Candida Albicans (Robin) Berkhout'un species-specific PCR ile DNA düzeyinde tanısının standardizasyonu

Bu çalışmada C.albicans'ın Species-Specific PCR ile tanısının yapılması amaçlanmıştır. Bu amaç ile 5 C.albicans referans straini, 9 farklı Candida türü (referans strainler ve klinik izolatlar), Cyrptococcus neoformans, 4 filamentöz fungus (referans strainler ve klinik izolatlar), 3 bakteri referans straininden DNA izolasyonu yapılmıştır. İnsan DNA'sı hazır olarak elde edilmiştir.C.albicans'ın büyük alt birim rDNA gen bölgesinde yer alan D1/D2 bölgesine spesifik primer seti (CAL5,NL4CAL,NL5CAL) kullanılmış ve Species-Specific PCR'ın standardizasyonu yapılmıştır. Bu amaç ile farklı MgCl2 konsantrasyonları, agaroz konsantrasyonları, farklı PCR döngü profilleri, farklı DNA konsantrasyonlarının PCR'a etkisi denenmiştir. Bu primerlerin 19 pg kromozomal DNA'yı saptadığı bulunmuştur. Bu PCR'da bu primerler sadece C.albicans kromosomal DNA'sı mevcut iken 175 bç'lik (baz çifti)'lik ürün oluşturmuştur ve fenotipik olarak C.dubliniensis ve C.tropicalis olarak tanılanmış iki klinik izolat hariç diğer DNA'lar mevcut olduğunda hiçbir ürün oluşmamıştır. C.albicans DNA'sını içeren ve 2 farklı Candida (CDU2,NL4CAL ve CWO2,L4LEL) türüne ait primerler ile bir seri PCR gerçekleştirilmiş ve hiçbir çoğaltım gözlenmemiştir.;C.albicans, DNA, Standardizasyon, Species-Specific PCR.;Candida albicans, DNA, Standardization, Species-Specific PCR.