Mycobacterium tuberculosis izolatlarında rifampin direncinin RNA/RNA uyumsuz birleşme (Mismatch) yöntemi ile saptanması
Küçük Resim Yok
Tarih
2003
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Rifampin en potent antitüberküloz ilaçlardan biridir. Bu nedenle rifampin direnci yüksek oranda klinik tekrarlara neden olmaktadır. Rifampin direncinin saptanması çoğu kez çoğul ilaç direncinin de bir göstergesidir. Son yıllarda rpoB genindeki mutasyonlarm saptanması yoluyla rifampin direncini belirleyen çeşitli moleküler yöntemler geliştirilmiştir. Sunulan çalışmada ağar proporsiyon yöntemi ile rifampine dirençli olarak saptanan 20 Mycobacterium tuberculosis izolatında rpoB genindeki mutasyonlarm saptanmasında RNA/RNA uyumsuz birleşme (mismatch) yönteminin performansının değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu yöntemle, 20 M.tuberculosis izolatının 16'sında (%80) rpoB geninde mutasyon saptanırken, dördünde direnci gösteren bant paternleri saptanamamıştır. RNA/RNA uyumsuz birleşme yöntemi, DNA dizi analizi ve diğer moleküler yöntemlerden daha ucuz olmasına karşın bazı durumlarda sonuçların değerlendirilmesi güçtür. Sonuç olarak, optimize edilmesi koşuluyla RNA/RNA uyumsuz birleşme yöntemi rutin uygulamada hızlı rifampin direnci saptanması amacıyla kullanılabilir.
Rifampin is one of the most potent antituberculosis drugs and therefore, rifampin resistance leads to high clinical relapse rates. Detection of rifampin resistance could be an indication of multidrug resistance. in the recent years several molecular methods have been developed to evaluate the mutations in rpoB gene for the detection of rifampin resistance. the aim of the present study was to evaluate the performance of the RNA/RNA Mismatch Assay for detection of the mutations in the rpoB gene in 20 M.tuberculosis isolates which were determined as resistant to rifampin by ağar proportion method. While RNA/RNA Mismatch Assay detected the mutations in the rpoB region in 16 of 20 (80%) M.tuberculosis isolates, the remaining four isolates yielded no band pattern indicating resistance. However, there may be situations where interpretation of the results is difficult in RNA/RNA Mismatch Assay which is already cheaper than DNA seguencing and other molecular methods. in conclusion, if the RNA/RNA Mismatch Assay can be optimized, it can be used for the rapid detection of rifampin resistance.
Rifampin is one of the most potent antituberculosis drugs and therefore, rifampin resistance leads to high clinical relapse rates. Detection of rifampin resistance could be an indication of multidrug resistance. in the recent years several molecular methods have been developed to evaluate the mutations in rpoB gene for the detection of rifampin resistance. the aim of the present study was to evaluate the performance of the RNA/RNA Mismatch Assay for detection of the mutations in the rpoB gene in 20 M.tuberculosis isolates which were determined as resistant to rifampin by ağar proportion method. While RNA/RNA Mismatch Assay detected the mutations in the rpoB region in 16 of 20 (80%) M.tuberculosis isolates, the remaining four isolates yielded no band pattern indicating resistance. However, there may be situations where interpretation of the results is difficult in RNA/RNA Mismatch Assay which is already cheaper than DNA seguencing and other molecular methods. in conclusion, if the RNA/RNA Mismatch Assay can be optimized, it can be used for the rapid detection of rifampin resistance.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Mikrobiyoloji
Kaynak
Mikrobiyoloji Bülteni
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
37
Sayı
1
