Ekmeklik Buğday Yerel ve Ticari Çeşitleri ile İleri Islah Hatlarında Genoma Dayalı İlişkilendirme Çalışmaları (GWAS) ve İki Ebeveynli Haritalama Populasyonları Kullanılarak Sarı Pasın Fide ve Ergin Bitki Dayanıklılığının Fenotipik ve Moleküler Karakterizasyonu

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorTonk, Fatma Aykut
dc.contributor.authorNazarı, Kumarse
dc.contributor.authorTosun, Muzaffer
dc.date.accessioned2023-01-12T20:36:49Z
dc.date.available2023-01-12T20:36:49Z
dc.date.issued2020
dc.departmentN/A/Departmenten_US
dc.description.abstractSarı pas hastalıgı Puccinia striiformis Westend f. sp. tritici (Pst) fungusunun neden oldugu küresel bugday üretimi için önemli bir tehdittir. Dünya?daki bugday üretim alanlarının %88?inin sarı pasa hassas oldugu ve bu nedenle yıllık 5 milyon tondan fazla bugday kaybının oldugu düsünülmektedir. Dayanıklılık genlerinin kırılması, yeni ve saldırgan ırkların olusması sarı pasa karsı dayanıklılık çalısmalarını daha önemli ve sürekli kılmaktadır. Bu projede farklı ülkelerden orijinini alan yerel bugday çesitlerinden olusan bir iliskilendirme haritalama populasyonu ile iki ebeveynli katlanmıs haploid ve F2 populasyonları materyal olarak kullanılmıstır. Son yıllarda Dünya?da ve ülkemizde virülent olarak önemli kayıplara neden sarın pasın Yr27 ve Warrior ırklarının, belirtilen üç populasyonda fide ve ergin bitki dönemi testlemeleri Bölgesel Tahıl Pas Arastırma Merkezi bünyesinde gerçeklestirilmistir. Ayrıca üç populasyonun da Genotyping by Sequencing (GBS) metodu kullanılarak SNP genotiplemesi gerçeklestirilmistir. Iliskilendirme haritalama populasyonunda SNP markörleri ile Mixed Linear Model (MLM) kullanılarak GWAS analizi yapılmıstır. Katlanmıs haploid ve F2 haritalama populasyonlarında dayanıklılıkla iliskili QTL bölgelerinin saptanması için SNP markörleri Windows IciMapping v4.1 programında analiz edilmislerdir. F2 haritalama populasyonunda QTL analizleri sonucunda önemli bulunan 2A, 1B ve 2D kromozomları daha önce SNP analizi ile belirlenen iliskili bölgeyi daraltmak amacıyla SSR markörleri ile taranmıstır. Iliskilendirme haritalama populasyonunda toplam 152.000 adet SNP markörü belirlenmis ve bunlardan yüksek kalitedeki 25.169 SNP markörü GWAS analizinde kullanılmıstır. GWAS analizleri sonucunda ergin ve fide dayanıklılıgı ile önemli ölçüde iliskili 17 kromozom üzerinde toplam 40 SNP markörü tespit edilmistir. Fide dayanıklılıgı ile iliskili 3A ve 7D kromozomları üzerinde önemli olarak bulunan 2 genomik bölge (QYr.3A_seedling ve QYr.7D_seedling) yeni sarı pas dayanıklılık lokusları olarak belirlenmistir. Katlanmıs haploid populasyonunda SNP verilerinden ergin bitki dayanıklılıgı ile iliskili olarak toplam 6 QTL belirlenmistir. 3D ve 7D kromozomlarında belirlenen önemli iki genomik bölge önceden tanımlanan sarı pas dayanıklılık genlerinden ve QTL'lerinden uzakta haritalanmıs ve bu nedenle muhtemel yeni sarı pas dayanıklılık lokuslarını isaret etmistir. F2 populasyonunda SNP verilerinden ergin bitki dayanıklılıgı ile iliskili olarak altı farklı genomik bölgede (1B, 2A, 2B, 2D, 5A ve tanımlamayan kromozom) sekiz QTL önemli olarak belirlenmistir. Aynı populasyonda SSR analizleri sonucunda 2A kromozomu üzerinde ergin bitki dayanıklılıgı ile iliskili 2 QTL saptanmıstır.en_US
dc.identifier.endpage166en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.trdizinid622051en_US
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/622051
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11454/81446
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.publicationcategoryDiğeren_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectqtlen_US
dc.subjectssren_US
dc.subjectsnpen_US
dc.subjectgenotyping by sequencingen_US
dc.subjectgwasen_US
dc.subjectsarı pasen_US
dc.subjectbugdayen_US
dc.titleEkmeklik Buğday Yerel ve Ticari Çeşitleri ile İleri Islah Hatlarında Genoma Dayalı İlişkilendirme Çalışmaları (GWAS) ve İki Ebeveynli Haritalama Populasyonları Kullanılarak Sarı Pasın Fide ve Ergin Bitki Dayanıklılığının Fenotipik ve Moleküler Karakterizasyonuen_US
dc.typeProjecten_US

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu