Moleküler etiyolojisi aydınlatılmamış cinsiyet gelişim bozukluğu hastalarında mikroarray çalışılması ile kopya sayısı değişiklikleri saptanması ve klinik varyasyonlarla ilişkilendirilmesi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2022
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Giriş: Cinsiyet gelişim bozukluğu (CGB); kromozomal, gonadal veya anatomik cinsiyetin anormal olarak gelişimi ile karakterize nadir konjenital bir hastalıktır. Mikroarray (Single nucleotide polymorphism-SNP- array) yöntemi CGB'lerin tanısında, yüksek verimli güçlü bir tam genom tarama imkanı sunmaktadır. Amaç ve Yöntem: Bu çalışmada CGB hastalarında moleküler etiyolojinin aydınlatılmasında mikroarray yöntemi kullanılarak kopya sayısı değişikliklerinin saptanması amaçlanmaktadır. Karyotip analizinde herhangi bir yapısal ya da sayısal anomali saptanmayan, klinik ve laboratuvar bulgular eşliğinde algoritmik yaklaşımla ilişkili moleküler analizleri gerçekleştirilmiş ve herhangi bir patojenik varyant tespit edilmemiş olgularda mikroarray yöntemi ile kopya sayısı değişiklikleri değerlendirildi. Bulunan değişiklikler ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics) 2020 kriterlerine göre skorlandı. Elde edilen skor <0 olan varyantlar öncelikle dışlandı. Skoru 0 ve üstünde saptanan değişiklikler, belirlenen bölgedeki haplo ya da triployetersizlik bildirilen genlerin varlığı, ClinVar ve/veya DECIPHER veritabanlarında yapılan veri girişleri ve bildirilen fenotiplere göre incelendi. Bu veriler ışığında, elde edilen değişiklikler benign, anlamı bilinmeyen veya patojenik olacak şekilde sınıflandırıldı. Bulgular: Cinsiyet gelişim bozukluğu nedeniyle izlenen moleküler genetik etiyolojide patoloji saptanmayan 22 olgu dahil edildi. Olguların 18'i (%81.8) 46, XY ve 4'ü (%18.1) 46, XX CGB olarak sınıflandırıldı. Olguların ortalama yaşı 7.9±4.7 yıldı. Olguların çocuk endokrinoloji kliniğine başvuru yaşı 7.4 ay (en erken:4 günlük, en geç: 15 yaş) idi. Başvuru sırasında olguların 6'sı (%27.2) kız, 16'sı (%72.7) erkek cinsiyette yetiştirilmişti. Başvuru bulguları/yönlendirme nedenleri değerlendirildiğinde; 46, XY CGB grubunda hastaların 2'si (%11.1) inmemiş testis ile beraber hipospadias, 4'ü (%.22.2 ) kuşkulu dış genital yapı, 1'i (%5.5) mikropenis ile beraber hipospadias, 1'i (%5.5) bilateral inmemiş testis, 1'i (% 5.5) tek taraflı inmemiş testis, 8'i (%44.4) izole hipospadias ve 1'i (%5.5) mikropenis ile beraber bilateral inmemiş testis nedeni ile değerlendirildi. Kız insiyetinde büyütülmüş 46, XY CGB olgularının başvuru yakınması bir (%4.5) olguda kliteromegali ve bir (%4.5) olguda kasıkta şişlik idi. 46, XX CGB'lerin ise 2'si (%50) kuşkulu dış genital yapı, biri (%25) primer amenore, biri (%25) rastlantısal olarak saptanan Müllerian agenezi nedeniyle başvurdu. Dört (%18.1) olguda anne-baba arasında akrabalık vardı. Beş (%22.7) olguda eşlik eden dismorfik bulgu (mikrognati, polidaktili vb.) mevcuttu. On bir (%50) olguda; doğumsal anomaliler eşlik etmekteydi ve en sık doğumsal anomali (3 olgu, %27) üriner sistem anomalileriydi. Mikroarray analizi ile 22 olgudan 4'ünde hiç varyant saptanmazken, 18 olguda toplam 142 kopya sayısı değişikliği belirlendi. Bunların 114'ü (%80.3) delesyon, 28'i (%19.8) duplikasyondu. Kopya sayısı değişikliği saptanan 18 (%81.8) olgunun varyantları değerlendirildiğinde 5 (%22.7) olguda 13'ü patojenik; 5 (%22.7) olguda 19'u anlamı belirlenemeyen olarak sınıflandırıldı. Patojenik olarak sınıflandırılan varyantlar arasından sadece 1 tanesinde daha önce veri tabanlarında hipospadias ile ilişkili fenotip kaydedilmişken, diğer varyantlarda herhangi bir genital anomali bildirilmemişti. Patojenik ve anlamı bilinmeyen olarak sınıflandırılan varyantların aile segregasyonları ve ileri analizleri planlandı. Sonuç: Karmaşık genetik mekanizmalarla ortaya çıkan CGB'lerin önemli kısmında günümüzde halen genetik tanı konulamamaktadır. CGB'de hızlı ve doğru tanı konulması, cinsiyet seçimi ve olgunun yönetimi açısından önemlidir. CGB olgularında moleküler etiyolojinin aydınlatılmasında tanısal yaklaşım içerisinde seçili olgularda mikroarray analizi yer bulmalıdır. Ayrıca mikroarray analizi CGB etiyolojisinde sorumlu yeni gen bulma çalışmalarında yol gösterici olabilir.;Cinsiyet gelişim bozukluğu, kopya sayısı değişkenliği, mikroarray analizi, 46 XY CGB, 46 XX CGB.;Disorder of Sex Development, copy number variations, microarray analysis, 46, XY DSD, 46, XX DSD.
Açıklama
Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
