Denizel funguslardan biyoaktif metabolit üretimi
Yükleniyor...
Tarih
2011
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Ege Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Genel olarak, sekonder metabolitler büyük oranda keşfedilmemiş olsa da bugün piyasada bulunan farmasötik bileşiklerin %40’dan fazlasının kaynağı bilinmektedir. Mikroorganizmalara gelince (ekstremofiller dahil), izolasyon ve kültivasyon metotlarındaki sınırlamalardan dolayı var olduğu düşünülen milyon mikroorganizma türünün sadece %2’si tanımlanabilmiştir. Artan hastane enfeksiyonları ve mikroorganizmaların hızla antibiyotik dirençliliği kazanmasından dolayı, daha etkili ve yeni antibiyotiklere ihtiyaç duyulmaktadır. Dünya yüzeyinin %70’ini kaplayan okyanuslar, biyoçeşitliliğinin büyük bir kısmını içermesine rağmen, sahip olduğu mikrobiyal çeşitliliğin büyük bir kısmı henüz keşfedilmemiştir. Denizel ortamlardaki ekstrem basınç, tuzluluk ve sıcaklık gibi koşullardan dolayı, karasal türlerinden farklı olarak, bu çevrelerde yaşamaya adapte olmuş canlılar, bilinen metabolitlerden farklı veya daha etkili biyoaktif metabolit üretme yeteneğindedir. Bu yüzden, denizel çevrelerden izole edilecek fungus örneklerinin biyoaktif metabolitleri önem kazanmaktadır. Bu çalışmada, çeşitli yöntemler kullanılarak Ege ve Akdeniz Bölgesi’nden toplanan farklı sünger ve sediment örneklerinden denizel türevli fungus izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Toplamda 118 denizel türevli fungus izolatı elde edilmiştir. Çalışma kapsamında izole edilen bütün izolatların biyoaktiviteleri, antibiyotik dirençli 5 test organizmasına karşı (E. coli O157H7: streptomisin, sülfisoksazol, ve tetrasiklin dirençli; S. aureus RSKK 95047: metisillin dirençli; E. faecium DSM 13590: vankomisin dirençli; C. albicans DSM 5817; P. aureginosa ATCC 27853) disk difüzyon metodu kullanılarak saptanmıştır. 118 izolattan 15’inin (%12,71) en az bir test organizmasına karşı aktivite gösterdiği tespit edilmiştir. Bu araştırmada ayrıca, yüksek aktivite gösteren 3 izolatın (06ÇK003, 08SK002 ve 08SK015) büyük çaplı fermentasyonu tamamlanmış ve izolatların tanısı, fenotipik karakteristikleri ve 5.8S-ITS bölgeleri ya da 18S rDNA bölgelerinin PCR amplifikasyonuyla genus ve tür seviyesinde gerçekleştirilmiştir. Fenotipik ve genotipik tanımlama çalışmaları sonucunda, 06ÇK003 kodlu izolat Aspergillus flavus türü olarak tanımlanmış ve diğer iki izolatın tür düzeyinde tanımlama çalışmaları devam etmektedir. Bununla birlikte, 06ÇK003 kodlu izolattan biyoaktivite temelli metabolit izolasyonu çalışmaları sonucunda antimikrobiyal aktivite gösteren 2 adet molekül elde edilmiştir. Literatür araştırmaları sonucunda, bu 2 molekülün, 2008 yılında Lin ve arkadaşları tarafından yapılan bir çalışmada tanımlanmış olduğu saptanmıştır. Ancak, bizim çalışmamız bu moleküllerin antimikrobiyal aktiviteleri üzerine bilinen ilk çalışmadır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Denizel türevli fungus, sekonder metabolit, Aspergillus flavus., Marine-derived fungi, secondary metabolites, Aspergillus flavus., Biyoloji A.B.D.
