Osteogenezis imperfektalı olgularda moleküler genetik etiyolojinin tüm ekzom dizi analizi ile aydınlatılması
Küçük Resim Yok
Tarih
2023
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Giriş: Osteogenezis imperfekta (Oİ), kemik kırılganlığına ve deformasyona neden olan benzer iskelet anomalilerini paylaşan fenotipik ve moleküler olarak heterojen bir herediter bağ dokusu bozuklukları grubudur. Oİ'den sorumlu bugüne kadar yaklaşık 17 gen tanımlanmıştır. Klinik olarak dört tipe ayrılmakla beraber yıllar içinde tanımlanan genlere paralel olarak alt tiplerin sayısı 19'a çıkmıştır. Tip I kollajeni kodlayan COL1A1 ve COL1A2 genlerindeki mutasyonlar etiyolojinin yaklaşık %70-80 kadarından sorumludur. Bu genler dışında Tip I kollajenin posttranslasyonel modifikasyonunda ve intrasellüler taşınmasında rol alan genler de hastalıktan sorumlu bulunmuştur. Bu çalışmada Oİ fenotipine sahip olan olgularda tüm ekzom dizi analizi ile moleküler genetik etiyolojinin araştırılması ve genotip-fenotip ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Osteogenezis imperfekta tanısıyla izlenen ve moleküler genetik nedeni bilinmeyen olgular çalışmaya alındı. Bütün hastaların klinik tiplendirilmeleri yapıldı. Demografik ve klinik özellikleri kaydedildi. İlk basamakta, her hastadan öncelikle hastalığın çoğundan sorumlu olan COL1A1 ve COL1A2 genlerindeki olası büyük intragenik delesyon/duplikasyonların tespit edilmesi amacıyla ekzom sekanslama öncesi MLPA analizi yapıldı. MLPA gerçekleştirilen ve delesyon/duplikasyon saptanmayan olgulara tüm ekzom sekanslama yapıldı. Saptanan varyantların patojeniteleri ACMG/AMP kriterleri doğrultusunda belirlendi. Bulgular: Çalışmaya alınan 8 olgunun %87.5'inde ailesinde akraba evliliği, %37.5'inde ise ailede benzer olgu öyküsü vardı. Klinik tiplerine göre olgular gruplandırıldığında; olguların 3'ü (%37.5) Tip I, 4'ü (%50) Tip III ve biri (%12.5) ise Tip IV olarak değerlendirildi. Olguların birinde (%12.5) P3H1 geninde 2 farklı varyant, birinde (%12.5) FKBP10 geninde, ikisinde (%25) ise WNT1 geninde varyant saptandı. Araştırılan tüm genlerde saptanan varyantların 2'si (%40) daha önce literatürde bildirilmemiş olup in-silico analiz programlarına göre hastalık yapıcı ve klinik olarak önemi bilinmeyen varyant olarak değerlendirildi. Dört (%50) olguda ise analiz yapılan genlerde hastalık yapıcı bir varyant saptanmadı. Herhangi bir gende varyant saptanmayan olgularda ileri genetik analizler devam etmektedir. Sonuç: Bu çalışma Oİ hastalığının klinik ve moleküler özelliklerini ortaya koyan bir araştırma olup tüm ekzom dizi analizi yöntemi ile 8 olgunun 4'ünde (%50) genetik etiyoloji belirlenmiştir.;Osteogenezis imperfekta; tüm ekzom dizi analizi, MLPA.;Osteogenesis imperfecta; whole exomegeneration sequence analysis; MLPA.
Açıklama
Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları A.B.D. Araştırma Projesi
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.
Araştırma Projesi elektronik ortamda bulunmaktadır.