Kuraklık stresi altında karnitin teşvikli proteinlerin tanımlanması
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2014
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Kuraklık, bitki büyümesini ve gelişimini düzenleyen, bitki üretimini sınırlayan ve bitki türlerinin doğal yayılışını belirleyen en önemli çevresel faktörlerden birisidir. Bitkinin kuraklık stresine karşı verdiği yanıtlardan biri de protein-protein etkileşimlerindeki değişimlerdir. Ozmotik dengeleme ajanları olarak bilinen ozmoprotektanların (ozmolitler, uyumlu bileşikler) stres koşullarının proteinler üzerinde denatüre edici etkilerine karşı hücre zarlarını ve proteinleri stabilize ettiği bilinmektedir. Karnitinin hayvan hücrelerinde enerji metabolizması, stres toleransı ve detoksifikasyon gibi temel biyolojik süreçlerde yer aldığı bilinen, buna ek olarak bakterilerde de bir 'uyumlu bileşik' olarak yüksek seviyelerde biriktirilip soğuk veya tuzla indüklenen ozmotik stresle başa çıkmak için ozmolit olarak rol oynadığı bilinmektedir. Bitkilerde ise şu ana kadar bilinenler karnitinin yağ asidi metabolizması ile alakalı olduğudur ve bitkiye stres koşullarındaki etkisi aydınlatılmamıştır. Arabidopsis'de normal karnitin içeriğinin mikromolar konsantrasyonda olduğu bilinmesiyle birlikte ekzojen uygulamayla milimolar düzeyde konsantrasyonlarda biriktirilebildiği ve prolin ile benzer görev alıp ozmolit ve/veya antioksidan özellikler gösterebileceği önerilmiştir. Bitkiler aleminde prolin ve glisin betainde olduğu gibi karnitin akümülatörlerinin varlığı ihtimal dahilindedir. Bu çalışmada Arabidopsis thaliana'nın yaban tip columbia (col-0) ekotipi kullanılarak kuraklığa ve karnitin uygulamasına bağlı protein profili değişiminin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bağıl büyüme hızı, bağıl su içeriği, lipit peroksidasyonu ve H2O2 içeriği ile bitkide PEG kaynaklı kuraklık etmeninin ve ozmoprotektan olduğu düşünülen karnitinin oluşturduğu fizyolojik ve biyokimyasal değişimler tespit edilmiştir. Protein esaslı doğal stres tolerans mekanizmalarını keşfetmek amacıyla 2 gün boyunca PEG'e maruz bırakılan bitkilerden total proteinler elde edilmiştir. İki boyutlu poliakrilamit jel elektroforezinden oluĢan proteomik uygulamasıyla belirli spotlar referans alınarak protein ifade farklılıkları tespit edilmiştir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Arabidopsis thaliana, Kuraklık Stresi, Ozmolit, Karnitin, PEG, İki boyutlu jel elektroforezi., Arabidopsis thaliana, Drought Stress, Osmolyte, Carnitine, PEG, Two-dimensional gel electrophoresis., Biyoloji A.B.D.
