of pancreatic cancer.