Elektrokimyasal hibiridizasyon indikatörleri kullanarak DNA dizilerinin saptanması
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2001
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Çalışmamızda, hibridizasyon indikatörü olarak kullanılması planlanan, organik boyar bir madde olan Metilen Mavisi (MB)' nin DNA ile etkileşmesi, yüzeyine ayrı ayrı çift sarmal DNA (dsDNA) ve tek sarmal DNA (ssDNA) tutturulan karbon pastası (CPE) ve perde baskılı (=screen printed, SPE) elektrot kullanarak, kare dalga voltametri (SwV), diferansiyel puls voltametri (DPV) ve dönüşümlü voltametri (CV) teknikleri ile elektrokimyasal olarak incelendi. ssDNA ile, dsDNA ile alınan yanıta oranla çok daha büyük bir yanıt elde edildi. Yanıtlar arasındaki anlamlı farka dayanarak, MB' nin yeni bir hibridizasyon indikatörü olarak kullanılabileceği saptandı. Yöntemin optimizasyonuna yönelik çalışmalar da gerçekleştirildi. Bulaşıcı ve kalıtsal hastalıkların, çevresel kirliliğine neden olan mikroorganizmaların ve özellikle besin endüstrisinde önemli bir yeri olan genetik olarak değişikliğe uğratılmış organizmalara (GDU) ait gen dizilerinin daha kısa sürede, daha özgün ve güvenilir şekilde tayinini mümkün kılacak, hibridizasyona dayalı elektrokimyasal DNA biyosensör tasarımı yapıldı ve PCR ürünü örneklerde yapılan dizi tayini çalışmaları ile biyosensörlerin klinik alanda uygulanabilirliği gösterildi.MB'nin indikatör olarak kullanıldığı indikatöre dayalı DNA biyosensörü ile, DNA dizisi belli hastalıklardan, son derece güncel olan Hepatit B virüsünün (HBV) ve kan nakli yoluyla aktarılan, nedeni henüz bilinmeyen yeni DNA virüsünün (TTV) tayini gerçekleştirildi. HBV' ye ait dizi tayini, hem sentetik oligonükleotitler kullanılarak, hem de klinik kullanımını göstermek amacıyla, PCR ürünü hasta örnekleri kullanılarak yapıldı. TTV' ye ait dizi tayini ise sadece PCR ürünü hasta örnekleri kullanılarak gerçekleştirildi. Ayrıca, soya'dan elde edilen örneklerde GDU' ya ait dizinin tayini de gerçekleştirildi. Hibridizasyon koşulları optimize edildi ve tasarımı yapılan DNA biyosensörünün seçiciliği incelendi.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Analitik Kimya Anabilim Dalı
