Mycobacterium tuberculosis izolatlarının MIRU-VNTR (Mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat) yöntemiyle tiplendirilmesi

Tüberküloz, Mycobacterium tuberculosis tarafından oluşturulan ve günümüzde giderek artan bir toplum sağlığı sorunu haline gelen kronik bir hastalıktır. Dünyada, M. tuberculosis suşlarının epidemiyolojisi ile ilgili pek çok çalışma bulunmasına karşın, ülkemizde bu konuda yeterli veriye rastlanmamaktadır. Günümüzde, moleküler yöntemlerdeki gelişmelerle beraber enfeksiyon hastalıklarının epidemiyolojisi ile ilgili çalışma seçenekleri artmıştır. M. tuberculosis'in genotiplemesinde IS6110-restriction fragment length polymorphism (IS6110-RFLP) analizi hala altın standart olarak kabul edilse de son yıllarda "Mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat (MIRU-VNTR)" analizi gibi PZR tabanlı yöntemlerle de başarılı sonuçlar elde edilmektedir. Bu çalışmada klinik M. tuberculosis izolatlarının MIRUVNTR yöntemi ile genotiplendirilmesi amaçlanmıştır. Ege Üniversitesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D. Mikobakteriyoloji Laboratuvarı'nda izole edilen 57 M. tuberculosis izolatının 12-lokus MIRU-VNTR yöntemi ile elde edilen sonuçlar MIRU-VNTRplus veri tabanında değerlendirildi, %48,28'inin genotip paterni veri tabanındaki kökenlerle eşleştirilemedi. Diğer kökenlerin ise Bovis, Haarlem, S, TUR, UgandaI, NEW-1, LAM, Cameroon ailelerinin genotiplerine benzeyen gruplarda toplandığı görüldü. Ayrıca bu kökenler üzerinde ayrım gücü en iyi olan lokusların MIRU 10,16 ve 40 olduğu belirlendi. Elde edilen verilerin ülkemizde görülen M. tuberculosis genotiplerinin ayrımını yapmak, yayılımını izlemek, koruyucu önlemlerin alınması ve tüberkülozun kontrolünü sağlamak açısından yararlı olacağı düşünülmektedir.;Mycobacterium tuberculosis, genotiplendirme, MIRU-VNTR.;Mycobacterium tuberculosis, genotyping, MIRU-VNTR.