Ege Bölgesi bağ alanlarında saptanan Grapevine yellow speckle viroid-1 ve 2 (GYSVd-1 ve 2)'nin moleküler karakterizasyonu
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2014
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
GYSVd-1 ve GYSVd-2 ülkemiz ve bölgemiz için önemli olan bağ alanlarında oldukça fazla rastlanan iki viroiddir. Pospiviroidae familyasına ait bu viroidler, asmalarda Bağ sarı benek (BSB) hastalığının etmenleridir. Bu çalışmada yerli ve yabancı çeşitlerle kurulu 'Manisa Bağcılık Araştırma İstasyonu Koleksiyon Bahçesi'nde yer alan GYSVd-1 ve 2 viroidleriyle enfekteli olduğu bilinen çeşitlerden alınan 49 bitki örneği RT-PCR ile testlenmiştir. Test sonucunda bahsedilen çeşitlerde bulunma durumları belirlenen izolatlardan rastgele bantlar seçilip çeşit bazında moleküler karakterizasyon çalışmalarına tabi tutulmuş ve dizi analizine gönderilmiştir. Dizi analizi sonucu farklı çeşitlerden elde edilen GYSVd-1 ve GYSVd-2 izolatları hem kendi aralarında hem de dünya izolatlarıyla karşılaştırılmıştır. Ayrıca karakterizasyonu gerçekleştirilen izolatlar biotin etiketli prob sentezinde kullanılmıştır. Yapılan benzerlik analizinin sonucunda farklı çeşitlerden elde edilen GYSVd-1 izolatlarının birbiriyle benzerlik oranları % 76-96 arasında değişmiştir. GYSd-1 izolatları Almanya, ABD, İtalya, Çin, Avustralya, Macaristan, Hindistan, İran, Kanada, Tayland ve Japonya izolatlarıyla benzer bulunurken; GYSVd-2 izolatlarının İran, Çin ve ABD izolatlarıyla benzer olduğu saptanmıştır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Bağ, GYSVd-1, GYSVd-2, Klonlama, Moleküler Karakterizasyon, Dizi Analizi., Vineyards, GYSVd-1, GYSVd-2, Cloning, Molecular Characterization, Sequencing., Bitki Koruma A.B.D.
